导读:本文包含了鸟枪法论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:鸟枪,质谱,多维,蛋白质,磷脂,诱导性,脂质。
鸟枪法论文文献综述
江丹阳,郑浩然[1]（2018）在《针对无标签鸟枪法蛋白质定量的新方法》一文中研究指出目的通过所检测到的肽段丰度计算蛋白质丰度是蛋白质组学的一个重要部分。由于退化肽段的丰度可能由多个蛋白质提供,简单剔除退化肽段可消除这种不确定性并简化问题。但是由于退化肽段的信息没有被充分利用,蛋白质定量的准确性会受到影响,还可能显着降低可以定量的蛋白质规模。如何充分利用退化肽段的信息,提高蛋白定量的准确性和全面性,并且不会导致问题规模更为复杂,成为一个重要的问题。方法为了在不引入更多误差的情况下充分利用退化肽段来进行更准确的定量,本文提出一个基于误差最小化的方法(error-minimization-based quantification for protein,EMQ)。不同于以往的大多数算法,EMQ利用退化肽段中的信息,最大限度地将肽段层面信息还原到蛋白质层面,得到了更多的蛋白质定量结果并提高了结果的精度。结果多个实验数据上的表现证明本方法可以在较小的时间代价下获得更高的精度,并提高结果的规模。结论本文提出的基于误差最小化的方法可以快速准确地对大规模蛋白质组学问题进行定量。(本文来源于《北京生物医学工程》期刊2018年04期）
翟芳[2]（2018）在《鸟枪法蛋白质组学质谱平台性能标准和参考数据集的建立》一文中研究指出研究目的:基于质谱的蛋白质组学技术的快速发展促进了人类蛋白质组的研究,使深入分析生物分子复合物、蛋白质组覆盖范围以及大量翻译后修饰位点成为现实。同时无标记定量方法在定量蛋白质组学研究中的广泛应用也使得在多种实验条件下进行蛋白质表达的比较成为可能。尽管蛋白质组学在样品制备方法、仪器设备和数据分析策略等方面取得了很大的进展,但该领域仍然面临着许多挑战。其中研究结果重现性差的问题是目前蛋白质学领域面临的一个最基本也是最严峻的挑战,其主要原因可能由于在样品制备、肽段分离、质谱分析以及生物信息学分析等过程中引进的各种未知的变异因素造成的。因此,对每一个过程进行性能监测和质量控制是获得可靠和可重现结果以及最终确定蛋白质组学研究中真正的生物学变异至关重要的。虽然目前各个实验室已经制定了各自的质量控制体系和性能标准,但是并没有广泛可用的生物复杂性性能标准和参考数据集作为平台性能基准用于监测仪器稳定性以及评估不同实验室的仪器性能。本文通过对不同类型质谱仪长期的性能监测旨在为LC-MS/MS基准测试提供一个很好表征的复杂蛋白质组性能标准和参考数据集。研究对象和方法:本文使用平台自制的HEK-293T标准样品,在已定的标准操作流程下对10台Orbitrap质谱仪进行了为期12个月的性能监测,每台仪器获得120个数据,结果共得到1200个质谱质控数据。通过对数据集进行统一的质量控制和数据筛选,最终使用相同样品制备方法下的431个数据对6台质谱系统进行性能分析。其中性能指标包括:肽段和蛋白鉴定量,肽段-谱图匹配数和二级谱图数,肽段和蛋白的鉴定重复率;肽段和蛋白定量分布,相关系数和变异系数等。