导读:本文包含了日本凋毛藻论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:日本,序列,红藻,基因,蛋白,标记,南极。
日本凋毛藻论文文献综述
刘晨临,黄晓航,LEE,Yookyung,LEE,Hungkum,李光友[1]（2006）在《日本凋毛藻碳酸酐酶基因及其编码的蛋白特征》一文中研究指出1引言碳酸酐酶CA(EC 4·2·1·1)是含锌原子的金属蛋白酶,该酶的基本功能是催化CO2与HCO3-间的相互转换[1].该反应在许多生物过程中都发挥着重要的作用,例如离子交换、呼吸作用、pH稳定性、捕获CO2和光合作用等[2~5].CA广泛分布于各种(本文来源于《海洋学报(中文版)》期刊2006年03期）
刘晨临,黄晓航,Lee,Yookyung,李光友[2]（2005）在《日本凋毛藻Griffithsia japonica的硫氧还蛋白研究》一文中研究指出硫氧还蛋白(thioredoxin TRX)是分子量小(大约12kDa),通常热稳定性极高的一类蛋白。所有的硫氧还蛋白都带有一个保守的活性位点,序列为WCGPC。所有已知的结构证据都表明,活性位点处的两个半胱氨酸残基的硫原子在氧化状态下,以二硫键的形式存在(Laloi et al.2001:Stein et al.1995)。硫氧还蛋白是由多基因编码的,几乎在所有生物体中,都有多个不同结构硫氧还蛋白异构体存在。基因组学和EST研究的结果表明,拟南芥中有17个TRX的异构体,衣藻中也发现了8个TRX异构体(Lemaire et al.2003)。生物体中硫氧还蛋白表达和功能的多样性与其种类的多样性密切相关。植物和藻类中某些硫氧还蛋白在线粒体(称为TRX o)和细胞质(称为TRX h)中特异性地表达,还有一些在叶绿体中特异性地表达(根据最早发现其作用的靶酶分别称为TRX m和TRX f)(Laloi et al.2001)。细胞质中的TRXh起着重金属解毒,缓解氧胁迫以及调节转录因子等作用,而线粒体中的TRXo则可能起着(本文来源于《中国海洋生化学术会议论文荟萃集》期刊2005-05-01）
刘晨临,黄晓航,LEE,Yookyung,LEE,Hungkum,李光友[3]（2005）在《日本凋毛藻(Griffithsiajaponica)硫氧还蛋白基因及其编码的蛋白特征》一文中研究指出从日本凋毛藻的表达序列标记 EST库中筛选到 2 条全长的编码硫氧还蛋白的 cDNA序列,分别命名为GjTRX1和GjTRX2。将这2条基因编码的蛋白序列与其它藻类(包括酵母)进行比较,结果表明不同物种及同一物种间TRX的相似性都较差,除GjTRX2编码的蛋白序列外,所有蛋白在活性位点序列 WCGPC处都完全保守。推测GjTRX1属于细胞质内分布的硫氧还蛋白。GjTRX1序列推导的蛋白二级结构单元与以往报道的传统上保守的TRX的二级结构单元类型一致,但是顺序有所不同。(本文来源于《海洋科学进展》期刊2005年01期）
刘晨临[4]（2004）在《日本凋毛藻表达序列标记及南极衣藻分子系统学研究》一文中研究指出表达序列标记和分子系统学分析，都隶属于生物信息学研究的范畴。生物信息学技术应用于海洋藻类的研究，对在更深层次上认识藻类本身、解释其起源和遗传进化的本质具有重要意义。关于日本凋毛藻和南极衣藻分子学的研究在国内尚未见报道。本论文应用生物信息学手段对日本凋毛藻进行了表达序列标记和对南极冰藻的分子进化进行研究，以期为下一步研究打下扎实的理论基础，并开拓更广泛的研究领域。 1 日本凋毛藻表达序列标记分析及几种基因特征 海洋红藻日本凋毛藻(Griffithsia japonica)是一种很好的基础理论研究实验材料。为了更好地了解其遗传学特征和克隆到更多的功能基因，本研究构建了它的cDNA文库，随机筛选了512个克隆，进行了表达序列标记(EST)分析。分析包含了465个序列，其中176个EST(38％)序列与公共数据库中的已知序列具有相似性；14个EST(3％)能够在数据库中找到相似序列，但是序列功能未知；275个ESTs(59％)是全新的序列。已知的EST序列根据功能被分成7组：代谢(29％)、蛋白合成和降解(26％)、光合作用(14％)、转录(14％)、信号传导和膜转运(9％)、细胞结构和分化(4％)以及细胞的胁迫反应(4％)。分析密码子的偏倚性，发现日本凋毛藻的密码子偏倚性与掌状海带Laminaria digitata的完全一致。 在本论文中，我们从已知的EST序列中，选择几条有代表性的和有一定意义的基因序列，包括：捕光蛋白基因、硫氧还蛋白基因、碳酸酐酶基因、遍在蛋白以及遍在蛋白连接酶基因，采用生物系统学的方法，进行基因结构和蛋白质结构分析，分子系统学研究和与其它物种序列的比较等项研究，为下一步进行基因的功能研究奠定基础。 从日本凋毛藻的EST文库中得到6条不同的捕光蛋白(light-harvesting protein，LHC)基因序列。其中3条编码全序列。明确了3条全序列LHC信号肽与成熟多肽的分割位点，以及3条成熟多肽序列的长度、分子量、等电点和疏水性。通过比较6条日本凋毛藻的LHC与其它藻类的LHC序列，发现3个跨膜区域的保守性较高，明确至少有6个叶绿素分子与GjLHC跨膜螺旋上的保守残日本凋毛藻表达序列标记及南极衣藻分子系统学研究基相结合。