酸性转化酶基因论文_何宇宁

导读:本文包含了酸性转化酶基因论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:酸性,细胞壁,基因,木薯,枸杞,可溶性,高粱。

酸性转化酶基因论文文献综述

何宇宁[1](2017)在《铜胁迫下海州香薷酸性转化酶基因启动子的甲基化研究》一文中研究指出一些重金属虽然是植物必需的微量元素,过量也会对植物产生毒性,严重影响植物正常的生长代谢,但是一些金属型植物由于长期生长在富含重金属的土壤中,对高浓度的重金属产生了耐受性。海州香薷(ElsholtziahaichowensisSun)是着名的国产Cu矿区金属型植物,其铜抗性(MP)和非抗性种群(NMP)均被发现分布于长江中下游地区。已有很多研究致力于揭示海州香薷铜抗性种群的抗性机制。前期研究结果表明,酸性转化酶(包括液泡转化酶和细胞壁转化酶)对金属型植物的根部生长以及根/芽生物量的分配起到至关重要的作用,因而可以通过碳源和能量配给参与金属型植物的铜抗性机制。铜胁迫下,海州香薷铜抗性种群根中酸性转化酶的活性以及相应酸性转化酶基因的转录水平明显高于非抗性种群,而基因异源表达研究表明两个种群酸性转化酶氨基酸序列的差别并未导致相应酶的特性有显着性差异。因此,海州香薷两个种群酸性转化酶基因的蛋白编码区序列的差别与Cu胁迫下相应酶活性和基因转录水平差异没有直接关系,一些其他机制,如基因启动子表观遗传修饰可能参与其中。表观遗传修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的表达,其中DNA甲基化作为重要的表观遗传修饰之一,对基因的表达调控起着重要作用。重金属胁迫可以影响基因组以及特定区域的DNA甲基化水平。目前关于重金属胁迫对植物甲基化影响的研究大多都是基于甲基敏感型内切酶的检测方法,并不能精确检测到每一个胞嘧啶的甲基化状态,因而主要集中在重金属胁迫后对植物整体DNA甲基化水平的影响上,鲜有深入到相关基因甲基化变化的研究。鉴于亚硫酸氢盐测序技术(BS-Seq)可以在单碱基分辨率水平检测基因的甲基化状态,本研究工作采用该方法检测Cu胁迫下海州香薷Cu抗性和非抗性种群酸性转化酶基因启动子甲基化水平和模式是否存在差异,以期从表观遗传修饰的角度探讨Cu胁迫对相应基因表达调控的可能影响。主要研究结果如下:(1)海州香薷液泡转化酶基因(vINV)启动子主要在CG位点产生甲基化,CHG和CHH位点也有甲基化的发生,但是概率很低且处于低甲基化状态。无论是非胁迫还是铜胁迫条件下,海州香薷两个不同抗性种群之间在CG,CHG和CHH位点处的总甲基化水平都没有明显的差异,且Cu胁迫也未导致海州香薷抗性或者非抗性种群在叁种不同类型胞嘧啶位点的甲基化水平发生较大变化。海州香薷vINV启动子包含18个CG位点,21个CHG位点和217个CHH位点。在18个CG位点中,有15个处于超甲基化状态,且位于CG位点富集区(-1315到-1019 bp),而其他3个远离这个区段的CG位点几乎都处于低甲基化状态。一个特殊的CHG位点(-1061 bp)的甲基化状态在铜胁迫下的变化于两个不同抗性种群之间表现出很大的差异,可能参与液泡转化酶的差异表达。(2)海州香薷两个不同抗性种群之间细胞壁转化酶基因(cwINV)启动子整体甲基化水平也没有明显的差异。铜胁迫下,除了非抗性种群的CHH位点甲基化水平几乎不变之外,两种群叁种不同类型位点的甲基化水平均略有下降。海州香薷cwINV启动子包含25个CG位点,45个CHG位点和222个CHH位点,所有的CG位点以及大多数CHG和CHH位点都处于低甲基化状态。铜胁迫下,cwINV启动子区域-1478,-1447,-1256,-1181,-1068,-842 bp处CHH位点甲基化状态的变化在两个不同抗性种群之间表现出巨大差异。其中-1478 bp和-1265 bp处的CHH位点分别在5UTR Py-rich stretch和Skn-1_motif 上,而-1447 bp 和-1068 bp 处的 CHH 位点则分别在 CARE-motif 和TATC-box上游和下游2bp的位置。这些位于预测的顺式作用元件上的甲基化差异位点可能参与Cu胁迫下细胞壁转化酶基因的表达调控。(3)铜胁迫并未导致海州香薷vINV和cwINV启动子在CG位点处的甲基化发生变化或者在两个不同抗性种群之间有明显差异,因此CG位点的甲基化相对保守,但是一些特殊的CHG和CHH位点的甲基化响应铜胁迫并表现出种群特异性,说明CHG和CHH位点甲基化状态比CG位点甲基化更容易受到逆境胁迫的影响。海州香薷不同抗性种群酸性转化酶基因(包括液泡和细胞壁转化酶基因)启动子上的甲基化差异位点,其甲基化水平在抗性种群中保持相对稳定,而在非抗性种群中受铜诱导大幅上升或下降。(本文来源于《武汉大学》期刊2017-05-01)

