导读:本文包含了蛋白质氨基酸序列分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:蛋白质,序列,氨基酸,蛋白,磷酸化,多肽,接点。
蛋白质氨基酸序列分析论文文献综述
阳秀凤[1](2014)在《蛋白质-RNA基于氨基酸序列的无序性和磷酸化分析及亲和力常数数据集的构建》一文中研究指出无序蛋白质是一种新型蛋白质,在天然状态并不具有稳定的叁维结构,但是仍具有生物活性,这是对传统蛋白质“序列-结构-功能”范式的挑战。在天然条件下,无序蛋白质是多种构象共存、不断实现动态变化的系综,这种结构特征使得无序蛋白质在细胞信号传导、分子识别等各种生命活动中扮演重要角色。深入研究无序蛋白质,将促进人们更好地认识对蛋白质结构与功能之间的关系。尽管在蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA相互作用中,采用生物信息学方法,对蛋白质的无序性与功能之间的关联性研究越来越多,但是在蛋白质-RNA相互作用中仍然相对很少。在这里,我们开展了这方面的研究,主要工作分为两个部分。第一部分是对人类基因组中RNA结合蛋白质的无序性及无序性与磷酸化位点的相关性进行分析。结果显示RNA结合蛋白质中的无序残基含量更高,具有更多的无序尾端,并且RNA结合蛋白质中的57.52%磷酸化位点位于无序残基上,跟DNA结合蛋白质相近,高于非RNA结合蛋白质。第二部分是研究PDB数据库中具有磷酸化位点信息的RNA结合蛋白质的无序性、磷酸化作用对蛋白质-RNA结合的影响。结果表明RNA结合蛋白质上的无序残基趋向位于蛋白质-RNA结合界面之外的区域,磷酸化位点趋向位于结合界面上,但在该数据集中磷酸化位点与无序位点并不具有相关性。最后,为了更好的研究蛋白质-RNA相互作用,我们还构建了一个基于结构的蛋白质-RNA亲和力常数数据集,并用于蛋白质-RNA对接打分函数的评估。这一数据集将有利于促进蛋白质-RNA对接和结合机制的研究(本文来源于《华中科技大学》期刊2014-02-01)
曹赞霞,张红梅,赵岩,王吉华[2](2011)在《固有无序蛋白质无序与有序接点处的氨基酸序列分析》一文中研究指出近几年发现的固有无序蛋白质数量不断增加,但目前的研究主要集中于无序区域的序列分析,预测软件的开发也主要基于无序区域的序列和结构特征。目前,尚没有针对无序区域与有序区域接点处氨基酸序列分析的报道,也未发现比较不同功能固有无序蛋白质的无序区域序列特征的研究。本文将目前所发现的固有无序蛋白质按功能划分为分子伴侣、分子组装等8组,建立其二级数据库;然后,运用ProtParam软件对固有无序蛋白质无序与有序接点处的氨基酸序列进行相关特征分析,这些特征参数包括氨基酸组成、净电荷、芳香族氨基酸含量和疏水性。基于数据库和分析统计工具的考虑,文章在每组序列的接点两侧,分别选择了1~5个氨基酸作为研究对象。结果表明,不同功能的固有无序蛋白质接点处无序区域和有序区域的氨基酸种类、净电荷含量、芳香族氨基酸含量,以及疏水性,都存在不同程度的差异;但是就整体而言,固有无序蛋白质接点处无序区域的亲水氨基酸(D、E、K、G)含量比较高,而接点处有序区域的疏水氨基酸(C、W、L、I、F)含量比较高;接点处无序区域的净电荷高于有序区域的净电荷,无序区域的芳香族氨基酸含量低于有序区域。本研究揭示了固有无序蛋白质有序与无序接点处的序列特征,将为无序蛋白质的预测添加新的输入信息,有助于开发和改进固有无序蛋白质预测软件。(本文来源于《生物物理学报》期刊2011年09期)
岳红云,贺翔鸽,燕振国,马岩梅[3](2009)在《Nogo-66蛋白质的氨基酸序列分析》一文中研究指出目的:分析Nogo-66蛋白的氨基酸序列特征,分析其产生免疫应答的机会。方法:ProPred web interface程序,ProPred MHC-ⅡBinding Peptide prediction Server抗原表位分析软件,对Nogo-66蛋白进行分析,查找T细胞抗原表位,分析分子量及氨基酸残基特征。结果:Nogo-66蛋白有6个重复率最高的T淋巴细胞受体识别的抗原表位:LGHVNCTIK VQKYSNSAL LVQKYSNSA LRRLFLVDD YKGVIQAIQ FLVDDLVDS,铆钉残基明确。结论:Nogo-66蛋白的氨基酸序列决定了其可能具备免疫原性,具有刺激免疫系统产生T淋巴细胞介导的免疫反应的分子基础。(本文来源于《国际眼科杂志》期刊2009年04期)
