副干酪乳杆菌的基因多样性及其抗生素耐受性分析

论文摘要

探究不同因素对副干酪乳杆菌系统进化的影响,并对其抗生素耐受性的基因型和表型进行关联分析。以分离自不同地区人或动物粪便样品及泡菜样品的33株副干酪乳杆菌为研究对象,利用比较基因组学对其基因组进行特征分析,同时测定12种抗生素对菌株的最低抑制浓度(minimum inhabitory conceutration,MIC)。部分菌株在进化树上以分离地区为主因素聚集;部分粪便源菌株对克林霉素、阿莫西林、环丙沙星、红霉素和四环素均存在抗性,而泡菜源菌株普遍对抗生素较为敏感;抗生素抗性基因与表型有一定的匹配性,个别菌株的高抗性是抗性基因ErmB与tetM调控所导致。因此,分析副干酪乳杆菌的基因多样性和表型,可为其在发酵食品中的应用提供理论指导。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 菌株
•   1.2 主要试剂和仪器
•   1.3 菌株活化及DNA的提取
•   1.4 基因组测序、组装和基因预测
•   1.5 泛基因组和核心基因组曲线及韦恩图的绘制
•   1.6 系统发育进化树的构建
•   1.7 基因功能注释
•   1.8 抗生素耐受能力测定
• 2 结果与分析
•   2.1 菌株信息和基因组序列概况
•   2.2 泛基因组和核心基因组分析
•   2.3 系统发育树进化分析
•   2.4 抗生素抗性基因分析
•   2.5 抗生素耐受性测定
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李晓姝,殷瑞敏,毛丙永,崔树茂,赵建新

关键词: 副干酪乳杆菌,泛基因组,核心基因组,系统进化,抗生素耐受

来源: 食品与发酵工业 2019年14期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

专业: 生物学,轻工业手工业

单位: 江南大学食品学院

基金: 国家自然科学基金(31601453)

分类号: TS201.3

DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.020412

页码: 1-8

总页数: 8

文件大小: 5119K

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