钟海丽,聂元冬,王智,顿宝庆,李桂英[2](2016)在《高粱可溶性酸性转化酶基因(SAI-1)PCR克隆方法》一文中研究指出可溶性酸性转化酶(SAI)是蔗糖代谢途径中的关键酶,对植物生长发育起着至关重要的调节作用,研究简捷快速克隆可溶性酸性转化酶基因方法,对于育种材料和品种资源的基因分型具有重要意义。本研究通过已知的高粱可溶性酸性转化酶基因序列及高粱基因组中该基因序列片段,设计引物,比较了分段克隆、基因全长克隆、巢式PCR克隆等方法克隆高粱SAI-1基因的效果,结果表明,直接扩增全长,扩增产物极其不稳定且扩增产物纯化、连接,转化后得不到阳性克隆;采用均等分段克隆,前半段扩增产物纯化、连接转化后得不到阳性克隆,但后半段克隆成功;针对高粱基因组信息中SAI-1基因上游的未知序列部分设计引物,进行单独克隆(635 bp),再单独克隆其其余序列,两段序列拼接后得到SAI-1基因全长。序列分析发现,SAI-1前段635 bp的扩增片段GC含量高达69.6%,而其后GC含量急剧下降至30%以下,所以推测全长克隆、均等片段克隆以及巢式PCR克隆失败的原因可能是SAI-1基因中GC分布不均匀,克隆高粱SAI-1基因较为适宜的方法为利用2对引物进行不均等分段扩增克隆,前段PCR退火温度较后段高1℃。该方法将为其他研究人员提供有益参考。(本文来源于《植物遗传资源学报》期刊2016年01期)

赵建华,李浩霞,尹跃,安巍,王华芳[3](2015)在《枸杞酸性转化酶基因的克隆与表达》一文中研究指出以枸杞果实为试验材料,利用RACE技术克隆枸杞酸性转化酶基因Lb AI的全长c DNA序列,应用生物信息学软件分析Lb AI预期编码蛋白质特征;采用气相色谱法和实时荧光定量PCR技术,分析不同发育阶段枸杞果实及不同颜色成熟果实中可溶性糖含量及Lb AI在果实中的相对表达量。结果显示:Lb AI的c DNA序列全长2 252bp,开放阅读框(ORF)长1 920 bp,编码642个氨基酸,Lb AI编码的蛋白质相对分子量和等电点(p I)分别为70 600和5.9,Gen Bank登录号为KM191309。进化树分析结果显示,枸杞与马铃薯和番茄的亲缘关系最近,相似性在85%以上。随着果实生长发育,枸杞果实中果糖和葡萄糖含量不断升高,而蔗糖呈现出降低趋势;不同颜色枸杞果实中糖含量差异较大,成熟红色和黄色果实中果糖和葡萄糖含量显着高于黑色果实,但蔗糖含量在黑色果实中最高,在红色果实中最低;Lb AI相对表达与果实中葡萄糖含量变化基本一致。表明Lb AI基因在枸杞果实糖积累过程中具有重要的作用。(本文来源于《江苏农业学报》期刊2015年05期)

