导读:本文包含了基因芯片论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因芯片,杆菌,胚乳,异烟肼,成分,利福平,涂片。
基因芯片论文文献综述
贺超,付沛,王凯,蒋龙,陈慧珍[1]（2019）在《基于基因芯片的水稻胚乳发育相关基因生物信息学分析》一文中研究指出水稻(Oryza sativa L.)胚乳的发育状况直接影响着水稻的产量和品质,而胚乳发育过程中复杂的分子机制尚不明确.为揭示水稻胚乳发育过程基因的表达模式,挖掘胚乳发育过程不同时期可能的关键基因,以水稻日本晴开花后(0day after flower,0DAF)籽粒中的子房和开花后第3天、第9天、第16天(3DAF、9DAF、16DAF)籽粒中的胚乳细胞基因芯片表达谱数据为研究对象,筛选并分析了不同时期表达量存在显着差异的基因.结果表明:同处于乳熟期的胚乳细胞(开花后第3天和第9天)基因表达模式最相似,间隔的天数越多,基因表达模式的差异程度越大;开花后第0～3天胚乳细胞消耗大量的能量,且在第3天达到峰值;胚乳中营养物质的积累从开花后第3天开始,第9天时积累最盛,到第16天时物质积累基本完成.加权基因共表达网络分析(WGCNA)发现,不同时期可能的关键基因具有不同的功能,涉及的生物过程包括叶绿素合成、活性氧清除、激素调控和脂质代谢.旨在揭示水稻籽粒开花时到胚乳大体完成增长时胚乳发育相关基因的表达模式,为培育产量高、品质优的水稻品种奠定分子基础.(本文来源于《辽宁师范大学学报(自然科学版)》期刊2019年04期）
孙桂英,赵刚,沈燕,徐密琴,高胜利[2]（2019）在《基因芯片技术对结核分枝杆菌利福平及异烟肼的耐药性检测研究》一文中研究指出目的考察基因芯片技术检测结核分枝杆菌(Mtb)对利福平(RFP)与异烟肼(INH)耐药性的效果。方法选取苏州市吴江区第一人民医院感染科发现的痰液涂片阳性的结核病患者纳入研究。采用基因芯片技术检测Mtb对RFP与INH的耐药性,并与传统药敏试验结果进行对比,同时采用DNA测序进行验证。结果基因芯片检测RFP耐药的符合率为97.47%,灵敏度为94.90%,特异度为97.81%,阳性预测值为85.32%,阴性预测值为99.31%,Kappa值为0.952;检测INH耐药的符合率为94.45%,灵敏度为78.16%,特异度为99.84%,阳性预测值为99.38%,阴性预测值为93.25%,Kappa值为0.823;检测MDR的符合率为97.83%,灵敏度为82.50%,特异度为99.47%,阳性预测值为94.29%,阴性预测值为98.16%,Kappa值为0.927;经DNA测序验证,基因芯片检测RFP与INH耐药准确率分别为99.52%与99.76%。结论 rpoB531、526位点突变与katG315位点突变可能是苏州吴江地区Mtb产生RFP和INH耐药的关键性分子机制,基因芯片技术能快速且高准确度地检测出这些位点的突变情况,对INH耐药检测的灵敏度尚有较大提升空间。(本文来源于《国际检验医学杂志》期刊2019年23期）
唐柳生,廖光付,周明,冯光辉[3]（2019）在《基因芯片法和涂片法在肺部感染分枝杆菌诊断中的应用评价》一文中研究指出目的探讨基因芯片法和涂片法检测分枝杆菌的一致性。方法采集肺部感染患者痰标本先进行直接涂片查找抗酸杆菌,然后用基因芯片法平行检测分枝杆菌。对两种方法的结果进行统计,分析两种方法的差异性。结果 136例患者痰标本用基因芯片法共检测出抗酸杆菌69例,阳性率为50.7%,其中结核分枝杆菌56例(81.2%),非结核分枝杆菌13例(18.8%);涂片法共找到抗酸杆菌50例,阳性率为36.8%。结论基因芯片法检测抗酸杆菌的阳性率明显高于涂片法,而且可以检测出抗酸杆菌的种类,其结果明显优于涂片法,为临床鉴别肺部疾病提供了重要依据。(本文来源于《检验医学与临床》期刊2019年23期）