结果:1)Q Exactive HF系列和Orbitrap Fusion系列质谱仪的肽段和蛋白鉴定量分别为20000和4000以上并且各仪器间具有较好的一致性;2)各仪器内和仪器间的肽段鉴定重复率中值范围分别为46.4-50.1%和44.8-48.8%,蛋白质为72.8–75.5%和72.4-74.5%,该结果表明蛋白水平的定性一致性无论是仪器内还是仪器间均比肽段水平高;3)各仪器内肽段和蛋白质的定量变异系数分别为25.9%-32.1%和40.1%-42.7%,说明蛋白定量重现性较肽段水平偏低;4)全局相似性分析表明仪器类型并没有影响肽段和蛋白定量结果的相似性;5)聚类分析和PCA分析发现样品批次对蛋白定量结果变异性的影响高于仪器类型的影响,而长时间的检测在仪器状态稳定的前提下并不会影响定量结果;6)本文构建了肽段和蛋白定量参考数据集,并且验证分析证明定量数据集能够很好地表征样本制备方法、不同批次标准品以及仪器类型之间的差异。因此,该性能标准和参考数据集可作为基准用于监测质谱系统的稳定性,同时也可以用于评估其它平台仪器的性能,以及用于促进新方法和技术的发展等等。(本文来源于《重庆大学》期刊2018-04-01）
邵若玄,徐红星,刘树生,王晓伟[3]（2018）在《应用鸟枪法LC-MS/MS鉴定烟粉虱唾液蛋白》一文中研究指出烟粉虱是一种刺吸式口器小型昆虫,每年对我国农业生产造成巨大危害。烟粉虱在取食植物时分泌多种唾液蛋白帮助其取食,同时唾液中的效应因子在调控植物防御反应过程中发挥重要作用。由于烟粉虱个体微小,唾液收集十分困难,有关其唾液蛋白的研究难以开展。本研究收集了3万头烟粉虱唾液,利用高精度Q-Exactive质谱,采用shotgun的方法首次鉴定了烟粉虱唾液中蛋白组分。应用双层膜收集装置收集到的烟粉虱唾液经浓缩等处理后其蛋白浓度约为1.698 g/L。唾液蛋白样品经胶内酶解、LC-MS/MS检测、序列分析,最终鉴定出42个烟粉虱唾液蛋白。功能分析表明烟粉虱唾液蛋白组分与蚜虫唾液蛋白组分具有一定的相似性,但多数蛋白为功能未知蛋白。通过质谱鉴定烟粉虱唾液蛋白组分为深入研究烟粉虱唾液蛋白的功能奠定了基础,有利于明确烟粉虱危害寄主植物的分子机制,为开发害虫防治新方法提供新思路。(本文来源于《环境昆虫学报》期刊2018年02期）
崔益玮,林亚楠,李诗言,戴志远,王扬[4]（2019）在《质谱鸟枪法非靶向快速初筛青鱼中微囊藻毒素残留》一文中研究指出母离子扫描(PreIS)是一种功能强大的扫描模式,但较少受到质谱工作者关注。本实验利用PreIS的功能特性和微囊藻毒素(MCs)的分子结构特征,建立了一种鸟枪法用于非靶向快速初筛青鱼(Mylopharyngodon piceus)中MCs残留。通过优化固相萃取条件和质谱参数,选取m/z 135([C_9H_(11)O+H]~+)为特征碎片峰,快速初步定性筛查了所有含该基团的MCs。实验发现,MCs在质谱气相环境内更容易形成双电荷离子,且谱图较纯净,以[M+2H]~(2+)为主。通过方法学验证,该方法的线性关系良好,相关系数R~2介于0.992 5～0.997 1之间;灵敏度较高,检出限和定量限分别低于1.25μg/L和3.99μg/L;日内、日间精密度的相对标准偏差分别为6.8%～8.6%和7.2%～9.1%,重现性较好;方法回收率为68.2%～83.4%,RSD为4.5%～6.8%,能够满足一般分析测试的要求。采用该方法对市售青鱼进行MCs快速初筛,阳性检出率为15%,MCs总浓度为3.4～15.8μg/kg,主要检出的种类为微囊藻毒素RR(MC-RR)和LR(MC-LR)。该方法能够快速检测青鱼中MCs残留,可以为相关部门提供依据和参考,从而为消费者食品安全提供保障。(本文来源于《质谱学报》期刊2019年02期）
