枣食芽象甲线粒体基因组全序列测定与系统发育分析

论文摘要

【目的】从线粒体基因组水平上探讨枣食芽象甲Scythropus yasumatsui与近缘种的系统发育关系。【方法】利用Illumina MiSeq测序平台对枣食芽象甲线粒体基因组进行测序,对基因组序列进行拼装、注释和特征分析;利用贝叶斯法和最大似然法构建基于象甲科13个物种的线粒体基因组13个蛋白质编码基因核苷酸序列的系统发育树。【结果】结果表明,枣食芽象甲线粒体基因组全长为16 472 bp（GenBank登录号:MF807224）,包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和2个非编码控制区,37个基因的排列顺序与祖先昆虫的线粒体基因排列顺序一致。13个蛋白质编码基因的起始密码子为ATN,其中除了cob和nad1基因的完全终止密码子为TAG外,其余11个基因的完全终止密码子为TA（A）。22个tRNA基因中除了trnS1缺少DHU臂,反密码子由GCT变为TCT外,其余均能形成典型的三叶草结构。基于13个蛋白质编码基因序列构建的系统发育树结果显示,象甲科8个亚科系统发育关系为:（（（隐喙象亚科（Cryptorhynchinae）+（象虫亚科（Curculioninae）+魔喙象亚科（Molytinae）））+长小蠹亚科（Platypodinae））+（粗喙象亚科（Entiminae）+Cyclominae亚科））+隐颏象亚科（Dryophthorinae）+小蠹亚科（Scolytinae）)。【结论】在13种象甲科昆虫物种中,同属于粗喙象亚科的枣食芽象甲与南美果树象甲Naupactus xanthographus在系统发育树中聚为同一分支,表明基于线粒体基因组全序列的分子系统发育结果与传统的形态分类结果是一致的。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 供试材料
•   1.2 枣食芽象甲线粒体基因组序列测定
•   1.3 序列注释及特征分析
•   1.4 系统发育分析
• 2 结果
•   2.1 枣食芽象甲线粒体基因组结构
•   2.2 枣食芽象甲线粒体基因组蛋白质编码基因
•   2.3 枣食芽象甲线粒体基因组tRNA基因和rRNA基因
•   2.4 枣食芽象甲线粒体基因组控制区
•   2.5 象甲科13个物种的系统发育分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张锋,洪波,王远征,李英梅,陈志杰

关键词: 鞘翅目,象甲科,枣食芽象甲,近缘种,线粒体基因组,蛋白质编码基因,系统发育

来源: 昆虫学报 2019年11期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学

单位: 陕西省生物农业研究所,陕西省酶工程技术研究中心

基金: 陕西省科技统筹创新工程项目(2013KTZB-03-01),陕西省科学院重大科技项目(2013K-02)

分类号: Q963

DOI: 10.16380/j.kcxb.2019.11.008

页码: 1305-1314

总页数: 10

文件大小: 3926K

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