导读:本文包含了开放阅读框架论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,框架,病毒,序列,分枝,哺乳动物,细胞。
开放阅读框架论文文献综述
张维谊,鞠厚斌,刘健,刘佩红,周锦萍[1]（2010）在《上海及新疆地区猪戊型肝炎病毒开放阅读码框架2序列的克隆与分析》一文中研究指出通过已建立的动物戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)RT-nPCR方法,检测上海地区和新疆地区猪群样品。扩增HEV开放读码框架2(open reading frame 2,ORF2)保守区,产物为507 bp。经克隆、测序,获得20株上海株、3株新疆株序列,采用分子生物学软件与47株已知HEV进行同源性、进化关系分析。结果23株序列从同源性比对和进化关系分析均属HEVⅣ型,上海株间507 bp的核苷酸同源性为94.1%~100.0%,与上海猪源(DQ450072)、日本人源Japan1(AB369690)亲缘关系近;3株新疆株507 bp间的核苷酸同源性为86.1%~98.2%,与新疆猪源China SW1(AY594199)、中国人源T1株(AJ272108)亲缘关系近;上海株与新疆株间的核苷酸同源性为82.6%~100.0%,提示上海株与新疆株间存在差异。23株HEV在时间和地域关系分析,提示不同年份的新疆株存在差异,同年份不同猪场的新疆株进化关系存在差异,不同年份、不同区县的上海株进化关系也存在差异。(本文来源于《中国动物传染病学报》期刊2010年04期）
赵朝霞,李宏[2]（2009）在《哺乳动物基因非翻译区开放阅读框架的分析》一文中研究指出在所分析的5’UTR序列中约19%的序列在阅读框1下含有AUG,约22%和24%的序列分别在阅读框2和阅读框3下含有AUG,而在3’UTR序列当中,无论是在哪个阅读框下,约71%含有AUG.这些AUG绝大多数都是以小ORF的形式出现的;分析小ORF序列以及与它们相应的IC序列(阅读框间序列)长度,发现虽然3’UTR序列远远长于5’UTR序列,但是它们所包含的小ORF长度几乎没有差距,只是平均来说每一条3’UTR序列所包含的小ORF数量明显多于每一条5’UTR序列所包含的小ORF数量,而且dIC(下游阅读框间序列)比uIC(上游阅读框间序列)长很多,平均长50个碱基;第二类IC序列(UTR区相邻的两个阅读框之间的序列)的平均长度比其它两类IC序列(UTR区最后一个阅读框之后的序列)的平均长度小,而且又含有相对较多的终止密码;比较uORF序列与dORF序列密码子使用偏好的CAI值发现,尽管相差不大,但是无论在哪个阅读框下,uORF序列的CAI值都显着高于dORF序列的CAI值.(本文来源于《内蒙古大学学报(自然科学版)》期刊2009年05期）
赵朝霞[3]（2009）在《哺乳动物基因非翻译区开放阅读框架的分析》一文中研究指出真核生物mRNA非翻译区(UTR)阅读框架在基因翻译水平上具有重要的调控作用。论文统计了哺乳动物12991条5'UTR序列所含的上游开放阅读框架(uORF)和15319条3'UTR序列所含的下游开放阅读框架(dORF)的各种序列特性,讨论了uORF作为可能的基因调控元件,不同于dORF的一些序列特征。在所分析的5'UTR序列中约19%的序列在阅读框1下含有AUG,约22%和24%的序列分别在阅读框2和阅读框3下含有AUG。在这些AUG当中,在阅读框1下,86%的AUG是以uORF的形式出现的,在阅读框2和阅读框3下分别是71%和70%。而在所分析的3'UTR序列当中,无论是在哪个阅读框下,约71%含有AUG,其中约85%的AUG是以dORF的形式出现的;分析uORF序列和dORF序列以及与它们相应的uIC序列(上游阅读框间序列)和dIC序列(下游阅读框问序列)长度,发现虽然3'UTR序列远远长于5'UTR序列,但是它们所包含的dORF和uORF长度几乎没有差距,只是平均来说每一条3'UTR序列所包含的dORF数量明显多于每一条5'UTR序列所包含的uORF数量,而且dIC比uIC长很多;uIC序列长度和其相应的uORF序列长度之间不存在显着的相关性,但dIC序列长度和其相应的dORF序列长度之间具有极显着的正相关关系。如果将阅读框间序列(intersictronic sequence,IC序列)分为比其相应的uORF(dORF)长和短的两种情况,无论是uORF与uIC之间的相关性还是dORF与dIC之间的相关性都达到极显着水平。第二类IC序列(UTR区相邻的两个阅读框之间的序列)的平均长度比其它两类IC序列(UTR区最后一个阅读框之后的序列)的平均长度小;uIC序列和dIC序列单碱基含量及终止密码子含量都存在很大的区别;uORF和dORF起始密码子两端序列与kozak序列有一定的差距:比较uORF序列与dORF序列密码子使用偏好的CAI值发现,uORF序列的CAI值显着高于dORF序列的CAI值。(本文来源于《内蒙古大学》期刊2009-05-17）