何鮦鮦,孙强,范航,裴广倩,王媛媛[5]（2017）在《基于rDNA靶向测序和鸟枪法测序相结合的致病菌筛查》一文中研究指出目的基于高通量测序技术,建立靶向测序和鸟枪法测序相结合的致病菌筛查方法,以期用于临床感染标本中可疑致病菌的快速检测。为临床治疗提供参考。方法通过计算机模拟建立分析策略并研究其可行性,然后通过已知细菌进行验证;应用该方法对临床样品进行检测,分析样品中可疑的致病菌。结果在计算机模拟分析的四组标本中,相对应的细菌种属的reads检出比例在总细菌reads数中均为最高。在用已知细菌进行验证的结果中,四种细菌相对应的属reads比例均达到标本总reads数的88%以上,种reads比例均达到标本总reads数的51%以上;叁个真菌标本中相对应的真菌属reads比例均达到标本总reads数的91%以上,种reads比例均达到标本总reads数的40%以上。四个细菌样本和叁个真菌样本相对应的细菌和真菌属reads和种reads检出比例分别是对应样本中含量最高的属和种,与实际操作的细菌投入量基本相符。计算机模拟分析和用已知细菌测试结果表明,利用16S/ITS全长序列扩增产物进行打断建库可用于细菌和真菌的检测。将rDNA靶向测序和鸟枪法测序相结合,在临床脑脊液中检出红球菌和假单胞菌,在血液和唾液中检出金黄色葡萄球菌。结论靶向测序提高了检测的灵敏性,rDNA靶向测序和鸟枪法测序结果相互印证,提高了病原体检测的准确性。两种测序方法相结合用于病原体检测更加合理有效。(本文来源于《中国病原生物学杂志》期刊2017年12期）
张润丰,刘扬[6]（2016）在《基于鸟枪法的热电负荷优化分配研究》一文中研究指出随着电力市场改革深入,负荷分配问题成为热电厂节能优化措施之一。目前,常用的热电厂负荷优化分配算法主要有:等微增率法;热化做功法;规划类算法等。基于国内外研究现状,以综合标准煤耗率为总热经济指标,借鉴基因测序方法,提出了鸟枪法热电负荷优化分配算法。研究表明:鸟枪法负荷优化分配切实可用,对于热电负荷分配具有一定指导意义。(本文来源于《区域供热》期刊2016年04期）
潘洁莉,胡长锋,韦双双,陈娇,周佳[7]（2016）在《基于鸟枪法脂质组学研究环氧酶-2抑制剂对关节炎模型血清脂代谢的干预作用》一文中研究指出心血管疾病(CVD)是类风湿关节炎(RA)患者死亡的重要原因之一,脂代谢紊乱与CVD发生有密切关联,因而有必要对RA和药物治疗导致的脂代谢改变进行探讨。该研究采用胶原诱导法(CIA)构建关节炎模型,引入多维质谱鸟枪法开展血清脂质分析,检测了血清中105种脂质分子,发现模型大鼠体内7种磷脂酰肌醇、15种鞘磷脂、5种神经酰胺、10种磷脂酰胆碱和2种溶血磷脂酰胆碱异常上调,环氧酶-2(COX-2)抑制剂可部分修复紊乱的脂代谢,但对5种磷脂酰胆碱和1种溶血磷脂酰胆碱具有异常调控作用。该研究从脂质分子水平探讨了RA及COX-2抑制剂对脂代谢的干预作用,可以为RA的心血管风险研究提供信息。(本文来源于《色谱》期刊2016年06期）