同时还研究了真核捕光蛋白的系统发生学。叶绿素“芍和叶绿素眺结合的LHC蛋白部分成两大部分。叶绿素。心结合的LHC分枝中主要包括绿藻和绿色植物，而不包含其它杂色藻。叶绿素必分支中，日本凋毛藻的6条LHC蛋白序列并没有聚类在一起，同时其它杂色藻，例如硅藻、褐藻、隐藻等的不同类型的LHC也没有聚类在一起。 分离了1条日本凋毛藻的硫氧还蛋白(thioredoxin，TRX)基因，发现它与其它藻类TRX基因的相似性都较低，只有活性位点处WCGPC完全一致。推测GjTRXI属于细胞质内分布的硫氧还蛋白。编码的TRX蛋白有153个氨基酸。ojTRXI cDNA序列推导出多肤的二级结构单元，与以往报道的传统上保守的TRX的二级结构单元类型相一致，但是顺序有很所不同。 克隆到2条碳酸配酶(carbon allllydrase，cA)cDNA，命名为GjCAI和GjcAZ，分别属于a一CA和p一CA。GjcAI编码289个氨基酸的完整序列;GjcAZ编码的192个氨基酸包含了大部分的CA序列。将GjCAI与其它物种的CA酶序列比较，3个与Zn结合的组氨酸活性位点处高度保守。a一CA酶系统树中，日本凋毛藻的a一cA酶同海带、衣藻等藻类分支聚类。GjcAZ与其它物种的p一CA的多肤序列比对，序列中与Zn原子结合的或相向的氨基酸位点的保守性极高。在p一CA酶的系统树中，植物聚类在一起;藻类除衣藻和日本凋毛藻外都聚类在一起，日本凋毛藻与这些植物和藻类分支以65%的自举值聚类。 克隆到2个多聚遍在蛋白(ubiquitin，Ub)基因，分别命名为GjUbl和GjUbZ。GjUbl编码一个由3个Ub单体构成的多聚遍在蛋白，每个单体由76个氨基酸组成。GjubZ包含2个单体。单体的结构与从其它红藻中分离到的多聚Ub的单体结构完全一致。同时还分离到一条Ub结合酶(E2)cDNA序列GjUbol，编码147个氨基酸的Ub结合酶完整序列。是目前报道的在红藻中发现的唯一的Ub结合酶基因。与不同物种中的EZ酶序列进行比较，GjUbol与酵母EZ的相似性最高，为87%;与果蝇和人类中该类型的Ub结合酶的相似性也很高，这是一类普遍存在的高度保守的Ub结合酶。 通过分析日本凋毛藻中的以上这5种基因，进一步表明EST技术在筛选新功能基因中的强大功效。在此基础上，进行基因的功能研究，可以更深入和广泛地掌握该物种的遗传学和生理生化等特性。2南极冰藻分子系统学研究 严酷的极地环境造就了生活在这种极端海冰环境中的南极冰藻独特的生物学特性。研究南极冰藻的分类学地位，确立其在分子系统学中与其它藻类的亲缘关系和进化地位，不仅是今后开展南极冰藻研究和利用必不可少的基础性工作，而且其本身也是很有意义的一项研究课题。日本凋毛藻表达序列标记及南极衣藻分子系统学研究 本研究从形态学和分子水平上研究2株南极冰藻ICE一L和ICE一W的分类系统学特征。形态观察表明2株冰藻都属于衣藻(Chla柳domonas)，它们在形态上没有明显不同。同时以185 rDNA，thcL和rrS3种分子标记进行分子系统?(本文来源于《中国海洋大学》期刊2004-06-10）
日本凋毛藻论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
硫氧还蛋白(thioredoxin TRX)是分子量小(大约12kDa),通常热稳定性极高的一类蛋白。所有的硫氧还蛋白都带有一个保守的活性位点,序列为WCGPC。所有已知的结构证据都表明,活性位点处的两个半胱氨酸残基的硫原子在氧化状态下,以二硫键的形式存在(Laloi et al.2001:Stein et al.1995)。硫氧还蛋白是由多基因编码的,几乎在所有生物体中,都有多个不同结构硫氧还蛋白异构体存在。基因组学和EST研究的结果表明,拟南芥中有17个TRX的异构体,衣藻中也发现了8个TRX异构体(Lemaire et al.2003)。生物体中硫氧还蛋白表达和功能的多样性与其种类的多样性密切相关。植物和藻类中某些硫氧还蛋白在线粒体(称为TRX o)和细胞质(称为TRX h)中特异性地表达,还有一些在叶绿体中特异性地表达(根据最早发现其作用的靶酶分别称为TRX m和TRX f)(Laloi et al.2001)。细胞质中的TRXh起着重金属解毒,缓解氧胁迫以及调节转录因子等作用,而线粒体中的TRXo则可能起着
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
日本凋毛藻论文参考文献
[1].刘晨临,黄晓航,LEE,Yookyung,LEE,Hungkum,李光友.日本凋毛藻碳酸酐酶基因及其编码的蛋白特征[J].海洋学报(中文版).2006
[2].刘晨临,黄晓航,Lee,Yookyung,李光友.日本凋毛藻Griffithsiajaponica的硫氧还蛋白研究[C].中国海洋生化学术会议论文荟萃集.2005
[3].刘晨临,黄晓航,LEE,Yookyung,LEE,Hungkum,李光友.日本凋毛藻(Griffithsiajaponica)硫氧还蛋白基因及其编码的蛋白特征[J].海洋科学进展.2005
[4].刘晨临.日本凋毛藻表达序列标记及南极衣藻分子系统学研究[D].中国海洋大学.2004
论文知识图