赵秀英,李瑞山,黄加庆,陈志伟,伍辉[4]（2006）在《中国人艾滋病毒感染者及健康人群人类免疫缺陷病毒CCR5开放阅读框架区天然突变的对比研究》一文中研究指出目的研究中国人群CCR5基因开放阅读框架(ORF)区突变并分析其对中国人人类免疫缺陷病毒(HIV)传播和致病的影响。方法研究对象为居住在香港特区的1099名成年中国人,其中785名为HIV阴性健康人,314例为确诊HIV感染的患者。首先对CCR5 ORF进行测序,确定并分析CCR5突变在人群的分布。再对突变G106R、Δ32、R223Q、299(FS)和S3361体外克隆,研究其表达及作为HIV辅助受体功能的改变。结果在CCR5 ORF共检测到10个突变位点。其中7个为有意义突变;突变R223Q是发生频率最高的突变,在正常人是4．7％,在HIV感染者是4．5％;其余CCR5 ORF突变发生频率均＜1％; R223Q位于CCR5膜内区,不影响其作为HIV辅助受体的功能;S336I位于CCR5的C端,同样不影响其功能;突变G106R位于CCR5第3跨膜区,实验显示其辅助受体功能受到明显影响。结论CCR5 ORF突变在中国人群较为常见,一些突变明显影响其作为HIV辅助受体的功能,但在流行病学范围内对HIV感染及致病的影响不明显。(本文来源于《微生物与感染》期刊2006年04期）
丛宪玲,田亚萍,陈越,王丽颖,于永利[5]（2005）在《人乳头瘤病毒6型E7基因完整开放阅读框架的克隆和鉴定》一文中研究指出目的从尖锐湿疣病变组织中克隆人乳头瘤病毒6型(HPV6)E7基因,为HPV感染的检测及基因工程疫苗的研制奠定基础。方法以临床尖锐湿疣标本总DNA为模板,采用聚合酶链反应(PCR)技术,从尖锐湿疣病变组织中扩增出人乳头瘤病毒6型E7基因完整开放阅读框架,并插入载体PMD-18T中构建重组质粒,转化JM109中扩增,进行酶切及测序分析。结果测序结果证实克隆成功。结论该实验为研究人乳头瘤病毒E7蛋白的免疫学和流行病学特点创造了条件,也为下一步制备HPV6型疫苗奠定了基础。(本文来源于《中国实验诊断学》期刊2005年06期）
何于娟,张彦,刘小珊,马凌娣,欧一衡[6]（2004）在《未知基因KH开放阅读框架真核表达载体的构建及其对K562细胞增殖的影响》一文中研究指出目的 :构建未知基因KH的开放阅读框架 (openreadingframe,ORF)的真核表达体系 ,初步探讨未知基因KH的功能。方法 :采用DNA重组技术将KH基因片段的开放阅读框架 (KH -ORF)亚克隆于表达载体 pCl-neoMammalianExpres sionVector,重组为pCI-neo -KH -ORF真核表达体系 ,脂质体转染K5 6 2细胞 ,RT -PCR检测目的基因KH的表达。采用体外培养技术 ,通过 pCI -neo -KH -ORF质粒转染K5 6 2细胞前后的生长曲线和乳酸脱氢酶活性测定观察KH -ORF对K5 6 2细胞增殖速度的影响。结果 :KH -ORF在K5 6 2细胞中获得表达 ,对细胞增殖速度有明显影响。结论 :KH -ORF表达产物可能是一个与K5 6 2细胞增殖有关的功能蛋白质 ,KH基因可能是一个具有生物学功能的白血病未知基因(本文来源于《重庆医科大学学报》期刊2004年05期）
何于娟,欧一衡,张彦,刘小珊,马凌娣[7]（2004）在《K562细胞未知基因KH的开放阅读框架在大肠杆菌中的表达》一文中研究指出目的 :构建K5 6 2细胞未知基因KH的开放阅读框架 (openreadingflame ,ORF)的原核表达体系。 方法 :采用DNA重组技术构建KH基因片段的开放阅读框架 (KH -ORF)的表达载体pCI-neo-KH -ORF ,热休克法转化大肠杆菌BL2 1(DE3)plysS ,IPTG诱导后 ,SDS -PAGE鉴定目的蛋白的表达。结果 :经IPTG诱导 0 .5h后KH -ORF在BL2 1(DE3)plysS中获得表达 ,表达产物以包涵体形式存在 ,分子产量约 2 4kD。结论 :成功构建了KH -ORF的原核表达体系 ,为进一步研究其功能奠定了基础。(本文来源于《重庆医科大学学报》期刊2004年02期）
乐军[8]（2002）在《蛋白质组学发现结核分枝杆菌H37Rv基因组学未预测的开放阅读框架》一文中研究指出每年结核病的新发病例为800万,病死人数200万,世界卫生组织宣布全球结核病处于紧急状态,亟需预防和治疗结核病的新策略。蛋白质组学反映细胞对环境刺激的功能状态,因此它可作为基因组学有价值的补充。为了寻找免疫干预的新策略,通过比较结核分枝杆菌(MTB)有毒株与无毒疫苗株之间蛋白质组成的差异进行系统蛋白质组的研究。(本文来源于《国外医学(微生物学分册)》期刊2002年06期）
