植物赤霉素氧化酶GA20ox基因的生物信息学分析

论文摘要

在植物发育和生理过程中,GA-20氧化酶（GA-20 oxidase, GA20ox）起着非常重要的调控作用。运用生物信息学的方法,对27种不同植物的GA20ox基因的氨基酸序列的基本理化参数进行预测和分析,并构建其系统进化树。结果表明,植物GA20ox的蛋白质序列长度在345～426 aa之间,分子量在39.23～49.15 kD之间,等电点在5.09～7.65之间,大多数植物的GA20ox蛋白呈酸性、蛋白较为稳定、表现为亲水性、定位于细胞核中、具有多个功能位点（包括磷酸化位点和糖基化位点）;27种不同植物的含有5个保守基序,其中Motif 1和Motif 2为2OG-FeⅡOxy域,Motif 3为DIOXN域;基于氨基酸序列的系统聚类结果与物种间的亲缘关系远近相一致,具有明显种属特征;GA20ox蛋白二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主要元件。该研究结果对深入解析植物GA20的生物学功能及GA调控机理具有重要意义,为以后植物定向改良育种实践提供理论参考。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 基本理化性质及亚细胞定位
•   1.2 氨基酸序列相似性比较与分析
•   1.3 磷酸化位点分析
•   1.4 糖基化位点分析
•   1.5 保守基序分析
•   1.6 二级结构预测与分析
•   1.7 系统进化分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 植物GA20ox基因和蛋白序列的获得
•   3.2 植物GA20ox基因的生物信息学分析及软件
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张加强,刘慧春,周江华,谭晨,朱开元

关键词: 生物信息学,赤霉素,氧化酶,休眠与萌发

来源: 分子植物育种 2019年15期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 浙江省萧山棉麻研究所

基金: 浙江省公益技术应用研究计划项目(2017C32039),浙江省农科院青年科技人才培养项目(2017R25R08E02),杭州市科技计划引导项目(20163501Y80),浙江省公益性技术应用研究计划项目(LGN18C150007),2016年度浙江省农科院中青年科技人员国内外进修培养项目(2016)共同资助

分类号: Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.004986

页码: 4986-5002

总页数: 17

文件大小: 7900K

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