施洋,樊官伟,候宝林,樊登峰,张伟[4]（2019）在《采用基因芯片技术研究丹红注射液对急性心肌梗死模型大鼠基因表达谱的影响》一文中研究指出目的:探讨丹红注射液(DHI)对急性心肌梗死(AMI)模型大鼠基因表达谱的影响。方法:将雄性SD大鼠随机分为假手术组、模型组和DHI组(0.76 m L/kg),每组10只。模型组和DHI组采用冠状动脉左前降支结扎法复制AMI模型。造模后,假手术组和模型组大鼠均肌内注射等容生理盐水,DHI组大鼠肌内注射相应药物,每日1次,连续14 d。末次给药后,分离大鼠梗死边缘区心肌组织,采用基因芯片技术检测基因表达谱的变化情况,以相对表达量差异倍数为指标,筛选差异表达微RNA(miRNA)。在检索其对应基因的基础上,利用DAVID生物信息学资源数据库和KEGG通路数据库分别进行基因本体(GO)和KEGG通路富集分析;借助TargetScan数据库预测差异表达miRNA对应的靶基因信使RNA(mRNA),采用Cytoscape 3.6.1软件构建miRNAmRNA网络并进行分析,采用Agilent GeneSpring GX v11.5软件筛选上述网络中与炎症相关的靶基因和miRNA。结果:与假手术组比较,模型组差异表达miRNA共22个,其中上调5个、下调17个;与模型组比较,DHI组差异表达miRNA共26个,均为上调;与DHI治疗AMI有关的差异表达miRNA包括rno-let-7a-5p、rno-let-7d-5p、rno-let-7f-5p、rno-miR-26b-5p、rno-miR-29b-3p、cel-miR-39-3p、cel-miR-39-5p、rno-miR-142-5p、rno-miR-191a-5p、rno-miR-409a-3p。GO和KEGG通路富集分析结果显示,差异表达miRNA对应基因主要集中在膜结合细胞器、细胞质、内膜系统等细胞组分中,通过解剖结构发育、多细胞组织发育、发育过程等生物过程来发挥蛋白结合、离子结合等分子功能;其主要富集于钙信号通路,过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路,血管内皮生长因子(VEGF)信号通路,细胞凋亡,糖基磷脂酰肌醇锚定生物合成,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解等信号通路上。miRNA-mRNA网络分析结果显示,与差异表达miRNA对应的靶基因mRNA共25个,与之关联的miRNA共24个;该网络中与炎症相关的靶基因共6个(IL6、IL1b、TNF、TLR4、CRP、CXCL12),涉及差异表达miRNA共19个。结论:DHI对AMI的治疗作用可能与调节相关miRNA的表达,影响钙离子、PPAR、VEGF等通路的信号转导,调控白细胞介素、趋化因子、C反应蛋白等炎症标志物的分泌有关。(本文来源于《中国药房》期刊2019年22期）
袁语泽,马明星,王国强,关雪娃,王紫嫣[5]（2019）在《血栓性疾病个体化用药指导基因芯片试剂盒的制备和效果评价》一文中研究指出目的:探讨血栓性疾病(TD)个体化用药指导基因芯片的制备过程,阐明一种快速、高通量检测氯吡格雷和华法林药物代谢基因的方法。方法:根据氯吡格雷药物代谢基因位点(CYP3A4、CYP2C19*17、CYP2C19*2和CYP2C19*3)和华法林药物代谢基因位点(CYP4F2*3、GGCX、VKORC1-2、VKORC1-1、CYP2C9*2和CYP2C9*3)设计相应的探针和引物,制备TD个体化用药指导的基因芯片检测试剂盒。经过DNA提取、PCR扩增、杂交、洗脱和扫描等步骤对基因芯片的灵敏性、重复性和稳定性进行评价。收集3个地区的150例TD受试者样本并进行药物代谢基因检测,以受试者在临床中接受的用药指导及6个月后患者的疾病恢复情况为依据,评价基因芯片试剂盒的有效率。结果:基因芯片检测2种药物的代谢基因均出现良好的杂交信号;芯片检测PCR扩增产物的最低检测浓度为103 copies·mL-1;对不同批次的3张芯片及同一批次的10张芯片进行平行测定,符合率为100%;芯片具有稳定性,有效期长达6个月;来源于3个地区的150例TD样本验证基因芯片检测试剂盒的有效率在90%以上。结论:成功制备了高通量检测氯吡格雷和华法林药物代谢基因的TD个体化用药指导基因芯片试剂盒,该方法灵敏度高,重复性好,稳定性强,制备效果优良。(本文来源于《吉林大学学报(医学版)》期刊2019年06期）
