基于希尔伯特-黄变换的核小体定位特征提取

论文摘要

核小体是染色体折叠的整体结构,它们的空间分布与基因组活动的调节密切相关,是基因工程和表观遗传的重要研究领域。为进一步研究核小体定位特征的物种间差异性,将希尔伯特-黄变换（HHT）引入到酵母和果蝇两个不同物种的定位信号中,从多个角度客观分析核小体定位信号特征在两个物种间的差异性。在此基础上,对酵母和果蝇核小体分布的周期特征和进化印记进行尺度和频域分析,结果表明酵母和果蝇染色体在组织结构上存在显著差异。本文研究思路为准确提取信号瞬时频率提供了前提条件。

论文目录

• 1 希尔伯特-黄变换
•   1.1 数据来源
•   1.2 希尔伯特-黄变换原理
•   1.3 希尔伯特-黄变换的改进
• 2 核小体定位特征提取
•   2.1 酵母与果蝇核小体定位信号的时域分解特征
•   2.2 酵母与果蝇核小体定位信号的频域分解特征
•   2.3 酵母与果蝇核小体定位信号的二维幅频曲线
•   2.4 酵母与果蝇核小体定位信号的边际谱
•   2.5 酵母与果蝇核小体定位信号的瞬时频率
•   2.6 酵母与果蝇核小体定位信号的三维HHT时频谱
• 3 结 语

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 刘珂,丰继华,黄月月,郭亚茹,牟锦

关键词: 核小体,真核模式生物,希尔伯特黄变换,果蝇,酵母

来源: 生物信息学 2019年04期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 云南民族大学电气信息工程学院

基金: 国家自然科学基金(No.31160234)

分类号: Q343.23

页码: 237-248

总页数: 12

文件大小: 24310K

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