全长转录组测序技术在非模式植物转录组学研究中的应用

全长转录组测序技术在非模式植物转录组学研究中的应用

论文摘要

转录组连接基因组遗传信息与蛋白质组,也是基因功能研究的基础和出发点。单分子测序技术是近年逐渐成熟的新一代测序技术,也称为第三代测序技术,在转录组学研究方面较前代测序技术具有独到优势,应用前景广阔。在非模式植物的功能基因组学研究中,全长转录本的获得可有力地推进相应基础研究水平,而第三代测序技术为此提供了较好的解决方案。本研究就目前技术较为成熟且应用较广泛的SMRT等单分子测序技术原理进行了介绍,综述了该技术在非模式植物转录组学研究中的应用现状,对其应用前景进行了展望。

论文目录

  • 1 第三代测序技术与全长转录本测序
  •   1.1 第三代测序技术原理与应用
  •   1.2 第三代测序与全长转录本
  • 2 全长转录本测序技术在非模式植物研究中的应用
  •   2.1 转录本选择性剪接分析
  •   2.2 融合转录本分析
  •   2.3 非编码RNA (ncRNA) 分析
  •   2.4 完善基因注释, 辅助基因组组装
  •   2.5 转录本的精确定量和时空表达分析
  • 3 展望
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王瑞娴,李川

    关键词: 单分子测序,全长转录组,非模式植物

    来源: 分子植物育种 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 安康学院现代农业与生物科技学院,安康学院陕西省蚕桑重点实验室

    基金: 陕西省教育厅重点实验室科研计划项目(17JS001),安康学院高层次人才科研启动项目(2016AYQDZR01),安康学院校内专项项目(2016AYXNZX019)共同资助

    分类号: Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.000502

    页码: 502-508

    总页数: 7

    文件大小: 1190K

    下载量: 810

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