银杏(Ginkgo biloba)GbHsp20基因家族的鉴定及系统进化分析

银杏(Ginkgo biloba)GbHsp20基因家族的鉴定及系统进化分析

论文摘要

Hsp20 (heat shock protein 20, Hsp20)是一个多样、古老和重要的基因家族,存在于所有植物中。Hsp-20有助于蛋白质折叠和防止不可逆的蛋白质聚集,从而赋予生物对高温的耐受性。银杏树是一种活化石,有自己独特的应激防御系统。但是,银杏中GbHsp20基因家族的研究目前还是一片空白。本研究借助银杏基因组数据库,以ACD结构域和分子量为基础,共鉴定了39个GbHsp20基因家族成员,并对其基因结构、基因组定位、系统发育关系和保守基序等特征进行了分析。本研究揭示了银杏和拟南芥Hsp20基因家族成员具有高度的同源性;虽然39个GbHsp20的基因结构存在差异,但蛋白序列高度保守,所有的GbHsp20中都含有基序1或2;将39个Gb Hsp20分为10亚族,每个亚族内的成员具有相似的基序分布特征。这为进一步研究GbHsp20基因家族成员的生物学功能提供一定的参考依据,同时为银杏中其他基因家族研究提供指导。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 银杏GbHsp20基因家族的鉴定
  •   1.2 GbHsp20基因家族成员的系统发育分析
  •   1.3 银杏GbHsp20基因结构分析
  •   1.4 GbHsp20家族保守motif分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 材料
  •   3.2 GbHsp20成员的鉴定
  •   3.3 系统发育树的构建
  •   3.4 Motif分析
  •   3.5 基因结构绘制
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 何福林,张斌

    关键词: 银杏,生物信息学,系统发育,基因家族

    来源: 分子植物育种 2019年22期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 林业

    单位: 湖南科技学院化学与生物工程学院湖南省银杏工程技术研究中心

    基金: 湖南科技学院重点项目(17XKY013),湖南省自然科学基金(2018JJ2145)共同资助

    分类号: S792.95

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.007368

    页码: 7368-7376

    总页数: 9

    文件大小: 4580K

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