李婷婷[8]（2015）在《鸟枪法快速分析鱼贝类磷脂成分》一文中研究指出建立一种快速有效的鸟枪质谱方法,分析水产动物肌肉组织内的磷脂轮廓。通过串联质谱直接进样分析从样品中提取的总脂,在正离子模式下以m/z 184.1为定性子离子通过母离子扫描模式确定磷脂酰胆碱(PC分子);以141 u为中性丢失碎片,通过中性丢失扫描模式确定磷脂酰乙醇胺分子(PE)。共鉴定出29种磷脂分子,包括16种PC分子和13种PE分子。3种水产品磷脂的分子种组成具有明显差异,各自具有独有分子,其中PE的分子组成差异最为明显。(本文来源于《食品科技》期刊2015年07期）
王昕岑[9]（2015）在《水产品贮藏过程中磷脂的鸟枪法分析及水解机理研究》一文中研究指出磷脂(Phospholipids)是一类含有磷酸根脂质的总称,广泛存在于各种生物体内。水产品磷脂富含n-3型多不饱和脂肪酸,磷脂型的多不饱和脂肪酸相对于甘油酯型的多不饱和脂肪酸,其氧化稳定性更好,消化吸收速度更快,具有一定的研究价值。本文利用基于鸟枪法的脂质组学研究策略分析了15种水产品中磷脂的分子种和含量。在此基础上,利用直接进样电喷雾串联质谱法分析了太平洋鳕鱼、南美白对虾、褶牡蛎在不同贮藏条件下的磷脂分子种和含量的变化过程,以及通过分析不同水产品磷脂水解酶酶活力变化速率,结合磷脂变化情况进行相关性分析,探究不同水产品在贮藏中磷脂的水解规律。随后,从水产品中提取纯化磷脂水解酶并使其作用于纯化的磷脂,通过分析其水解产物种类及含量变化进行磷脂的水解机理初步探究。本论文的研究和结果为水产品贮藏、低值水产品的高值化开发利用等提供理论依据。首先,本文建立了直接进样电喷雾串联质谱测定磷脂的方法。采用直接进样的方式将样品导入电喷雾离子源,利用叁重四极杆质谱的母离子扫描或中性丢失扫描功能,扫描磷脂的特征子离子或中性丢失碎片实现快速、高通量的对不同磷脂(磷脂酰胆碱、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰肌醇、磷脂酰丝氨酸)的定性和定量。应用鸟枪法脂质组学研究策略分析了15种新鲜水产品中磷脂分子种和含量,结果表明,鱼、虾、贝类叁类水产品中,海水鱼类的磷脂含量最丰富可占到总脂含量的33.91-42.12%,其次是虾类和贝类,淡水鱼中磷脂含量最低,仅占到其总脂含量的12.85-18.33%。就磷脂分子种组成而言,虾类的磷脂分子种信息最复杂,约含有55-73种磷脂分子,南极磷虾磷脂组成与其他虾类不同,仅含有31种磷脂分子。鱼类中的磷脂分子种最简单,仅含有41-62种磷脂分子,贝类中EPA和DHA型磷脂含量最为丰富,并且贝类中富含缩醛磷脂,以牡蛎中缩醛磷脂含量最为丰富,可占到总磷脂含量的11.23%。新鲜水产品原料中溶血性磷脂含量普遍较少。其后,应用直接进样电喷雾串联质谱法测定了3种水产品(太平洋鳕鱼、南美白对虾、褶牡蛎)的磷脂含量及其分子种组成在4℃和-20℃贮藏条件下的变化。结果显示,在不同贮藏条件下,叁种水产品原料中磷脂含量均呈现减少的趋势。溶血磷脂的变化趋势为先上升后下降,其变化同磷脂变化有一定相关性,当磷脂减少速率增加时溶血性磷脂含量上升速度显着增加。在-20℃贮藏条件下,叁种水产品中磷脂和溶血性磷脂含量变化不明显,表明磷脂和溶血性磷脂在低温储藏过程中能够保持长时间的稳定。通过对五种磷脂水解酶(脂肪酶、磷脂酶A1、磷脂酶A2、磷脂酶C、磷脂酶D)的检测分析,南美白对虾中各类磷脂水解酶活力最高,在贮藏过程中,3种水产品在4℃储藏条件下有较高的磷脂酶活力,而在-20℃酶活力在一定程度上被抑制。分析磷脂酶变化速率与磷脂变化的相关性表明,在贮藏过程中磷脂的降解主要为磷脂酶A2的作用,相关系数均大于0.9,同时磷脂酶D在磷脂酰肌醇的水解过程中表现出较强的水解活力(r>0.9)。