王戎机,孟焕新,陈智滨,曹采方[4](2002)在《龈沟液12000蛋白质的N-末端氨基酸序列分析及其临床意义》一文中研究指出目的 对龈沟液中 12 0 0 0蛋白质的N 末端氨基酸进行序列分析 ,鉴定其本质。方法采集快速进展性牙周炎和成人牙周炎患者的龈沟液 ,采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳分离出 12 0 0 0蛋白 ,并将其通过电转移技术转至PVDF膜上 ,剪下PVDF膜上的目标条带 ,在 4 91ProteinSequencer多肽氨基酸序列测定仪上进行N 末端氨基酸序列分析。结果 龈沟液中低相对分子质量的 12 0 0 0蛋白N 末端 10个氨基酸的顺序为 :Met、Leu、Thr、Glu、Leu、Glu、Lys、Ala、Leu、Asn。经MS Edman检索 ,与该序列相匹配的蛋白是“钙结合蛋白MRP8” ,它是钙结合蛋白 (Calprotectin)的轻亚基。Calprotectin是白细胞胞质中的一种蛋白 ,是败血症、肺炎等一些炎性疾病的标志物。结论 龈沟液中 12 0 0 0蛋白质的本质是钙结合蛋白。(本文来源于《中华口腔医学杂志》期刊2002年04期)
蒋秀萍,谈建中,商承伟,楼程富,平野久[5](2000)在《桑(M.albaL.)树液中部分蛋白质的分离及N-端氨基酸序列分析》一文中研究指出在高等植物中能够利用现有基因库资料推测具有生物功能的蛋白质种类迄今还不到总数的 1 /3,因此未知蛋白质的分离及其结构分析已成为“蛋白组计划 (Proteome)”的重要研究内容[1 ] 。我国的桑树种质资源极为丰富 ,已收集、保存的种质资源达 2 60(本文来源于《蚕业科学》期刊2000年04期)
王台,门仓宏,依田幸司,山崎真狩[6](1997)在《用有限酶切法分析蛋白质的氨基酸序列》一文中研究指出报道了一个通过有限酶切蛋白质产生多肽片段的方法 .蛋白质经单向SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS PAGE)分离和用考马斯亮蓝短暂染色后 ,切下所需的蛋白质带 ,将其放入另一个SDS PAGE凝胶的样品槽内 ,在电泳过程中该蛋白质被蛋白酶如蛋白酶V8降解 ,所产生的多肽片段随之被分离 .电泳结束后 ,将多肽片段电印迹至聚偏二氟乙烯 ( polyvinylidenedifluoride,PVDF)膜上 .这些多肽片段从PVDF膜上切下后可以直接被用于分析氨基酸序列 .该方法能广泛适用于分析一般蛋白质和N端被修饰蛋白质的氨基酸序列(本文来源于《生物化学与生物物理进展》期刊1997年01期)
方慧生,相秉仁,安登魁[7](1993)在《质谱在蛋白质及多肽氨基酸序列分析中的应用》一文中研究指出本文阐述了质谱法在蛋白质及多肽的氨基酸序列分析中的适用范围及与酶学法、化学法、X-晶体衍射法等传统方法相比较的优点。着重介绍质谱法与各种分析方法综合运用于微量蛋白质结构的测定和质谱技术在该领域中的应用前景。(本文来源于《药学进展》期刊1993年04期)
蛋白质氨基酸序列分析论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
近几年发现的固有无序蛋白质数量不断增加,但目前的研究主要集中于无序区域的序列分析,预测软件的开发也主要基于无序区域的序列和结构特征。目前,尚没有针对无序区域与有序区域接点处氨基酸序列分析的报道,也未发现比较不同功能固有无序蛋白质的无序区域序列特征的研究。本文将目前所发现的固有无序蛋白质按功能划分为分子伴侣、分子组装等8组,建立其二级数据库;然后,运用ProtParam软件对固有无序蛋白质无序与有序接点处的氨基酸序列进行相关特征分析,这些特征参数包括氨基酸组成、净电荷、芳香族氨基酸含量和疏水性。基于数据库和分析统计工具的考虑,文章在每组序列的接点两侧,分别选择了1~5个氨基酸作为研究对象。结果表明,不同功能的固有无序蛋白质接点处无序区域和有序区域的氨基酸种类、净电荷含量、芳香族氨基酸含量,以及疏水性,都存在不同程度的差异;但是就整体而言,固有无序蛋白质接点处无序区域的亲水氨基酸(D、E、K、G)含量比较高,而接点处有序区域的疏水氨基酸(C、W、L、I、F)含量比较高;接点处无序区域的净电荷高于有序区域的净电荷,无序区域的芳香族氨基酸含量低于有序区域。本研究揭示了固有无序蛋白质有序与无序接点处的序列特征,将为无序蛋白质的预测添加新的输入信息,有助于开发和改进固有无序蛋白质预测软件。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
蛋白质氨基酸序列分析论文参考文献
[1].阳秀凤.蛋白质-RNA基于氨基酸序列的无序性和磷酸化分析及亲和力常数数据集的构建[D].华中科技大学.2014
[2].曹赞霞,张红梅,赵岩,王吉华.固有无序蛋白质无序与有序接点处的氨基酸序列分析[J].生物物理学报.2011
[3].岳红云,贺翔鸽,燕振国,马岩梅.Nogo-66蛋白质的氨基酸序列分析[J].国际眼科杂志.2009
[4].王戎机,孟焕新,陈智滨,曹采方.龈沟液12000蛋白质的N-末端氨基酸序列分析及其临床意义[J].中华口腔医学杂志.2002
[5].蒋秀萍,谈建中,商承伟,楼程富,平野久.桑(M.albaL.)树液中部分蛋白质的分离及N-端氨基酸序列分析[J].蚕业科学.2000
[6].王台,门仓宏,依田幸司,山崎真狩.用有限酶切法分析蛋白质的氨基酸序列[J].生物化学与生物物理进展.1997
[7].方慧生,相秉仁,安登魁.质谱在蛋白质及多肽氨基酸序列分析中的应用[J].药学进展.1993