雷建武,门惠芹,李浩霞,尹跃,赵建华[4](2014)在《枸杞果实酸性转化酶基因生物信息学分析》一文中研究指出借助生物信息学工具对已克隆枸杞果实酸性转化酶蛋白LBSAI的理化性质、亲水性/疏水性、跨膜结构域、二级结构和叁级结构等方面进行预测和分析。结果表明:枸杞果实酸性转化酶蛋白为不存在信号肽亲水性蛋白;在氨基酸第37~39位置间产生一个跨膜螺旋结构;该蛋白二级结构主要有无规则卷曲和延伸链构件,并散布于整个蛋白。研究为进一步研究枸杞果实酸性转化酶基因调控蔗糖代谢途径机理提供理论参考。(本文来源于《宁夏农林科技》期刊2014年12期)

刘姣,胡艳平,周扬,李瑞梅,段瑞军[5](2014)在《木薯细胞壁酸性转化酶基因MeCWINV1启动子的克隆及其在烟草中的瞬时表达分析》一文中研究指出为了解木薯细胞壁酸性转化酶基因Me CWINV1胁迫诱导模式及调控机制,本研究利用PCR的方法,从木薯基因组中分离到一段Me CWINV1基因启动子序列(Gen Bank登录号:KC465190)。分析结果显示,该启动子长度865 bp,含有TATA box和CAAT box保守元件,以及MBS、HSE、AT1等多个与植物逆境胁迫相关的元件。通过构建GUS基因融合表达载体,对该启动子在烟草中的瞬时表达进行分析。结果表明,GUS基因主要在烟草叶脉中表达。研究结果为进一步研究该启动子的功能奠定了基础。(本文来源于《分子植物育种》期刊2014年06期)

胡艳平[6](2014)在《木薯细胞壁酸性转化酶基因MeCWINV1启动子的克隆与功能分析》一文中研究指出蔗糖是高等植物碳水化合物运输和贮藏的主要形式,蔗糖转化酶在蔗糖从“源”(叶)到“库”(块根)的转化过程中起重要作用,细胞壁转化酶是蔗糖代谢过程中的关键酶,在调节韧皮部糖的卸载、控制贮藏器官中糖的组成等方面具有重要作用。木薯是以块根淀粉为主要储能物质,其块根中储藏同化物的量不足叶片中合成同化物的量的五分之一,因此提高蔗糖从叶到块根的转化效率对提高木薯淀粉含量有重大意义。本研究克隆得到了木薯细胞壁酸性转化酶基因MeCWINV1的启动子,通过生物信息学分析和5’末端缺失片段分析,找到了启动子的核心区域,本实验为进一步深入了解木薯细胞壁转化酶基因在淀粉积累过程中的调控模式和信号传递途径,解析它们在木薯淀粉积累过程中的卸载和调控作用打下基础,为培育高淀粉木薯品种提供理论依据。主要结果如下:本实验首次分离得到木薯细胞壁转化酶基因MeCWINV1上游865bp启动子序列,利用生物信息学手段,对其进行了序列分析,结果表明,该启动子序列中含有真核生物启动子特有的CAAT box和TATA box。还包含一些与胁迫相关的顺式作用元件,如光反应元件,干旱诱导元件,热击响应元件,低温响应元件,生长素响应元件,赤霉素响应元件,水杨酸响应元件,ABA响应元件等。根据对启动子序列分析结果,通过实时荧光定量PCR的方法,研究了MeCWINVl基因在生长素(IAA),水杨酸(SA),赤霉素(GA3),茉莉酸甲酯(MeJA),脱落酸(ABA)等5种激素以及42℃高温胁迫,4℃低温胁迫,20%PEG6000干旱胁迫,101M H2O2氧化胁迫这4种不同逆境下的表达模式。结果表明MeCWINV1基因的表达受激素和逆境胁迫的调控,可推断细胞壁转化酶是激素和逆境胁迫中应答机制的重要一员。本实验通过对启动子缺失突变,构建了6段MeCWINV1基因启动子缺失突变植物表达载体。用瞬时表达分析的方法确定其具有启动活性和初步确定了MeCWINV1基因启动子的核心启动子区。再将突变载体转入拟南芥中,通过对转基因拟南芥的GUS定性和定量分析,确定了该启动子主要在叶中表达,其核心启动子位于CW1-4F,核心序列在-476/-326区,具有较强的正调控顺式作用元件,突变启动子CW1-4F到CW1-2F的-749/-476区段内可能存在负调控元件,降低了启动子的活性。(本文来源于《海南大学》期刊2014-05-01)