最后,通过从南美白对虾中提取纯化的磷脂酶分析磷脂的水解机理,提纯酶液中包括脂肪酶、PLA,、PLA2、PLC及PLD。分析发现,磷脂酶可以水解纯化的南美白对虾磷脂和蛋黄卵磷脂,产生相应的游离脂肪酸(FFA)和溶血性磷脂(LPLs),二者与磷脂的水解变化呈现正相关关系,南美白对虾纯化得到的PC含量由516.45mg/g降至146.14mg/g,磷脂以多不饱和脂肪酸(PUFA)含量最为丰富。蛋黄卵磷脂中PC含量由517.22mg/g降至408.20mg/g,蛋黄卵磷脂中以单不饱和脂肪酸和饱和脂肪酸含量最为丰富。FFA含量显着增加,南美白对虾磷脂中PUFA含量增加了280.40mg/g(p<0.001),蛋黄卵磷脂中PUFA含量增加了79.89mg/g(p<0.001)。FFA中的PUFA显着增加与PLA2含量丰富有关(p<0.05)。说明磷脂酶可以水解磷脂产生一系列水解产物,对水产品磷脂在贮藏过程中的水解机理进行了初步探究并为后续研究提供理论依据。(本文来源于《中国海洋大学》期刊2015-05-05）
Hui-min,JIA,Yu-tong,SHEN,Yun,JIAO,Guo-yun,WANG,Xiao,DONG[10]（2014）在《基于杨梅基因组鸟枪法测序开发的107个SSR标记及其在品系鉴定中应用(英文)》一文中研究指出研究目的:开发多态性高的基因组简单重复序列(SSR)标记,为杨梅遗传多样性、遗传图谱构建及品种鉴定相关研究奠定基础。创新要点:从杨梅全基因组鸟枪法测序数据中新开发了107个SSR标记,并应用于品种间遗传多样性分析及品系鉴定。研究方法:应用生物信息学软件从基因组测序数据中搜索SSR位点并设计相应引物,添加通用的M13尾巴和荧光标识筛选多态性高的SSR标记。重要结论:开发的107个基因组SSR标记可以广泛应用于杨梅种质资源和遗传育种研究,鉴定出叁个杨梅新品系。(本文来源于《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》期刊2014年11期）
鸟枪法论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
研究目的:基于质谱的蛋白质组学技术的快速发展促进了人类蛋白质组的研究,使深入分析生物分子复合物、蛋白质组覆盖范围以及大量翻译后修饰位点成为现实。同时无标记定量方法在定量蛋白质组学研究中的广泛应用也使得在多种实验条件下进行蛋白质表达的比较成为可能。尽管蛋白质组学在样品制备方法、仪器设备和数据分析策略等方面取得了很大的进展,但该领域仍然面临着许多挑战。其中研究结果重现性差的问题是目前蛋白质学领域面临的一个最基本也是最严峻的挑战,其主要原因可能由于在样品制备、肽段分离、质谱分析以及生物信息学分析等过程中引进的各种未知的变异因素造成的。因此,对每一个过程进行性能监测和质量控制是获得可靠和可重现结果以及最终确定蛋白质组学研究中真正的生物学变异至关重要的。虽然目前各个实验室已经制定了各自的质量控制体系和性能标准,但是并没有广泛可用的生物复杂性性能标准和参考数据集作为平台性能基准用于监测仪器稳定性以及评估不同实验室的仪器性能。本文通过对不同类型质谱仪长期的性能监测旨在为LC-MS/MS基准测试提供一个很好表征的复杂蛋白质组性能标准和参考数据集。