微卫星标记论文_何勇凤,朱永久,吴兴兵,龚进玲,杨德国

导读:本文包含了微卫星标记论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:标记,多样性,紫花苜蓿,线粒体,效果,亲子鉴定,多态性。

微卫星标记论文文献综述

何勇凤,朱永久,吴兴兵,龚进玲,杨德国[1](2019)在《基于微卫星标记的圆口铜鱼亲子鉴定技术》一文中研究指出为快速有效地鉴别不同的圆口铜鱼家系及来源,研究从已发表的40个微卫星标记中筛选出20个多态性较高且稳定扩增的微卫星位点,通过对8个圆口铜鱼家系339尾个体进行微卫星基因分型检测,建立了圆口铜鱼荧光微卫星标记与多重毛细管电泳相结合的亲子鉴定技术。遗传多样性分析结果显示,圆口铜鱼8个家系群体的平均等位基因数(N_a)为9个,平均多态信息含量(PIC)为0.616,平均期望杂合度(H_e)为0.659,平均观测杂合度(H_o)为0.691,其中子一代群体的遗传多样性水平明显低于亲本群体。亲子鉴定分析结果显示,当双亲基因型未知时其单亲累积排除概率(CE-1P)为0.99954473,当单亲基因型已知时其累积排除概率(CE-2P)为0.99999825,当双亲基因型未知时其双亲累积排除概率(CE-PP)为1.00000000,当使用20个微卫星位点进行亲子鉴定时, 297尾子一代均能正确找到其父母本,亲子鉴定准确率为100%。由此可见,研究建立的圆口铜鱼亲子鉴定技术是可靠的,能为圆口铜鱼的家系管理、种群遗传管理和增殖放流效果评估提供科学依据(本文来源于《水生生物学报》期刊2019年06期)

曾可为,宋文,王青云,夏儒龙,王守荣[2](2019)在《基于微卫星标记的鳜种质遗传多样性与群体遗传结构分析》一文中研究指出采用Illumina高通量测序技术对鳜(Siniperca chuatsi)性腺转录组进行分析,筛选获得可设计引物的微卫星序列4 986条。随机合成239对微卫星引物,其中27个微卫星标记(11.30%)在12个鳜群体中呈现多态性,等位基因数2~8(5.63±1.84),有效等位基因数1.86~6.80(3.99±1.56),观测杂合度0.21~0.78(0.49±0.16),期望杂合度0.46~0.85(0.71±0.12),平均多态信息量0.37~0.84(0.66±0.15),基因流0.11~2.14(0.67±0.45)。在12个鳜群体中,嘉鱼群体平均等位基因数和平均有效等位基因数最大;武汉群体平均观测杂合度、平均期望杂合度高;12个群体遗传距离为0.103 0~1.511 7,遗传相似系数为0.220 5~0.902 2;抚远群体和顺德群体间的遗传距离最大(1.511 7),遗传相似系数最小(0.220 5);韶关群体和顺德群体间的遗传距离最小(0.103 0),遗传相似系数最大(0.902 2);UPGMA聚类分析显示珠江水系一支与长江水系一支先聚集后再与黑龙江水体支汇聚;12个群体间的遗传分化系数F_(ST)介于0.041 8~0.611 0,群体间的遗传分化达到了显着性水平(P<0.05),梁子湖群体与武汉群体间的F_(ST)最小(0.041 8),顺德群体与抚远群体间的F_(ST)最大(0.611 0);AMOVA分析表明:群体间的遗传变异占33.14%,群体内遗传变异占66.86%;Structure分析显示12个群体可分为5个亚群。(本文来源于《华中农业大学学报》期刊2019年06期)