严丹凤,吴晓慧,耿梦婷,范洁,姚远[7](2014)在《番木瓜酸性转化酶基因家族预测及生物信息学初步分析》一文中研究指出酸性转化酶参与了番木瓜果实中蔗糖的韧皮部卸载,调控果实中糖类的积累。本文利用番木瓜基因组数据库信息,发现了番木瓜基因组中含有6个酸性转化酶基因,分别为细胞壁转化酶基因(CpCWINV1-3)和液泡转化酶基因(CpVINV1-3)。这些基因由3~7个外显子组成,其中CpCWINV1、CpVINV1和CpVINV2的N端均具有一个跨膜区域。蛋白质3D结构预测分析表明,CpCWINV1、CpVINV1和CpVINV2具有典型的N端β-螺旋桨模块(β-propeller module)和C端β-叁明治模块(β-sandwich module),而CpCWINV3和CpVINV3的桨叶I上,均没有保守区NDPNG/A;CpCWINV2和CpVINV3均缺失了β-叁明治模块。推测番木瓜细胞壁转化酶CpCWINV1、液泡转化酶CpVINV1和CpVINV2能正确履行催化蔗糖分解的功能。本研究有助于我们进一步揭示酸性转化酶在番木瓜果实发育及糖类积累过程中的作用。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2014年02期)

夏文睿,刘姣,胡艳平,郭建春,李瑞梅[8](2014)在《木薯细胞壁酸性转化酶MeCWINCV5基因启动子的克隆和序列分析》一文中研究指出[目的]了解MeCWINCV5在植物生长发育、激素调节和逆境胁迫应答中的功能。[方法]采用PCR方法从木薯基因组中分离MeCWINCV5基因启动子序列,考察MeCWINCV5对植物生长发育、激素调节和逆境胁迫应答的影响。[结果]分析显示启动子的长度为1 170 bp,含有TATA box和CAAT box等多个典型的真核生物启动子基本元件元件,还存在大量逆境胁迫诱导相关的顺式调控元件,如HSE、MBS、SARE、GARE-motif和TATC-box等多个与植物逆境胁迫相关的元件。[结论]MeCWINCV5基因启动子与逆境胁迫有关,在木薯抵御逆境胁迫的生理过程中具有重要作用。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2014年11期)

聂元冬,刘洋,顿宝庆,王智,钟海丽[9](2014)在《甜高粱可溶性酸性转化酶基因(SAI-1)cDNA全长克隆及表达分析》一文中研究指出可溶性酸性转化酶(SAI)是甜高粱蔗糖代谢关键调控酶。本研究利用RT-PCR的方法,克隆得到了甜高粱SAI-1基因cDNA全长序列(Genbank No.:KF921516),并利用生物信息学方法对其结构以及蛋白功能进行了分析。结果表明:克隆得到的SAI-1 cDNA序列长2 345 bp,包含一个2 025 bp的编码区、210 bp的5'非翻译区和110 bp的3'非翻译区。其编码674个氨基酸蛋白,预测分子量为73.42 kD,等电点为5.76,蛋白序列含有一个完整的糖基水解酶家族32结构域,具有水解蔗糖的作用。甜高粱茎秆中的SAI-1表达水平在拔节和抽穗期较高,而在开花期后的各个时期均处于较低水平,这与甜高粱糖分积累呈负相关。本研究结果为进一步研究SAI-1基因调控甜高粱糖分含量的分子机制奠定了基础。(本文来源于《分子植物育种》期刊2014年02期)