马军,闫晓彩,来宝长,王一理,司履生[9]（2001）在《人乳头瘤病毒11型E6基因完整开放阅读框架的克隆和鉴定》一文中研究指出目的 为构建人乳头瘤病毒 1 1型 (HPV1 1 )DNA疫苗 ,从尖锐湿疣病变组织中克隆疫苗靶基因E6。方法 利用改良提取染色体外游离DNA的方法制备模板DNA ,采用聚合酶链反应(PCR)技术进行基因克隆。结果 从病变组织中扩增出了全长人乳头瘤病毒 1 1型E6基因完整开放阅读框架 ,并插入中介载体T easy中构建重组质粒 ,转化JM1 0 9扩增后经酶切、PCR及测序分析 ,证实克隆成功。结论 该实验的成功为下一步制备HPV1 1的治疗性疫苗奠定基础。(本文来源于《西安医科大学学报》期刊2001年05期）
张成岗,贺福初[10]（2001）在《利用“添头加尾”策略进行cDNA/EST序列开放阅读框架分析及其程序设计》一文中研究指出核酸序列的开放阅读框架(open reading frame,ORF)查询是核酸序列分析中的一项重要内容。我们利用 Visual Basic 6.0计算机语言设计了基于Windows 环境的 ORF 分析程序(ORF_finder),运行时可按照标准格式显示6个相位所有可能的ORF,同时可通过为待分析序列添加/删除人工接头序列,十分便于进行(非全长)cDNA/EST 序列的 ORF 分析。在 Windows 环境中,待分析的核酸序列可直接从剪贴板获取,点击按钮"开始分析"即可启动ORF 分析过程。程序窗体中分别提供了原始序列显示区、过滤后的序列(指对原始序列中的数字、空格、回车、换行等非 A、C、G、T、N 字(本文来源于《科学新闻》期刊2001年13期）
开放阅读框架论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
在所分析的5’UTR序列中约19%的序列在阅读框1下含有AUG,约22%和24%的序列分别在阅读框2和阅读框3下含有AUG,而在3’UTR序列当中,无论是在哪个阅读框下,约71%含有AUG.这些AUG绝大多数都是以小ORF的形式出现的;分析小ORF序列以及与它们相应的IC序列(阅读框间序列)长度,发现虽然3’UTR序列远远长于5’UTR序列,但是它们所包含的小ORF长度几乎没有差距,只是平均来说每一条3’UTR序列所包含的小ORF数量明显多于每一条5’UTR序列所包含的小ORF数量,而且dIC(下游阅读框间序列)比uIC(上游阅读框间序列)长很多,平均长50个碱基;第二类IC序列(UTR区相邻的两个阅读框之间的序列)的平均长度比其它两类IC序列(UTR区最后一个阅读框之后的序列)的平均长度小,而且又含有相对较多的终止密码;比较uORF序列与dORF序列密码子使用偏好的CAI值发现,尽管相差不大,但是无论在哪个阅读框下,uORF序列的CAI值都显着高于dORF序列的CAI值.
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
开放阅读框架论文参考文献
[1].张维谊,鞠厚斌,刘健,刘佩红,周锦萍.上海及新疆地区猪戊型肝炎病毒开放阅读码框架2序列的克隆与分析[J].中国动物传染病学报.2010
[2].赵朝霞,李宏.哺乳动物基因非翻译区开放阅读框架的分析[J].内蒙古大学学报(自然科学版).2009
[3].赵朝霞.哺乳动物基因非翻译区开放阅读框架的分析[D].内蒙古大学.2009
[4].赵秀英,李瑞山,黄加庆,陈志伟,伍辉.中国人艾滋病毒感染者及健康人群人类免疫缺陷病毒CCR5开放阅读框架区天然突变的对比研究[J].微生物与感染.2006
[5].丛宪玲,田亚萍,陈越,王丽颖,于永利.人乳头瘤病毒6型E7基因完整开放阅读框架的克隆和鉴定[J].中国实验诊断学.2005
[6].何于娟,张彦,刘小珊,马凌娣,欧一衡.未知基因KH开放阅读框架真核表达载体的构建及其对K562细胞增殖的影响[J].重庆医科大学学报.2004
[7].何于娟,欧一衡,张彦,刘小珊,马凌娣.K562细胞未知基因KH的开放阅读框架在大肠杆菌中的表达[J].重庆医科大学学报.2004
[8].乐军.蛋白质组学发现结核分枝杆菌H37Rv基因组学未预测的开放阅读框架[J].国外医学(微生物学分册).2002
[9].马军,闫晓彩,来宝长,王一理,司履生.人乳头瘤病毒11型E6基因完整开放阅读框架的克隆和鉴定[J].西安医科大学学报.2001
[10].张成岗,贺福初.利用“添头加尾”策略进行cDNA/EST序列开放阅读框架分析及其程序设计[J].科学新闻.2001
论文知识图
