导读:本文包含了差异表达论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:荀子,细胞,基因芯片,差异,地鼠,多态性,转录。
差异表达论文文献综述
王晓娇,蒙美莲,曹春梅,逯春杏,许飞[1]（2019）在《水分胁迫下马铃薯萌芽出苗期根系转录组差异表达分析》一文中研究指出以马铃薯‘克新1号’为材料,通过Illumina HiSeqTM 4000高通量测序技术,对不同水分胁迫后的马铃薯萌芽出苗期根系cDNA文库进行了RNA-Seq分析,拟探明马铃薯感应水分胁迫的分子机制,挖掘出与抗旱密切相关的功能基因.将比对到基因组上的基因利用RPKM衡量各样本间的基因表达丰度,以P<0.05筛选出差异表达基因,通过GO (基因本体,gene ontology)数据库、KEGG代谢途径数据库,对不同水分胁迫样本差异表达基因的功能和参与的调控路径进行分析;选择6个差异表达基因,利用实时荧光定量PCR验证RNASeq结果的可靠性.结果表明:(1)DLWR(重度水分胁迫)样本中,比对到基因组的表达基因30 114 133个,差异表达基因5 241个;LWR(中度水分胁迫)样本中,比对到基因组的表达基因32 858 890个,差异表达基因1 488个.2个样本中同时存在的差异基因369个,其中上调表达基因78个,下调表达基因291个;显着差异表达基因主要与蛋白激酶、水解酶、氧化还原酶、水通道蛋白、转运蛋白、转录因子等相关.(2)在GO富集分析中,2个水分胁迫处理样本在生物学功能中富集的类别并不完全相同,但显着富集的主要是与氧化还原、转运、膜结合、转录调节子等相关的基因.(3)KEGG代谢分析显示,差异表达基因显着富集在谷胱甘肽代谢、植物激素信号转导等途径,与植物抗逆能力密切相关.(4)利用qRT-PCR验证的6个基因表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实了RNA-Seq结果的可靠性.通过研究得到了不同水分胁迫下马铃薯根系转录组信息,获得了差异基因及其功能信息,阐明了差异基因所参与的代谢通路及与植物水分胁迫的关系.(本文来源于《东北师大学报(自然科学版)》期刊2019年04期）
潘虹,陈蓓丽,李腾龑,马旭[2]（2019）在《miR-449b多态性位点rs10061133差异调控LHCGR表达》一文中研究指出目的探究miR-449b多态性位点rs10061133 A>G在卵巢功能不全(POI)中的可能作用机制。方法生物信息学预测可能与POI相关的miR-449b潜在靶基因。双荧光素酶检测LHCGR是否为miR-449b的靶基因以及miR-449b rs10061133不同基因型对LHCGR表达调控的影响。结果生物信息学预测LHCGR为miR-449b的潜在靶基因,双荧光素酶测定证实LHCGR是miR-449b的靶基因。与GG基因型相比,rs10061133 AA基因型显着减弱LHCGR 3’UTR的荧光素酶活性。结论 LHCGR为miR-449b的靶基因,多态性位点rs10061133 A>G可能通过差异调控LHCGR表达在POI的发生发展中发挥作用。(本文来源于《生殖医学杂志》期刊2019年12期）
孙婷婷,刘增才,王世新,王旭彤,邹莉[3]（2019）在《桑黄HMGS基因克隆、分子特性及差异表达分析》一文中研究指出目的对参与桑黄叁萜合成途径的关键酶羟甲基戊二酰辅酶A合酶(3-hydroxy-3-methylglutaryCoAsynthase,HMGS)进行基因全长克隆、分子特性及差异表达分析研究。方法采用RACE技术克隆HMGS基因全长,并对其序列进行生物信息学分析;构建桑黄HMGS基因到表达载体pET-32a (+)上,转化大肠杆菌BL21 (DE3),IPTG诱导表达后SDS-PAGE检测;用荧光定量PCR的方法分析其不同发育阶段表达特性。结果 HMGS基因cDNA全长为1 930 bp,包含1个1 458 bp的完整开放阅读框,编码485个氨基酸。该基因编码蛋白的相对分子质量约为52 750,理论等电点是5.60,为亲水性蛋白,不具有跨膜结构,不含信号肽序列;系统发育分析表明,桑黄HMGS与地中海拟层孔菌Fomitiporia mediterranea中的HMGS同源性最高,属于一个分支。SDS-PAGE结果显示该蛋白的大小与预测的蛋白相对分子质量基本一致。HMGS基因的转录水平在桑黄不同发育阶段呈动态变化,该基因在菌丝体阶段的转录水平要高于原基及子实体阶段的转录水平。HMGS基因的最高转录水平出现在第14天,为对照第5天的2.33倍。结论 HMGS基因的分子鉴定为进一步解析该基因在桑黄叁萜类物质合成代谢途径中的分子调控作用奠定基础。(本文来源于《中草药》期刊2019年23期）
