基于DNA条形码的川贝母及其近缘种的分子鉴定与亲缘关系研究

论文摘要

基于ITS2与psbA-trnH条形码序列,对川贝母及其近缘种开展分子生物学鉴定与亲缘关系研究。本文在采用《中国药典》规定的PCR-RFLP鉴定方法对川贝母及其近缘种的鉴定基础上,扩增所有样品的ITS2及psbA-trnH条形码序列,对其遗传距离进行分析,构建进化树,评价ITS2及psbA-trnH条形码的鉴定效果,探讨样品的亲缘关系。结果显示, PCR-RFLP方法仅能将样品分为非酶切组（包括平贝母、浙贝母及伊犁贝母）与酶切组（包括浓蜜贝母、中华贝母、康定贝母、长腺贝母与川贝母）。进一步获得川贝母与其近缘种的ITS2与psbA-trnH序列,发现ITS2序列长度为235～239 bp,种内和种间平均遗传距离为0.001和0.022, NJ树能够将样品分为"北方贝母群"（包括平贝母与伊犁贝母）与"南方贝母群"（包括浙贝母、浓蜜贝母、中华贝母、康定贝母、长腺贝母和川贝母）。后者又可细分为浙贝母与"川贝母复合群",其中"川贝母复合群"中的贝母品种具有相近的亲缘关系。psbA-trnH序列长度为337～373 bp,种内及种间的遗传距离为0.263和0.329, NJ树未能有效聚类。说明ITS2条形码序列不仅能够对川贝母及其部分近缘种进行快速、准确地鉴定,还能够清晰不同贝母种之间的亲缘关系,这为川贝母分子标记的开发、药用植物资源的有效保护和合理开发利用提供了重要的理论依据。

论文目录

• 材料与方法
• 结果与分析
•   1 RFLP-PCR测定
•   2 ITS2与psbA-trnH序列特征及种间、种内遗传距离分析
•   3 ITS2序列与psb A-trn H序列NJ进化树分析
• 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 郑辉,邓楷煜,陈安琪,付绍兵,周德,王威威,倪典墨,任瑶瑶,周嘉裕,廖海

关键词: 川贝母,条形码

来源: 药学学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 中药学

单位: 西南交通大学生命科学与工程学院,阿坝州食品药品检验所

基金: 国家自然科学基金资助项目(31500276),四川省应用基础研究项目(2017JY0222),四川省重点研发项目(2018SZ0061),成都市科技技术研发项目(2016-HM01-00260-SF),四川省中医药管理局项目(2016Z013),国家级大学生创新创业计划(201910613082),西南交通大学个性化实验(GX201913084)

分类号: R282.5

DOI: 10.16438/j.0513-4870.2019-0514

页码: 2326-2334

总页数: 9

文件大小: 2029K

下载量: 546