一种新的豆瓣菜(Nasturtium officinale)锌铁转运蛋白基因的克隆及序列分析

论文摘要

为了深入研究豆瓣菜(Nasturtium officinale R. Br.)对锌和铁的吸收和转运,我们采用RACE方法克隆了一种豆瓣菜根部锌铁转运蛋白NoZIP2 (N. officinale zinc iron transporter protein 2)的全长cDNA,并采用生物信息学方法对序列进行分析。结果表明,NoZIP2包含1 446 bp,编码一个357个氨基酸残基的多肽,包含了9个跨膜结构域,存在植物锌铁转运蛋白的保守结构域,可能参与了豆瓣菜锌铁转运的过程。NoZIP2氨基酸序列与其它物种ZIP的氨基酸序列相似性较高,其中与荠菜的相似性最高,氨基酸相似性高达92%。分子进化分析表明,NoZIP2与十字花科植物荠菜、荠蓝和小花蓝芥的ZIP能够聚到一起。从豆瓣菜根部克隆的NoZIP2具有其它植物锌铁转运蛋白相似的高度保守的ZIP家族成员序列特征,因此推测NoZIP2属于ZIP家族成员。豆瓣菜No ZIP2的克隆和序列分析能够为进一步研究其功能及表达提供理论基础。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 NoZIP2基因中间片段的克隆及测序
•   1.2 5'RACE产物的克隆及测序
•   1.3 3'RACE产物的克隆及测序
•   1.4 NoZIP2全长cDNA的获得
•   1.5 NoZIP2基因的理化性质
•   1.6 NoZIP2基因的序列分析
•   1.7 NoZIP2基因的序列构建系统进化树
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 试验材料
•   3.2 总RNA的提取及反转录
•   3.3 NoZIP2基因中间片段的扩增及克隆
•   3.4 5'RACE扩增及克隆
•   3.5 3'RACE扩增及克隆
•   3.6 NoZIP2基因全长序列的获得
•   3.7 NoZIP2基因序列分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 钟燕珊,陈肖丽,傅明辉

关键词: 豆瓣菜,锌铁转运蛋白,克隆,序列分析

来源: 分子植物育种 2019年17期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,园艺

单位: 广东工业大学轻工化工学院

基金: 广东省科技计划(2016A010105020),国家自然科学基金(21177029)共同资助

分类号: S645;Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.005554

页码: 5554-5560

总页数: 7

文件大小: 1301K

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