王阳雪,李悠悠,姜希娟[6]（2019）在《基因芯片在防治动脉粥样硬化中的应用进展》一文中研究指出基因芯片技术是伴随人类基因组计划应运而生的一项基因检测技术,它与传统的基因检测技术如PCR最大不同在于可平行完成多项遗传实验,大大加快了基因检测的速度。动脉粥样硬化作为缺血性心血管疾病的主要病理基础,其发病机制尚未完全阐明。利用基因芯片技术,可快速对海量基因进行检测,这为研究动脉粥样硬化的发生、发展机制提供了极大的便利。文章主要从基因筛查、微小RNA的检测、分析药物或疗法的作用机制、临床应用及意义等四方面,就目前基因芯片技术在防治动脉粥样硬化上的应用进行综述。(本文来源于《疑难病杂志》期刊2019年11期）
朱雨捷,朱湘玉,顾雷雷,张颖,倪梦瑶[7]（2019）在《法洛四联症microRNA差异表达谱与临床胎儿基因芯片结果的功能及通路分析》一文中研究指出目的对法洛四联症胎儿组织差异microRNAs(miRNAs)表达谱进行生物信息学分析,并和我院临床胎儿基因芯片结果进行比对,以期从整体水平揭示miRNAs在法洛四联症中的作用。方法我们从GeneExpressionOmnibus(GEO)数据库上搜索法洛四联症相关的miRNA数据集(GSE35490),并基于R语言limma包筛选特异性miRNAs(P值<0.05,|log2Fold Change(FC)|值>1),利用计算方法预测这些miRNAs作用的靶基因与我院27例法洛四联症胎儿的基因芯片数据进行比较取靶基因交集,将这些靶点在通路数据库中进行富集统计分析。结果数据集筛选出29个差异的miRNAs,和基因芯片的交集筛选出2841个靶基因,最终富集出可能和法洛四联症相关的20条GO功能和11条反应通路。结论法洛四联症是一个复杂疾病,尽管不同的miRNA功能和作用机制不同,在通路层次上我们可以系统地注解它们的功能和作用。(本文来源于《中国优生与遗传杂志》期刊2019年11期）
邓波儿,孔为民[8]（2019）在《基因芯片在宫颈癌中的研究进展》一文中研究指出基因芯片是分子生物学领域的技术之一,是20世纪90年代以来发展的一种基因筛选技术,具有高通量、快速等优点。近年来,随着相关技术和设备的进步,基因芯片的应用更为广泛,尤其在医学领域有较快发展。应用基因芯片技术,可对肿瘤的发生、发展进行研究,并从基因水平上探究相关机制,给临床治疗等提供帮助。宫颈癌是女性常见的生殖系统肿瘤之一,宫颈癌的发生与人乳头瘤病毒(HPV)的感染密切相关。应用基因芯片技术不仅可以绘制宫颈癌的表达谱,进行HPV感染情况的分析,还可以对宫颈癌的病理分型、浸润及治疗机制进行基因水平的分析,以指导临床决策。(本文来源于《医学综述》期刊2019年22期）
杨艳兵,胡海英,吴茱萸,张丽娜,周敬奎[9]（2019）在《基因芯片技术在成人下呼吸道感染病原学检测中的临床应用及评价》一文中研究指出目的调查了解成人下呼吸道感染的病原谱,评价基因芯片检测技术在成人下呼吸道感染病学检测中的临床应用价值。方法留取因下呼吸道感染住院的成人患者下呼吸道标本,分别进行常规培养及29种病原体基因芯片法检测,并对检测结果进行统计分析。结果共入组451例患者,A组(18～45岁)63例,B组(45～60岁)95例,C组(>60岁)293例;基因芯片法病毒的总检出率为77.61%,C组较高,但差异无统计学意义(χ~2=4.97,P>0.05)。基因芯片法细菌的总检出率为59.20%,阳性菌以肺炎链球菌为主,A组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=1.38,P>0.05);阴性菌以流感嗜血杆菌及鲍曼不动杆菌为主,流感嗜血杆菌在B组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=5.73,P>0.05),非发酵菌在C组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=4.72,P>0.05),肠杆菌科细菌在C组患者检出率较高,差异有统计学意义(χ~2=9.83,P<0.05)。