王丽娟,赵辉,王彦才,丁向真,马建明[10](2014)在《枸杞酸性转化酶基因的克隆及组织表达分析》一文中研究指出以"宁杞1号"枸杞为试材,通过RT-PCR及RACE技术进行枸杞酸性转化酶基因的克隆及组织表达分析,并运用MEGA 5.0软件对植物转化酶基因进行了系统树分析。结果表明:扩增获得2 193bp的枸杞酸性转化酶基因,命名为LbSAI(GenBank:KC776575),该基因推导氨基酸序列与马铃薯、番茄、梨等酸性转化酶基因氨基酸序列同源性为68%~100%;LbSAI编码的蛋白质属于液泡酸性转化酶;Real-time PCR表达分析显示,LbSAI基因在枸杞花中表达量最高,在根中表达水平较低。(本文来源于《北方园艺》期刊2014年01期)

酸性转化酶基因论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

可溶性酸性转化酶(SAI)是蔗糖代谢途径中的关键酶,对植物生长发育起着至关重要的调节作用,研究简捷快速克隆可溶性酸性转化酶基因方法,对于育种材料和品种资源的基因分型具有重要意义。本研究通过已知的高粱可溶性酸性转化酶基因序列及高粱基因组中该基因序列片段,设计引物,比较了分段克隆、基因全长克隆、巢式PCR克隆等方法克隆高粱SAI-1基因的效果,结果表明,直接扩增全长,扩增产物极其不稳定且扩增产物纯化、连接,转化后得不到阳性克隆;采用均等分段克隆,前半段扩增产物纯化、连接转化后得不到阳性克隆,但后半段克隆成功;针对高粱基因组信息中SAI-1基因上游的未知序列部分设计引物,进行单独克隆(635 bp),再单独克隆其其余序列,两段序列拼接后得到SAI-1基因全长。序列分析发现,SAI-1前段635 bp的扩增片段GC含量高达69.6%,而其后GC含量急剧下降至30%以下,所以推测全长克隆、均等片段克隆以及巢式PCR克隆失败的原因可能是SAI-1基因中GC分布不均匀,克隆高粱SAI-1基因较为适宜的方法为利用2对引物进行不均等分段扩增克隆,前段PCR退火温度较后段高1℃。该方法将为其他研究人员提供有益参考。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

酸性转化酶基因论文参考文献

[1].何宇宁.铜胁迫下海州香薷酸性转化酶基因启动子的甲基化研究[D].武汉大学.2017

[2].钟海丽,聂元冬,王智,顿宝庆,李桂英.高粱可溶性酸性转化酶基因(SAI-1)PCR克隆方法[J].植物遗传资源学报.2016

[3].赵建华,李浩霞,尹跃,安巍,王华芳.枸杞酸性转化酶基因的克隆与表达[J].江苏农业学报.2015

[4].雷建武,门惠芹,李浩霞,尹跃,赵建华.枸杞果实酸性转化酶基因生物信息学分析[J].宁夏农林科技.2014

[5].刘姣,胡艳平,周扬,李瑞梅,段瑞军.木薯细胞壁酸性转化酶基因MeCWINV1启动子的克隆及其在烟草中的瞬时表达分析[J].分子植物育种.2014

[6].胡艳平.木薯细胞壁酸性转化酶基因MeCWINV1启动子的克隆与功能分析[D].海南大学.2014

[7].严丹凤,吴晓慧,耿梦婷,范洁,姚远.番木瓜酸性转化酶基因家族预测及生物信息学初步分析[J].基因组学与应用生物学.2014

[8].夏文睿,刘姣,胡艳平,郭建春,李瑞梅.木薯细胞壁酸性转化酶MeCWINCV5基因启动子的克隆和序列分析[J].安徽农业科学.2014

[9].聂元冬,刘洋,顿宝庆,王智,钟海丽.甜高粱可溶性酸性转化酶基因(SAI-1)cDNA全长克隆及表达分析[J].分子植物育种.2014

[10].王丽娟,赵辉,王彦才,丁向真,马建明.枸杞酸性转化酶基因的克隆及组织表达分析[J].北方园艺.2014

论文知识图

细胞壁酸性转化酶基因在不同部...细胞壁酸性转化酶基因在不同生...苹果液泡酸性转化酶基因部分序...马铃薯酸性转化酶基因和内参基因...胡麻、拟南芥、水稻、玉米和大豆中~#...温州蜜柑液泡酸性转化酶基因部...

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