融合识别位点论文_孙佳伟,张明,王长宝,徐维艳,程科

导读:本文包含了融合识别位点论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:位点,层析,特征,凝血酶,模型,组分,对数。

融合识别位点论文文献综述

孙佳伟,张明,王长宝,徐维艳,程科[1](2019)在《一种新的融合统计特征的DNA甲基化位点识别方法》一文中研究指出自动、准确地识别DNA甲基化修饰位点对于研究基因的调控、转录和表达机理,有针对性地开发癌症靶向治疗药物有重要意义.然而,基于核酸频率统计特征和物化属性伪核酸成分统计特征并不能很好地反应DNA甲基化位点的模式信息,所构建的DNA甲基化位点预测器精度也不高.因此,文中提出从3个不同的视角抽取DNA序列上的核酸频次统计信息、位置统计信息和空间结构属性信息,并将其融合为一种新的统计特征向量,然后在相同的基础数据集上采用SVM分类器和严格的Jackknife测试方法进行实验验证.结果表明:该方法构建的预测器较当前最好的iDNA-methyl预测器,在Acc、Mcc和AUC 3个性能指标上分别提高了11.85%、24%和11.3%;该研究表明在DNA甲基化位点预测问题上,核酸序列的频次统计信息、位置统计信息和空间结构属性信息具有较好互补性,这3个视角相融合得到的特征向量能够更好地反映DNA甲基化修饰位点的模式特征,提高DNA甲基化位点的预测精度.(本文来源于《江苏科技大学学报(自然科学版)》期刊2019年02期)

周雄[2](2014)在《多尺度组分特征和位点关联特征相融合的剪接位点识别》一文中研究指出为了提高剪接位点的识别精度,提出一种多尺度组分和位点关联特征相融合的剪接位点识别模型(MSC-APR)。确定剪接位点序列保守性的窗口长度,分别提取序列的多尺度组分和位点关联特征,然后将两类特征组合输入最小二乘支持向量机构建剪接位点分类器,采用数据集HS3D和NN269进行仿真实验。结果表明,MSC-APR的剪接位点识别精度明显优于对比模型的识别精度。(本文来源于《计算机工程与应用》期刊2014年10期)

周艳红,王卉,杨雷[3](2006)在《基于特征挖掘与融合的剪接位点识别》一文中研究指出在基于保守序列这一信号特征识别剪接位点的基础上,挖掘了可用于剪接位点识别的其他多个特征(包括剪接位点上、下游序列的碱基组成,剪接位点信号和上、下游序列的碱基组成随位点邻近序列C+G含量的变化等统计特征),建立了描述这些特征的模型,设计了能有效融合这些特征对剪接位点进行识别的对数线性模型,开发了剪接位点识别程序SpliceKey.测试结果表明:SpliceKey识别剪接位点的精度不仅较WAM方法有显着的提高,而且也优于国际上最新发布的剪接位点识别软件DGSplice.SpliceKey已提供网络服务:http:∥infosci.hust.edu.cn/SpliceKey/.(本文来源于《华中科技大学学报(自然科学版)》期刊2006年12期)

袁榴娣,谢维,窦非,梁玉璞[4](2000)在《含凝血因子FXa识别位点的融合表达体系的构建》一文中研究指出目的 :研究含凝血因子FXa识别位点的基因与表达载体pGEX KG连接后在大肠杆菌中的表达。方法 :用PCR对人工合成的抗菌肽X基因的 5′端进行改造 ,引入FXa的酶切位点 ,用限制性内切酶作用后 ,连接到含Ptac启动子的表达载体pGEX KG中 ,转化大肠杆菌DH5α,用原位杂交法筛选到阳性克隆。转化大肠杆菌BL2 1,用异丙基硫代 β D半乳糖(IPTG)诱导。结果和结论 :抗菌肽X基因在大肠杆菌中获高效表达 ,表达量约占细胞总蛋白的 2 0 %。重组蛋白以可溶形式存在。融合蛋白经FXa切割后 ,产物有抗菌活性(本文来源于《南京铁道医学院学报》期刊2000年03期)

张学述,简志愚,刘裕,谢茂超,黄林[5](1999)在《表达含凝血酶识别位点的rhGM-CSF融合蛋白工程菌的选定及其酶切后目的蛋白的纯化》一文中研究指出比较 4株表达含凝血酶识别位点的rhGM CSF融合蛋白工程菌的特性 ,选定用于开发的工菌株 ,其表达产物相对分子质量为 2 6 0 0 0 ,N端 110 0 0为MS2 ,C端 15 0 0 0为rhGM CSF ,较易用凝血酶消化释放出目的蛋白。用阴离子交换、疏水和凝胶过滤层析 ,或后二者结合进行可得到适宜人体应用的纯品 ,活性达到 10 7IU mg蛋白。(本文来源于《中国生物制品学杂志》期刊1999年02期)

融合识别位点论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

为了提高剪接位点的识别精度,提出一种多尺度组分和位点关联特征相融合的剪接位点识别模型(MSC-APR)。确定剪接位点序列保守性的窗口长度,分别提取序列的多尺度组分和位点关联特征,然后将两类特征组合输入最小二乘支持向量机构建剪接位点分类器,采用数据集HS3D和NN269进行仿真实验。结果表明,MSC-APR的剪接位点识别精度明显优于对比模型的识别精度。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

融合识别位点论文参考文献

[1].孙佳伟,张明,王长宝,徐维艳,程科.一种新的融合统计特征的DNA甲基化位点识别方法[J].江苏科技大学学报(自然科学版).2019

[2].周雄.多尺度组分特征和位点关联特征相融合的剪接位点识别[J].计算机工程与应用.2014

[3].周艳红,王卉,杨雷.基于特征挖掘与融合的剪接位点识别[J].华中科技大学学报(自然科学版).2006

[4].袁榴娣,谢维,窦非,梁玉璞.含凝血因子FXa识别位点的融合表达体系的构建[J].南京铁道医学院学报.2000

[5].张学述,简志愚,刘裕,谢茂超,黄林.表达含凝血酶识别位点的rhGM-CSF融合蛋白工程菌的选定及其酶切后目的蛋白的纯化[J].中国生物制品学杂志.1999

论文知识图

一15.转基因pLFBFGN植物与野生型杂交后...1 基因清除技术的原理 (Li et al., 200...一2pTRX一人内皮抑素的上下游引物Fi.g3...介导的纯化的示意图凝血酶切割融合蛋白的SDS一PAGE重组质粒的酶切鉴定合蛋白的诱导表达...

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