王言,顾以韧,杨雪梅,梁艳,杨跃奎[4]（2019）在《不同猪种背最长肌中miR-23a、miR-151、miR-299、miR-199a和miR-497的差异表达研究》一文中研究指出为研究miRNA表达量与肉质风味的相关性,试验采用荧光定量PCR技术(Q-PCR)检测了4个猪种背最长肌中miR-23a、miR-151、miR-299、miR-199a和miR-497的差异表达。结果表明,miR-23a、miR-151在藏猪背最长肌中表达最高,miR-299、miR-199a和miR-497在约克夏猪背最长肌中表达最高;相关性分析显示,miR-23a、mi R-151在背最长肌中的表达水平与肌内脂肪含量和硫胺素含量呈正相关,与肌纤维面积、眼肌面积和瘦肉率呈负相关,miR-299、miR-199a和miR-497在背最长肌中的表达水平与肌内脂肪含量和硫胺素含量呈负相关,与肌纤维面积、眼肌面积和瘦肉率呈正相关。综上表明,miR-23a、miR-151对猪肉品质具有正调控作用,miR-299、miR-199a和miR-497对猪胴体品质具有正调控作用。(本文来源于《养猪》期刊2019年06期）
朱雨捷,朱湘玉,顾雷雷,张颖,倪梦瑶[5]（2019）在《法洛四联症microRNA差异表达谱与临床胎儿基因芯片结果的功能及通路分析》一文中研究指出目的对法洛四联症胎儿组织差异microRNAs(miRNAs)表达谱进行生物信息学分析,并和我院临床胎儿基因芯片结果进行比对,以期从整体水平揭示miRNAs在法洛四联症中的作用。方法我们从GeneExpressionOmnibus(GEO)数据库上搜索法洛四联症相关的miRNA数据集(GSE35490),并基于R语言limma包筛选特异性miRNAs(P值<0.05,|log2Fold Change(FC)|值>1),利用计算方法预测这些miRNAs作用的靶基因与我院27例法洛四联症胎儿的基因芯片数据进行比较取靶基因交集,将这些靶点在通路数据库中进行富集统计分析。结果数据集筛选出29个差异的miRNAs,和基因芯片的交集筛选出2841个靶基因,最终富集出可能和法洛四联症相关的20条GO功能和11条反应通路。结论法洛四联症是一个复杂疾病,尽管不同的miRNA功能和作用机制不同,在通路层次上我们可以系统地注解它们的功能和作用。(本文来源于《中国优生与遗传杂志》期刊2019年11期）
梁涛[6]（2019）在《《荀子·性恶》篇“伪”的多重含义及特殊表达——兼论荀子“圣凡差异说”与“人性平等说”的矛盾》一文中研究指出荀子的伪并非传统上理解的作为,而是与心密切相关的概念,指"心之为",指心的思虑、认知及行为。荀子人性论并非性恶说,而是性恶心善说。《正名》篇对伪做了两层定义,包括心之运用义与成就义,这是伪的基本义。但在实际使用中,凡属于"心之为"的活动,荀子往往都归为伪,故伪又指圣王制作礼义的行为。礼义,以及凡人学习、实践礼义的行为,这是伪的引申义。荀子思想中存在"圣凡差异说"与"人性平等说"的矛盾,一方面他认为圣人与凡人人性是相同的,圣人乃后天努力的结果;另一方面又主张圣人与凡人有根本的差别,圣人可制作礼义,凡人需凭借圣人制作的礼义和教化方可成就善。(本文来源于《中国哲学史》期刊2019年06期）
张婷,王凌伟[7]（2019）在《非小细胞肺癌患者外周血外泌体中差异表达的微小RNAs研究》一文中研究指出背景目前,临床上尚缺乏早期、有效诊断非小细胞肺癌(NSCLC)的指标,来源于癌组织的外泌体及其内部物质因可反映亲本细胞性质而有望成为早期诊断肿瘤的生物学标志物。目的通过高通量测序技术筛选NSCLC患者外周血外泌体中差异表达的微小RNAs (miRNAs)。方法收集2018年1月—2019年1月于深圳市人民医院就诊的4例NSCLC患者的外周血样品,其中肺腺癌(LUAD) 2例、肺鳞状细胞癌(LUSC) 2例;另收集同期4例健康志愿者的外周血样品作为对照。采用HiSeq 2500高通量测序仪进行miRNAs测序,采用DESeq2软件筛选差异表达的miRNAs;在癌症基因组图谱(TCCGA)中选取并比较39对LUAD组织及其配对癌旁正常组织、45对LUSC组织及其配对癌旁正常组织miRNA-9-3p测序结果。结果 (1)高通量测序结果显示,4例NSCLC患者外周血外泌体中平均检测到776种miRNAs,4例健康志愿者外周血外泌体中平均检测到238种miRNAs。