苹果酸度相关基因MdPH1的克隆、表达及亚细胞定位分析

苹果酸度相关基因MdPH1的克隆、表达及亚细胞定位分析

论文摘要

以苹果属(Malus)植物沧江海棠(M. ombrophila Hand.-Mazz)的果实为材料,对其发育过程中苹果酸的含量进行测定,并结合转录组测序的方法筛选控制果实酸度的候选基因。结果显示:MdPH1候选基因的编码区包含2829 bp,编码942个氨基酸;基因组序列全长为4269 bp,包含8个外显子和7个内含子。对10份苹果种质资源中PH1基因序列的分析结果表明,该基因序列中存在22个单核苷酸多态性(SNP),其中13个位于内含子区,9个位于外显子区;位于最后一个外显子上SNP(G/A)的变异导致了编码氨基酸从缬氨酸变为异亮氨酸。MdPH1蛋白包含8个跨膜结构域,其中蛋白N端包含3个跨膜结构域,C端包含5个跨膜结构域。系统进化分析结果显示,苹果中的PH家族成员与梨(Pyrus communis L.)中的PH家族成员聚集成一簇。组织特异性表达结果发现,MdPH1基因在苹果果实中的表达量最高,其次是叶、花和根,茎中表达量最低。亚细胞定位分析表明MdPH1蛋白定位于液泡膜上。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验材料
  •   1.2 实验方法
  •     1.2.1 DNA及RNA的提取
  •     1.2.2 苹果果实中有机酸含量的测定
  •     1.2.3 PH1基因家族成员的鉴定及进化分析
  •     1.2.4 MdPH1在拟南芥原生质体中的亚细胞定位
  • 2 结果与分析
  •   2.1 苹果果实中有机酸含量的测定
  •   2.2 转录组测序及酸度候选基因MdPH1基因的克隆
  •   2.3 MdPH1基因结构特征及基因序列分析
  •   2.4 MdPH1基因的系统进化分析
  •   2.5 MdPH1基因的组织特异性表达分析
  •   2.6 MdPH1在拟南芥原生质体中的亚细胞定位分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 齐彤辉,高萌,袁阳阳,李明军,马锋旺,马百全

    关键词: 沧江海棠,果实酸度,基因,基因结构,基因表达,亚细胞定位

    来源: 植物科学学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,园艺

    单位: 西北农林科技大学园艺学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室/陕西省苹果重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31701875),大学生创新创业训练计划(2201810712233)~~

    分类号: Q943.2;S661.1

    页码: 767-774

    总页数: 8

    文件大小: 1409K

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