牦牛HYOU1基因克隆及组织表达分析

论文摘要

为探究HYOU1基因在牦牛中的组织表达谱,通过对西藏牦牛HYOU1基因的CDS区进行克隆测序,分析该基因的结构和功能,采用RT-PCR技术检测黄牛和牦牛肺脏、心脏、肝脏、乳腺、大脑及肌肉中HYOU1基因的相对表达量。结果表明:（1）HYOU1基因CDS区长度为3 006 bp,其中A、G、C和T含量分别为25.0%、31.1%、26.7%和17.1%,存在一定碱基偏好性;发现1个（ACG→ACA）SNP位点,为同义突变。（2）生物信息学分析表明该蛋白呈中性,为较不稳定、亲水性分泌信号蛋白;存在一个跨膜螺旋（TMhelix）区位于13-35氨基酸位置;二、三级蛋白结构分析发现其主要的空间构象为:无规则卷曲及α-螺旋。（3）聚类分析显示,西藏牦牛与野牦牛的遗传距离最近,与瘤牛及普通牛的遗传距离次之,与水牛最远。（4）RT-PCR结果显示HYOU1基因在黄牛和牦牛肝脏、乳腺、肺脏、大脑、心脏、肌肉6个组织中均有表达,且相对表达量依次递减;在相同组织中,黄牛组织的表达量均显著高于牦牛组织中的表达量（P<0.05）,其中黄牛肝脏组织的表达量为牦牛表达量的4.4倍。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
•     1.2.1 总RNA提取及cDNA第一链的合成
•     1.2.2 引物设计与合成
•     1.2.3 生物信息学分析
•     1.2.4 实时荧光定量PCR
• 2 结果
•   2.1 总RNA提取
•   2.2 牦牛HYOU1基因序列分析
•   2.3 牦牛HYOU1蛋白质分析
•     2.3.1 理化性质分析
•     2.3.2 亲水性/疏水性及亚细胞定位预测分析
•     2.3.3 蛋白质信号肽与跨膜结构预测分析
•     2.3.5 HYOU1蛋白二级结构预测
•   2.4 牦牛HYOU1同源性及系统进化分析
•   2.5 牦牛HYOU1表达谱分析
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 季文博,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟,钟金城

关键词: 牦牛,黄牛,基因,生物信息学分析,组织表达谱

来源: 生物技术通报 2019年03期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 西南民族大学青藏高原研究院,西南民族大学青藏高原动物遗传资源保存与利用教育部重点实验室,西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

基金: 西南民族大学研究生创新型科研项目(CX2017SZ033),国家肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37)

分类号: S823.85;Q78

DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-0852

页码: 123-131

总页数: 9

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