(2) LUAD与LUSC患者外周血外泌体中差异表达最显着的10种miRNAs中有6种是重合的,分别为miRNA-1228-5p、miRNA-129-5p、miRNA-760、miRNA-885-3p、miRNA-9-3p、miRNA-95-3p。(3) LUSC-1、LUSC-2、LUAD-1及LUAD-2外周血外泌体中miRNA-9-3p表达量分别为71.51、15.61、13.99、16.11转录本数,4例健康志愿者外周血外泌体中miRNA-9-3p表达量均为0。TCCGA中LUAD组织和LUSC组织miRNA-9-3p表达量均高于其配对癌旁正常组织(P<0.01)。结论通过高通量测序技术发现miRNA-1228-5p、miRNA-129-5p、miRNA-760、miRNA-885-3p、miRNA-9-3p、miRNA-95-3p可能是NSCLC患者潜在的特异性miRNAs,其中miRNA-9-3p主要来源于NSCLC患者癌组织,这为后续通过外周血外泌体miRNAs测序而实现NSCLC的早期、无创诊断奠定了研究基础。(本文来源于《实用心脑肺血管病杂志》期刊2019年11期）
王晓堂,肖兰飞,高继萍,梁宇翔,轩瑞晶[8]（2019）在《中国地鼠口腔鳞状细胞癌相关的长链非编码RNA差异表达谱建立及应用》一文中研究指出目的筛选中国地鼠口腔鳞状细胞癌组织样本中具有差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA),预测其靶基因,探究靶基因的生物学功能及富集的信号通路。方法采用二甲基苯并蒽涂抹法建立中国地鼠口腔鳞状细胞癌模型,高通量测序技术构建LncRNA差异表达谱,生物信息学技术筛选差异表达的LncRNA并进行靶基因预测,GO与KEGG富集分析分别预测靶基因的生物学功能及富集的信号通路。结果与正常组织样本相比,口腔鳞状细胞癌组织样本中筛选出54个显着差异表达LncRNA(31个上调,23个下调)。功能性分析表明:与口腔癌相关的GO条目73条; KEGG富集的信号通路25条。结论中国地鼠口腔鳞状细胞癌样本中差异表达的LncRNA可能通过靶向调控其靶基因参与调控多种生物学功能及口腔癌相关的信号通路,在口腔鳞状细胞癌形成过程中可能发挥重要作用。(本文来源于《中国比较医学杂志》期刊2019年11期）
张春,禹雪,张永辉,付芬芬,张冬洁[9]（2019）在《乳腺癌术前空芯针穿刺活检与手术标本检测Ki-67表达的差异及影响因素》一文中研究指出目的探讨超声引导下空芯针穿刺活检(core needle biopsy,CNB)检测乳腺癌Ki-67表达指数的准确性。方法回顾性分析2016年9月～2018年12月99例103个未经过新辅助治疗的乳腺癌病灶,对比CNB标本和最终手术标本Ki-67的表达指数。根据术后标本Ki-67表达情况分为增高组和未增高组,先进行单因素分析,有统计学差异的变量通过logistic回归分析筛选术后Ki-67表达增高的影响因素。结果 CNB均顺利完成。穿刺标本Ki-67表达指数低于手术标本[中位数15%(2%～60%) vs. 20%(1%～60%),Wilcoxon检验,Z=-2. 986,P=0. 003]。穿刺标本低表达(Ki-67 <14%)病灶50个(50/103,48. 5%),高表达病灶(Ki-67≥14%) 53个(53/103,51. 5%);术后标本低表达与高表达病灶分别为38个(38/103,36. 9%)、65个(65/103,63. 1%),术后Ki-67高表达病灶增加(McNemar检验,P=0. 029),两者诊断的一致率为74. 8%(77/103)(κ=0. 491,P=0. 000),一致性较差。单因素分析结果显示,肿瘤孕激素受体(PR)表达状态、穿刺距离手术的时间间隔在2组间差异具有统计学意义(P <0. 05);多因素logistic回归分析显示,穿刺距离手术的时间间隔是影响术后Ki-67表达增高的主要因素(OR=1. 090,95%CI:1. 023～1. 162,P=0. 008)。对于穿刺病理为Ki-67低表达的病灶,穿刺距离手术的时间间隔≥20 d与<20 d相比,术后高表达者增加(χ2=4. 160,P=0. 041)。结论 Ki-67表达指数在CNB与手术标本检测存在差异,术后Ki-67表达指数高于CNB;穿刺距离手术的时间间隔延长是术后Ki-67表达指数增高的独立影响因素,随着时间间隔的延长,术后Ki-67高表达病灶增加。(本文来源于《中国微创外科杂志》期刊2019年11期）
