引进驯鹿种群的遗传结构及其多样性分析

论文摘要

驯鹿（Rangifr tarandus）是一种寒带动物,广泛分布于环北极圈地带。在我国,驯鹿分布于大兴安岭西北部,由鄂温克猎民所驯养。驯鹿是鄂温克民族使鹿部落文化的重要载体,也是根河旅游产业的重要品牌,具有较高的经济价值和极其重要的生态价值。由于人类活动的干扰,长期的近亲繁殖,粗放式的饲养管理,兽害及疾病的发生等,使种群数量一直徘徊在600头左右,因此我国驯鹿的生存状况与环境极其堪忧。针对此严峻状况,基于恢复和改善我国驯鹿种群的考虑,根河林业局在内蒙古自治区重大科技支撑项目的支持下,于2017年2月和2018年2月从芬兰引进驯鹿种群,旨在通过引进来改良国内驯鹿遗传品质,丰富群体遗传多样性,从根本上摆脱我国驯鹿种群的濒危状况。但由于引进驯鹿没有系谱,亲缘关系、群体遗传结构与多样性也不清楚。因此,为了全面的科学评价所引进驯鹿种群的遗传结构及其多样性,本研究利用线粒体DNA D-Loop序列以及微卫星技术分析了 129头引进驯鹿种群的遗传结构和遗传多样性,为今后合理利用所引进的驯鹿种群资源提供了科学参考,研究结果如下:1.从19个微卫星位点中筛选出14个扩增效果良好且高度多态的位点,共检测出128个等位基因,平均等位基因数为9.1429,平均观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）分别为0.4833和0.7121。在14个微卫星位点中有9个显著偏离Hardy-Weinberg（H-W）平衡,Ewens-Watterson中性检验显示所有位点的观测F值均在95%置信区间内且都大于0,均属于中性位点;2.测序得到引进驯鹿种群含473个核苷酸的线粒体DNA D-Loop序列,其核苷酸多样度（Pi）为0.01022,平均核苷酸差异数（k）为4.834。引进驯鹿种群中共存在9种单倍型,单倍型（基因）多样度（Hd）为0.611;3.通过邻接法（NJ）对引进驯鹿种群构建系统发育树发现,该种群个体间遗传距离分布范围在0-0.03之间,平均遗传距离为0.011。引进驯鹿种群总共聚为三个分支,c支个体数最多,其中2017年引进的29只个体中绝大多数聚在了 c分支;4.通过与现有国内驯鹿种群对比发现,引进驯鹿种群和中国驯鹿种群的进化关系较远,引进驯鹿种群的平均等位基因数和单倍型多样度（n=9.1;Hd=0.611）要高于国内驯鹿种群（n=7.7;Hd=0.468）,但其多态信息含量（PIC=0.675）略低于国内驯鹿种群（PIC0.701）。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 绪论
•   1.1 驯鹿概况
•     1.1.1 中国驯鹿种群概况
•     1.1.2 驯鹿保护遗传学研究
•   1.2 微卫星遗传标记研究概述
•     1.2.1 微卫星DNA简介
•     1.2.2 微卫星DNA的特点
•     1.2.3 微卫星DNA的分离方法
•     1.2.4 微卫星DNA在遗传分化中的应用
•   1.3 线粒体DNA遗传标记概述
•     1.3.1 线粒体DNA（mitochondria DNA）简介
•     1.3.2 线粒体DNA的遗传特点
•     1.3.3 线粒体DNA D-Loop序列的遗传特点
•     1.3.4 利用线粒体DNA研究的方法
•     1.3.5 线粒体DNA在动物分子进化中的研究
•   1.4 本研究的目的与意义
• 2 材料与方法
•   2.1 实验材料
•     2.1.1 实验样品
•     2.1.2 主要的实验试剂
•     2.1.3 主要的实验仪器
•   2.2 实验方法
•     2.2.1 样品采集
•     2.2.2 DNA的提取及检测
•     2.2.3 微卫星引物的筛选及扩增
•     2.2.4 mtDNA D-Loop序列引物及PCR扩增
•     2.2.5 统计分析
• 3 实验结果
•   3.1 DNA的提取
•   3.2 微卫星位点的筛选
•   3.3 引进驯鹿种群遗传多样性分析
•     3.3.1 微卫星位点上的等位基因分布
•     3.3.2 种群线粒体DNA D-Loop序列文本的测定
•     3.3.3 群体遗传多样性参数的计算
•     3.3.4 多态位点及单核苷酸连锁不平衡
•     3.3.5 单倍型及频率
•     3.3.6 群体有效种群大小
•     3.3.7 群体Hardy-Weinberg平衡及中性检验
•     3.3.8 引进驯鹿种群个体间的遗传距离
•   3.4 引进驯鹿种群与中国种群遗传多样性的比较
• 4 讨论
•   4.1 样品的采集
•   4.2 DNA提取及微卫星位点的选择
•   4.3 引进驯鹿种群的遗传变异分析
•   4.4 引进驯鹿种群的遗传结构
•   4.5 驯鹿引进种群与中国种群的遗传结构差异
•   4.6 对引进驯鹿种群管理的建议
• 结论
• 参考文献
• 附录
• 攻读学位期间发表的学术论文
• 致谢
• 硕士学位论文修改情况确认表

文章来源

类型: 硕士论文

作者: 韩磊

导师: 李和平

关键词: 驯鹿,遗传多样性,微卫星,线粒体序列

来源: 东北林业大学

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学,生物学

单位: 东北林业大学

分类号: Q953

DOI: 10.27009/d.cnki.gdblu.2019.000490

总页数: 64

文件大小: 5097K

下载量: 61