工业蛋白质构效关系的计算生物学解析

论文摘要

工业催化用酶已经成为现代生物制造技术的核心"芯片"。不断设计和研发新型高效的酶催化剂是发展工业生物技术的关键。工业催化剂创新设计的科学基础是对酶与底物的相互作用、结构与功能关系及其调控机制的深入剖析。随着生物信息学和智能计算技术的发展,可以通过计算的方法解析酶的催化反应机理,进而对其结构的特定区域进行理性重构,实现酶催化性能的定向设计与改造,促进其工业应用。聚焦工业酶结构-功能关系解析的计算模拟和理性设计,已成为工业酶高效创制改造不可或缺的关键技术。本文就各种计算方法和设计策略以及未来发展趋势进行简要介绍和讨论。

论文目录

• 1 基于计算生物学的酶分子理性设计
•   1.1 解析酶的催化机理
•   1.2 提高酶的催化效率
•   1.3 立体选择性设计
•   1.4 提高酶的热稳定性
•   1.5 辅酶依赖性反转
• 2 新的研究方法
•   2.1 基于定量构效关系的研究
•   2.2 基于氨基酸残基网络的研究
•   2.3 基于机器学习的方法
•   2.4 从头设计及人工智能的方法
• 3 总结

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陈琦,李春秀,郑高伟,郁惠蕾,许建和

关键词: 工业蛋白质,结构功能关系,分子模拟,理性设计

来源: 生物工程学报 2019年10期

年度: 2019

分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

专业: 有机化工

单位: 华东理工大学生物工程学院

基金: 上海市自然科学基金(No.19ZR1472900),国家自然科学基金(Nos.31971380,21536004,21672063,21776085)资助~~

分类号: TQ426.97

DOI: 10.13345/j.cjb.190329

页码: 1829-1842

总页数: 14

文件大小: 2844K

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