冯晓婷,杨习文,杨雪军,刘熠,周彦锋[3](2019)在《基于微卫星标记对长江江苏段鳙增殖放流效果评估》一文中研究指出为评估长江江苏段鳙(Aristichthysnobilis)增殖放流效果,本研究基于微卫星标记的亲子鉴定技术,选用10对扩增效果稳定的微卫星荧光标记引物,结合毛细管电泳对江苏省内良种场563尾鳙亲鱼和长江江苏段687尾回捕鳙进行基因分型,并对位点多态性及亲子鉴定结果进行了分析。结果表明,各位点等位基因介于19~55之间,其观测杂合度为0.530~0.909(平均值为0.748),期望杂合度为0.818~0.929(平均值为0.882),多态性信息含量为0.797~0.924 (平均值为0.871); Cervus3.0模拟结果显示,当双亲未知且置信度为95%时, 10个微卫星位点的累积非亲权排除率为99.996%。亲子鉴定结果发现,所有回捕鳙中有42尾与亲本之间存在亲子关系,被确认来源于鳙增殖放流群体,并由此推算此次评估亲本的放流子代对长江江苏段野生群体的贡献率为6.11%。结果显示该研究进行的鳙亲子鉴定技术可为长江鳙增殖放流效果评估工作提供可靠的数据支撑,为长江渔业资源管理提供参考资料。(本文来源于《中国水产科学》期刊2019年06期)

王小山,王炳盛,刘隆阳[4](2019)在《紫花苜蓿微卫星(SSR)标记技术在草学本科遗传学实验教学中的应用》一文中研究指出科研与教学相结合,以科研促进教学,是高等教育教学改革的重要内容之一。目前,草学本科专业的遗传学实验教学仍然以传统的验证和示范性实验为主,而与草类植物研究相结合的综合性、设计性实验较少,使当前教学与科研实际相脱节,学生科研思维及实验技能得不到训练和提高。笔者以多年的草类植物分子标记研究为基础,将微卫星分子标记与紫花苜蓿(Medicago sativa)的遗传特性研究相结合,在实验过程中学生掌握了紫花苜蓿微卫星分子标记、DNA提取、PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳等的原理和方法,同时实验引入分子遗传学的相关概念和方法,研究了紫花苜蓿的遗传特性,从而达到了培养学生综合运用知识、分析、解决和探索科学问题的能力。(本文来源于《草学》期刊2019年05期)

阙延福,胥贤,徐念,黄晋,李伟涛[5](2019)在《基于微卫星标记的唇■亲子鉴定技术研究》一文中研究指出为进一步研究基于标记的唇■Hemibarbus labeo苗种放流效果评估工作,以安谷水电站鱼类增殖放流站实际工作中的两个唇■家系为研究对象,采用6个多态性微卫星标记对两个唇■家系开展了亲子关系鉴定分析。结果显示:6个微卫星标记共检测出37个等位基因,观测杂合度和期望杂合度分别为0.361~0.952(平均值为0.776)和0.302~0.795(平均值为0.589);多态信息含量为0.262~0.767(平均值为0.526);Cervus软件分析显示,在双亲均未知的情况下,唇■6个微卫星位点的累计非亲权排除率(CEP)为99.09%;两个家系中的72个子代个体,正确分配到对应家系父母本(12个亲本)的总体比例为95.83%。研究表明,本研究中采用微卫星标记方法来开展唇■家系亲子鉴定的分析,可为唇■的增殖放流效果评估提供技术支撑。(本文来源于《大连海洋大学学报》期刊2019年05期)

黄英飞,莫国东,吴强,孙俊丽,周志扬[6](2019)在《利用微卫星标记和线粒体mtDNA D-loop区分析龙胜凤鸡遗传多样性》一文中研究指出试验利用微卫星标记和线粒体mtDNA D-loop区分析龙胜凤鸡的遗传多样性及其品种资源的保种效果,进而更好的保护和利用。在龙胜凤鸡保种群中随机抽取30只血样,采用PCR和直接测序的方法测定mtDNA D-loop序列。结果表明:18对微卫星检测中,龙胜凤鸡的多态信息含量PIC平均为0.5869,4个中度多态位点,14个高度多态位点;线粒体mtDNA D-loop区中,共发现9种单倍型,21个变异位点,变异方式主要是转换,未发现缺失;核苷酸多样度为(0.01129±0.00349),单倍型多态度为(0.5150±0.1110);在NJ系统发生树上,分为3大类群,则具有3个血统来源,结果显示龙胜凤鸡具有比较丰富的遗传多样性和较低的变异程度,说明采用家系保种法对龙胜凤鸡进行保种,方法有效可行。(本文来源于《畜牧兽医科学(电子版)》期刊2019年18期)

