产甲烷条件下岩溶湿地沉积物中古菌群落的变化规律

论文摘要

【背景】桂林会仙湿地位于喀斯特峰丛洼地和峰丛平原的过渡区,主要由岩溶地下河补给,水质呈现富钙偏碱特征,是一处典型的岩溶湿地环境,湿地沉积物以厌氧环境为主,独特的环境特征使之成为研究新型厌氧微生物的理想场所。氢型产甲烷菌和乙酸型产甲烷菌是环境中有机质厌氧降解的重要参与者,但目前会仙湿地产甲烷菌生理生态功能的研究十分有限。【目的】揭示乙酸盐营养型产甲烷条件和氢气营养型产甲烷条件下岩溶湿地环境古菌群落结构的变化规律和产甲烷菌的主要类群,探讨岩溶环境古菌的功能和相互关系。【方法】以会仙岩溶湿地沉积物为研究材料,分别以乙酸盐和氢气为唯一能源物进行富集培养,结合未添加任何能源底物的对照处理,动态监测产甲烷通量,分别构建了3个共包含146条古菌16S rRNA基因全长序列的文库,以及3个共包含138条甲基辅酶M还原酶基因mcr A基因序列的文库,通过构建系统发育树比较分析不同产甲烷底物培养条件下典型岩溶湿地古菌群落的变化规律。【结果】从乙酸型和氢型产甲烷条件培养物顶空气中都检测到了几乎等浓度的甲烷产生,甲烷八叠球菌是mcr A文库中主要的古菌类群,其中包含了Methanosarcina属古菌、Zoige Cluster I （ZC-I）和ANME-2d Cluster （AD）类群古菌,以及两个相对独立且不包含任何参考序列的分支KT-I和KT-II,可能代表产甲烷菌的新类群;经过两种产甲烷条件的富集培养后,ZC-I、AD和KT-II类群古菌的序列数占比有较为显著的增加（45%–155%）;深古菌（Bathyarchaeota）是所有古菌16Sr RNA基因文库的优势类群,序列占比为88%–100%,其中MCG-11亚群最为丰富,占所有深古菌的84%,并且在乙酸盐产甲烷条件下增加了17%。【结论】会仙湿地沉积物中蕴涵着丰富的新型古菌序列,沉积物中主要的氢型产甲烷菌和乙酸型产甲烷菌都来自甲烷八叠球菌目,深古菌在岩溶环境和乙酸型产甲烷条件下可能都发挥着重要的作用。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 主要试剂和仪器
•   1.2 培养基
•   1.3 样品采集和地化参数的测定
•   1.4 富集培养及产甲烷作用观测
•   1.5 DNA提取和基因文库构建
•   1.6 序列处理和文库多样性分析
•   1.7 文库多样性分析和系统进化分析
• 2 结果与分析
•   2.1 样品描述及产甲烷作用的观测
•   2.2 基因文库的概况
•   2.3 产甲烷菌mcr A基因文库物种组成分析
•   2.4 产甲烷条件下古菌16S rRNA基因序列文库物种组成分析
• 3 讨论
•   3.1 岩溶环境氢型产甲烷菌和乙酸型产甲烷菌的主要类群
•   3.2 甲烷八叠球菌目古菌的主要类型及代谢潜能
•   3.3 产甲烷条件下深古菌的群落组成、代谢方式及与产甲烷菌的相互关系
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 吴麒,陈颖,邱凯瑞,罗倩倩

关键词: 产甲烷菌,岩溶,湿地

来源: 微生物学通报 2019年12期

年度: 2019

分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

专业: 生物学,环境科学与资源利用

单位: 桂林医学院生物化学与分子生物学教研室

基金: 国家自然科学基金(41662019),广西自然科学基金(2016JJB130197)~~

分类号: X172;Q938

DOI: 10.13344/j.microbiol.china.190049

页码: 3193-3204

总页数: 12

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