杨树和柳树SBP基因的鉴定与进化分析

论文摘要

SBP基因在植物中普遍且特异存在,主要调控花的形成及其后期发育、叶的形态建成和环境信号应答等诸多方面。然而,目前还没有对杨柳科植物SBP基因进行全面而系统的分析。依据生物信息学方法,分别从红皮柳、美洲黑杨和毛果杨中鉴定出30、33和29个SBP基因,这些基因在各自物种的染色体上的分布情况和数目非常类似,表现出很近的遗传关系。几乎每个基因在基因组内和基因组间都存在多个同源基因,它们的K_a/K_s比值大多数均小于1,说明这些基因在复制后发生了纯化选择,基因功能较保守。只有12对基因的K_a/K_s比值大于1,在进化中受正向选择。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 分析数据获取及杨树和柳树SBP基因家族的鉴定
•   1.2 SBP基因家族染色体定位、基因结构、共线性分析及计算
•   1.3 SBP蛋白质结构域分析以及系统发育分析
• 2 结果与分析
•   2.1 红皮柳、毛果杨、美洲黑杨SBP基因家族鉴定、染色体分布及结构分析
•   2.2 红皮柳、毛果杨、美洲黑杨SBP基因家族共线性分析以及Ka/Ks
•   2.3 红皮柳、美洲黑杨和毛果杨SBP蛋白性质及保守结构域分析
•   2.4 红皮柳、美洲黑杨和毛果杨SBP家族系统发育分析
• 3 讨论
•   3.1 SpSBP30、PdSBP30-33基因的染色体定位
•   3.2 红皮柳、美洲黑杨和毛果杨SBP基因的进化
•   3.3 红皮柳、毛果杨、美洲黑杨SBP蛋白功能预测
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 赵永斌,刘强,刘剑锋,张兴政

关键词: 杨树,柳树,基因,进化

来源: 东北林业大学学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 林业

单位: 吉林师范大学

基金: 国家自然科学基金项目(31770723)

分类号: S792.11;S792.12

DOI: 10.13759/j.cnki.dlxb.2019.12.006

页码: 33-40

总页数: 8

文件大小: 7567K

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