丁勇,尚金男,徐怡亮,丁月云,崔文竹[7](2019)在《利用微卫星标记分析安徽地方种猪的遗传多样性》一文中研究指出【目的】通过微卫星标记评估8个安徽地方猪品种的遗传多样性。【方法】采用PCR和聚丙烯酰胺凝胶电泳对FAO-ISAG联合推荐的15个微卫星标记进行分型,并计算有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、F统计量和遗传距离等参数,探讨品种间的遗传多样性和遗传关系。【结果】15个微卫星标记共检测到272个等位基因,平均有效等位基因数9.561 2个。8个品种的有效等位基因数在2.445 1~3.786 6之间,期望杂合度在0.532 0~0.714 8之间,多态信息含量在0.369 8~0.890 6之间。F统计量和基因流(Nm)分析表明:安徽地方猪品种间存在一定程度的近交和基因流动。基于Nei氏遗传距离(Ds)构建系统发生树显示:8个地方猪种可分为两类:一类为皖南花猪;另一类又聚为两小支,一小支为安庆六白猪、圩猪和霍寿黑猪,另一小支为皖北猪、皖南黑猪、枞阳黑猪和定远猪。【结论】8个安徽地方猪种遗传多样性丰富,群体内存在一定程度的近交和基因流动。结果为安徽地方猪种的保护和利用提供了理论依据。(本文来源于《云南农业大学学报(自然科学)》期刊2019年05期)

陈孝梅,王康,张文文,高夫超,王志[8](2019)在《采用微卫星DNA标记分析东北黑蜂小群保种效果》一文中研究指出本研究利用16对荧光标记微卫星引物分析国家蜜蜂基因库(吉林)保种群体东北黑蜂的小群保种效果,为进一步保护和利用东北黑蜂遗传资源提供理论依据。分别选取国家蜜蜂基因库(吉林)保种群体和国家级东北黑蜂保护区(原产地)群体东北黑蜂各30头,利用测定优势等位基因频率(Pi)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和群体内近交系数(F_(is))比较基因库保种群体与原产地群体的遗传差异。两群体间东北黑蜂的Pi、He、PIC和F_(is)均没有显着差异(P>0.05)。国家蜜蜂基因库(吉林)对东北黑蜂群体保种效果良好,异地小群保种的方法对东北黑蜂具有潜在可行性。(本文来源于《环境昆虫学报》期刊2019年05期)

商鹏,郭新颖,张健,吴绿草,段梦琪[9](2019)在《藏马微卫星标记遗传多样性研究》一文中研究指出为研究西藏藏马种群的微卫星多态性,应用生物素标记的微卫星探针与藏马基因组酶切片段杂交,通过链霉亲和素包被的磁珠捕获150~1 000 bp含有微卫星序列的DNA片段,连接到pEASY-T1载体中,构建藏马基因组微卫星富集文库。结果表明:从2 380个转化子中随机挑取112个阳性克隆进行测序后,经筛选比对发现,从62个微卫星中筛选出39个在马属基因组卫星库中未被检测到的微卫星;成功设计了10对藏马微卫星引物,经聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法检测到3个具有多态性的微卫星标记,其中有2个多态性信息含量(PIC)值均大于0.5。因此,这3个微卫星标记可应用于藏马遗传多态性检测、种群遗传结构等方面研究,为藏马遗传连锁图谱的构建、辅助育种、群体遗传学分析、基因组结构分析以及分子进化研究等提供依据。(本文来源于《中国农业大学学报》期刊2019年09期)

杨慧凌,孟洁敏,徐冬冬,王韵,杜冰[10](2019)在《19个微卫星DNA标记多态性与食管鳞状细胞癌的相关性分析》一文中研究指出目的观察并分析19个微卫星DNA遗传标记多态性与食管鳞状细胞癌(食管癌)的相关性。方法采用聚合酶链反应法结合毛细管电泳技术对2017-2018年上半年在川北医学院附属医院经病理切片证实,取材前未经放、化疗的80例食管癌患者(病例组)肿瘤组织和200例健康个体(对照组)静脉血进行19个常用微卫星DNA基因座的多态性分析,同时对照组检验基因平衡(H-W),并对2组19个微卫星DNA基因座(D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、PentaE、TPOX、TH01、D2S1338、CSF1PO、PentaD、VWA、D21S11、D18S51、D6S1043、D8S1179、D5D818、D12S391、FGA)等位基因频率分布的差异进行统计学分析。结果对照组研究对象19个微卫星DNA基因座位点的分布符合H-W定律;病例组患者D5S818、FGA基因座微卫星DNA多态性分布与对照组比较,差异均有统计学意义(P<0.05);病例组患者D5S818-13、FGA-20频率均明显高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论 D5S818-13附近区域可能存在食管癌易感基因,FGA-20与食管癌相关,其附近可能存在食管癌易感基因。(本文来源于《现代医药卫生》期刊2019年16期)