房昉,温伟波,万春平,谢雪华,祁燕[10]（2019）在《健肝消脂方对非酒精性脂肪性肝病胰岛素抵抗、脂质沉积的影响及相关mRNA差异表达初步分析》一文中研究指出目的通过观察动物模型空腹胰岛素、空腹血糖、肝脏脂质沉积情况,计算胰岛素抵抗(IR)相关指标,并使用基因芯片技术观察相关mRNA表达谱差异,以深入阐释健肝消脂方治疗非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的分子机制。方法使用高糖高脂饲料复制NAFLD大鼠模型,造模成功后使用随机数字表法分为治疗组(Z组)及模型组(M组)。Z组根据10.86g/kg的生药量予健肝消脂方灌胃给药,M组给予等体积的蒸馏水灌胃,均每日给药1次,连续60天。给药结束后检测两组空腹胰岛素水平、空腹血糖水平,计算胰岛素敏感性及胰岛素抵抗指数(HOMA-IR),肝脏病理切片染色后观察肝脏脂质沉积情况,采用基因芯片技术分析实验动物肝脏相关mRNA表达谱差异。结果与M组比较,Z组大鼠空腹胰岛素水平明显下降(P<0.05),胰岛素敏感性明显升高(P<0.05),HOMA-IR明显降低(P<0.05),肝脏脂质沉积明显改善;两组肝脏mRNA表达存在明显差异(P<0.05),其中上调的基因有52个,下调的基因有13个;对基因功能进行分析可知,生物途径(pathway)富集可得出排序前十的pathway富集结果,GO富集可得到8个GO分子功能(molecular function)富集结果,排序前十的GO生物过程(biological process)富集结果及2个GO细胞成分(cellular component)富集结果。结论健肝消脂方可以改善IR及肝脏脂质沉积,其作用机制可能与该方影响肝脏基因表达有关。其分子机制可能是该方能够调节干扰素调节因子(IRF)7、GO分子功能GO:0016597、GO生物过程GO:0006952,并且影响了血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、Toll样体信号通路。同时健肝消脂方可能在分子层面上对肝纤维化、丙型肝炎病毒在肝脏内的复制等产生一定影响。(本文来源于《云南中医学院学报》期刊2019年02期）
差异表达论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的探究miR-449b多态性位点rs10061133 A>G在卵巢功能不全(POI)中的可能作用机制。方法生物信息学预测可能与POI相关的miR-449b潜在靶基因。双荧光素酶检测LHCGR是否为miR-449b的靶基因以及miR-449b rs10061133不同基因型对LHCGR表达调控的影响。结果生物信息学预测LHCGR为miR-449b的潜在靶基因,双荧光素酶测定证实LHCGR是miR-449b的靶基因。与GG基因型相比,rs10061133 AA基因型显着减弱LHCGR 3’UTR的荧光素酶活性。结论 LHCGR为miR-449b的靶基因,多态性位点rs10061133 A>G可能通过差异调控LHCGR表达在POI的发生发展中发挥作用。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
差异表达论文参考文献
[1].王晓娇,蒙美莲,曹春梅,逯春杏,许飞.水分胁迫下马铃薯萌芽出苗期根系转录组差异表达分析[J].东北师大学报(自然科学版).2019
[2].潘虹,陈蓓丽,李腾龑,马旭.miR-449b多态性位点rs10061133差异调控LHCGR表达[J].生殖医学杂志.2019
[3].孙婷婷,刘增才,王世新,王旭彤,邹莉.桑黄HMGS基因克隆、分子特性及差异表达分析[J].中草药.2019
[4].王言,顾以韧,杨雪梅,梁艳,杨跃奎.不同猪种背最长肌中miR-23a、miR-151、miR-299、miR-199a和miR-497的差异表达研究[J].养猪.2019
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[8].王晓堂,肖兰飞,高继萍,梁宇翔,轩瑞晶.中国地鼠口腔鳞状细胞癌相关的长链非编码RNA差异表达谱建立及应用[J].中国比较医学杂志.2019
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[10].房昉,温伟波,万春平,谢雪华,祁燕.健肝消脂方对非酒精性脂肪性肝病胰岛素抵抗、脂质沉积的影响及相关mRNA差异表达初步分析[J].云南中医学院学报.2019
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