基因芯片法白色念珠菌的总检出率为28.60%, C组较高,差异有统计学意义(χ~2=7.06,P<0.05)。基因芯片检测与流感病毒感染临床诊断对比,总符合率为80.93%,敏感度18.75%,特异度94.34%,阳性预测值41.67%,阴性预测值84.34%;与传统细菌培养结果对比,总符合率为83.59%,敏感度50.45%,特异度94.41%,阳性预测值74.67%。结论病毒检出率较高,阳性菌以肺炎链球菌为主,阴性菌以流感嗜血杆菌及鲍曼不动杆菌为主,不典型病原体较少见;病毒、阴性菌及真菌在>60岁患者检出率较高;与传统培养法及流感临床拟诊相比,基因芯片检测技术有较高的符合率、特异度及阴性预测值。(本文来源于《广东医学》期刊2019年21期）
陈茹,段燕喻,高小博,刘志玲,阳静[10]（2019）在《建立多重液相基因芯片方法快速检测狐狸、水貂成分》一文中研究指出基于xMAP液相芯片新型生物技术平台,分别以狐狸线粒体DNA D-loop区序列、水貂线粒体DNA细胞色素b基因序列为模板设计特异扩增引物和探针,并对探针进行锁核酸修饰,建立了二重xMAP液相基因芯片方法,用于快速检测狐狸和水貂源性成分。该法能准确鉴定鉴别狐狸和水貂DNA,对其他18种动物物种DNA均呈检测阴性,对狐狸、水貂DNA的检测低限分别为2. 8pg/μl、0. 9pg/μl,对肉类混样检出限为0. 05%(m/m)。对目标源性DNA含量为1%(V/V)的32份饲料与食品核酸添加样本均呈对应目标检测阳性。结果表明,该方法特异性强、灵敏度高,适用于食品与饲料领域相关原料和产品的质量与安全检验。(本文来源于《中国生物工程杂志》期刊2019年11期）
基因芯片论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的考察基因芯片技术检测结核分枝杆菌(Mtb)对利福平(RFP)与异烟肼(INH)耐药性的效果。方法选取苏州市吴江区第一人民医院感染科发现的痰液涂片阳性的结核病患者纳入研究。采用基因芯片技术检测Mtb对RFP与INH的耐药性,并与传统药敏试验结果进行对比,同时采用DNA测序进行验证。结果基因芯片检测RFP耐药的符合率为97.47%,灵敏度为94.90%,特异度为97.81%,阳性预测值为85.32%,阴性预测值为99.31%,Kappa值为0.952;检测INH耐药的符合率为94.45%,灵敏度为78.16%,特异度为99.84%,阳性预测值为99.38%,阴性预测值为93.25%,Kappa值为0.823;检测MDR的符合率为97.83%,灵敏度为82.50%,特异度为99.47%,阳性预测值为94.29%,阴性预测值为98.16%,Kappa值为0.927;经DNA测序验证,基因芯片检测RFP与INH耐药准确率分别为99.52%与99.76%。结论 rpoB531、526位点突变与katG315位点突变可能是苏州吴江地区Mtb产生RFP和INH耐药的关键性分子机制,基因芯片技术能快速且高准确度地检测出这些位点的突变情况,对INH耐药检测的灵敏度尚有较大提升空间。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因芯片论文参考文献
[1].贺超,付沛,王凯,蒋龙,陈慧珍.基于基因芯片的水稻胚乳发育相关基因生物信息学分析[J].辽宁师范大学学报(自然科学版).2019
[2].孙桂英,赵刚,沈燕,徐密琴,高胜利.基因芯片技术对结核分枝杆菌利福平及异烟肼的耐药性检测研究[J].国际检验医学杂志.2019
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[9].杨艳兵,胡海英,吴茱萸,张丽娜,周敬奎.基因芯片技术在成人下呼吸道感染病原学检测中的临床应用及评价[J].广东医学.2019
[10].陈茹,段燕喻,高小博,刘志玲,阳静.建立多重液相基因芯片方法快速检测狐狸、水貂成分[J].中国生物工程杂志.2019
论文知识图