微卫星标记论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

采用Illumina高通量测序技术对鳜(Siniperca chuatsi)性腺转录组进行分析,筛选获得可设计引物的微卫星序列4 986条。随机合成239对微卫星引物,其中27个微卫星标记(11.30%)在12个鳜群体中呈现多态性,等位基因数2~8(5.63±1.84),有效等位基因数1.86~6.80(3.99±1.56),观测杂合度0.21~0.78(0.49±0.16),期望杂合度0.46~0.85(0.71±0.12),平均多态信息量0.37~0.84(0.66±0.15),基因流0.11~2.14(0.67±0.45)。在12个鳜群体中,嘉鱼群体平均等位基因数和平均有效等位基因数最大;武汉群体平均观测杂合度、平均期望杂合度高;12个群体遗传距离为0.103 0~1.511 7,遗传相似系数为0.220 5~0.902 2;抚远群体和顺德群体间的遗传距离最大(1.511 7),遗传相似系数最小(0.220 5);韶关群体和顺德群体间的遗传距离最小(0.103 0),遗传相似系数最大(0.902 2);UPGMA聚类分析显示珠江水系一支与长江水系一支先聚集后再与黑龙江水体支汇聚;12个群体间的遗传分化系数F_(ST)介于0.041 8~0.611 0,群体间的遗传分化达到了显着性水平(P<0.05),梁子湖群体与武汉群体间的F_(ST)最小(0.041 8),顺德群体与抚远群体间的F_(ST)最大(0.611 0);AMOVA分析表明:群体间的遗传变异占33.14%,群体内遗传变异占66.86%;Structure分析显示12个群体可分为5个亚群。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

微卫星标记论文参考文献

[1].何勇凤,朱永久,吴兴兵,龚进玲,杨德国.基于微卫星标记的圆口铜鱼亲子鉴定技术[J].水生生物学报.2019

[2].曾可为,宋文,王青云,夏儒龙,王守荣.基于微卫星标记的鳜种质遗传多样性与群体遗传结构分析[J].华中农业大学学报.2019

[3].冯晓婷,杨习文,杨雪军,刘熠,周彦锋.基于微卫星标记对长江江苏段鳙增殖放流效果评估[J].中国水产科学.2019

[4].王小山,王炳盛,刘隆阳.紫花苜蓿微卫星(SSR)标记技术在草学本科遗传学实验教学中的应用[J].草学.2019

[5].阙延福,胥贤,徐念,黄晋,李伟涛.基于微卫星标记的唇■亲子鉴定技术研究[J].大连海洋大学学报.2019

[6].黄英飞,莫国东,吴强,孙俊丽,周志扬.利用微卫星标记和线粒体mtDNAD-loop区分析龙胜凤鸡遗传多样性[J].畜牧兽医科学(电子版).2019

[7].丁勇,尚金男,徐怡亮,丁月云,崔文竹.利用微卫星标记分析安徽地方种猪的遗传多样性[J].云南农业大学学报(自然科学).2019

[8].陈孝梅,王康,张文文,高夫超,王志.采用微卫星DNA标记分析东北黑蜂小群保种效果[J].环境昆虫学报.2019

[9].商鹏,郭新颖,张健,吴绿草,段梦琪.藏马微卫星标记遗传多样性研究[J].中国农业大学学报.2019

[10].杨慧凌,孟洁敏,徐冬冬,王韵,杜冰.19个微卫星DNA标记多态性与食管鳞状细胞癌的相关性分析[J].现代医药卫生.2019

论文知识图

引物MM007在鮸鱼和大黄鱼中扩增序列的...个位点在6个个体中扩增结果;M.DNA...一16染色体lp22.1一lqZ区域的多点连锁分...技术流程示意图标记在自动荧光检测系统中的检测结果家系A亲本与对照组及雌核发育二倍...

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