日本血吸虫虫卵分泌物小RNA的高通量测序

日本血吸虫虫卵分泌物小RNA的高通量测序

论文摘要

目的通过对日本血吸虫虫卵分泌物(egg secreted products,ESP)的小RNA进行高通量测序,分析、鉴定已知miRNA的表达水平。方法提取日本血吸虫虫卵ESP miRNA进行高通量测序;通过对数据分析包括统计长度分布与比对注释,鉴定已知miRNA的表达水平。结果将构建文库中日本血吸虫虫卵ESP表达的miRNA与最新miRBase数据库中的miRNA比对,发现在鉴定的12个miRNAs中,sja-miR-3488为表达量最高的miRNA,其次为sja-miR-36-3p和sja-miR-71a,上述三种miRNA表达量占比91.8%。结论日本血吸虫虫卵ESP三个miRNAs(sja-miR-3488、sja-miR-36-3p和sja-miR-71a)的鉴定为下一步探寻血吸虫病诊疗新靶标奠定了基础。

论文目录

  • 材料与方法
  •   一、日本血吸虫ESP制备
  •   二、ESP总RNA制备
  •   三、测序文库构建和RNA高通量测序
  •   四、原始数据预处理、数据过滤及长度分布统计
  •   五、比对注释,鉴定已知miRNA
  •   六、miRNA表达水平
  • 结 果
  •   一、总RNA提取质量评估
  •   二、原始数据预处理、数据过滤
  •   三、比对注释及miRNA表达
  • 讨 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 徐桂娜,何雪梅,周晓蓉,曾凡胜,秦志强

    关键词: 高通量测序,日本血吸虫,虫卵分泌物

    来源: 热带病与寄生虫学 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 基础医学

    单位: 益阳市洞庭湖区血吸虫与病原生物控制技术重点实验室益阳医学高等专科学校,湖北省疾病预防控制中心,中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所世界卫生组织热带病合作中心

    基金: 上海市自然科学基金(17ZR1433300),益阳市科技局创新平台与人才计划(2018年),益阳市社科基金(2016YS57)

    分类号: R383.24

    页码: 210-213

    总页数: 4

    文件大小: 1170K

    下载量: 42

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