研究对象和方法:本文使用平台自制的HEK-293T标准样品,在已定的标准操作流程下对10台Orbitrap质谱仪进行了为期12个月的性能监测,每台仪器获得120个数据,结果共得到1200个质谱质控数据。通过对数据集进行统一的质量控制和数据筛选,最终使用相同样品制备方法下的431个数据对6台质谱系统进行性能分析。其中性能指标包括:肽段和蛋白鉴定量,肽段-谱图匹配数和二级谱图数,肽段和蛋白的鉴定重复率;肽段和蛋白定量分布,相关系数和变异系数等。结果:1)Q Exactive HF系列和Orbitrap Fusion系列质谱仪的肽段和蛋白鉴定量分别为20000和4000以上并且各仪器间具有较好的一致性;2)各仪器内和仪器间的肽段鉴定重复率中值范围分别为46.4-50.1%和44.8-48.8%,蛋白质为72.8–75.5%和72.4-74.5%,该结果表明蛋白水平的定性一致性无论是仪器内还是仪器间均比肽段水平高;3)各仪器内肽段和蛋白质的定量变异系数分别为25.9%-32.1%和40.1%-42.7%,说明蛋白定量重现性较肽段水平偏低;4)全局相似性分析表明仪器类型并没有影响肽段和蛋白定量结果的相似性;5)聚类分析和PCA分析发现样品批次对蛋白定量结果变异性的影响高于仪器类型的影响,而长时间的检测在仪器状态稳定的前提下并不会影响定量结果;6)本文构建了肽段和蛋白定量参考数据集,并且验证分析证明定量数据集能够很好地表征样本制备方法、不同批次标准品以及仪器类型之间的差异。因此,该性能标准和参考数据集可作为基准用于监测质谱系统的稳定性,同时也可以用于评估其它平台仪器的性能,以及用于促进新方法和技术的发展等等。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
鸟枪法论文参考文献
[1].江丹阳,郑浩然.针对无标签鸟枪法蛋白质定量的新方法[J].北京生物医学工程.2018
[2].翟芳.鸟枪法蛋白质组学质谱平台性能标准和参考数据集的建立[D].重庆大学.2018
[3].邵若玄,徐红星,刘树生,王晓伟.应用鸟枪法LC-MS/MS鉴定烟粉虱唾液蛋白[J].环境昆虫学报.2018
[4].崔益玮,林亚楠,李诗言,戴志远,王扬.质谱鸟枪法非靶向快速初筛青鱼中微囊藻毒素残留[J].质谱学报.2019
[5].何鮦鮦,孙强,范航,裴广倩,王媛媛.基于rDNA靶向测序和鸟枪法测序相结合的致病菌筛查[J].中国病原生物学杂志.2017
[6].张润丰,刘扬.基于鸟枪法的热电负荷优化分配研究[J].区域供热.2016
[7].潘洁莉,胡长锋,韦双双,陈娇,周佳.基于鸟枪法脂质组学研究环氧酶-2抑制剂对关节炎模型血清脂代谢的干预作用[J].色谱.2016
[8].李婷婷.鸟枪法快速分析鱼贝类磷脂成分[J].食品科技.2015
[9].王昕岑.水产品贮藏过程中磷脂的鸟枪法分析及水解机理研究[D].中国海洋大学.2015
[10].Hui-min,JIA,Yu-tong,SHEN,Yun,JIAO,Guo-yun,WANG,Xiao,DONG.基于杨梅基因组鸟枪法测序开发的107个SSR标记及其在品系鉴定中应用(英文)[J].JournalofZhejiangUniversity-ScienceB(Biomedicine&Biotechnology).2014
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