导读:本文包含了系统进化分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:系统,登革热,序列,基因,鉴定,霍尔,柞蚕。
系统进化分析论文文献综述
冯震,杨燕,张宁,蒋波,李芳[1]（2019）在《基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定与系统进化分析》一文中研究指出目的:建立伯克霍尔德菌属典型菌株DNA促旋酶亚基B(gyrB)基因序列鉴定方法,为该菌属污染物的鉴定和分类提供研究思路和方法依据。方法:选择伯克霍尔德菌属内的典型菌株,以gyrB基因为研究靶点,设计引物,特异性扩增gyrB基因片段,测定核酸序列,并进行聚类比对分析。结果:伯克霍尔德菌属内的典型菌株鉴定的gyrB基因特征序列可满足"种"水平的鉴定。结论:本文建立了基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定方法,菌株鉴定的gyrB基因特征序列可满足"种"水平的鉴定,为该菌属污染物的鉴定与风险排查提供方法依据。(本文来源于《药物分析杂志》期刊2019年11期）
何福林,张斌[2]（2019）在《银杏(Ginkgo biloba)GbHsp20基因家族的鉴定及系统进化分析》一文中研究指出Hsp20 (heat shock protein 20, Hsp20)是一个多样、古老和重要的基因家族,存在于所有植物中。Hsp-20有助于蛋白质折迭和防止不可逆的蛋白质聚集,从而赋予生物对高温的耐受性。银杏树是一种活化石,有自己独特的应激防御系统。但是,银杏中GbHsp20基因家族的研究目前还是一片空白。本研究借助银杏基因组数据库,以ACD结构域和分子量为基础,共鉴定了39个GbHsp20基因家族成员,并对其基因结构、基因组定位、系统发育关系和保守基序等特征进行了分析。本研究揭示了银杏和拟南芥Hsp20基因家族成员具有高度的同源性;虽然39个GbHsp20的基因结构存在差异,但蛋白序列高度保守,所有的GbHsp20中都含有基序1或2;将39个Gb Hsp20分为10亚族,每个亚族内的成员具有相似的基序分布特征。这为进一步研究GbHsp20基因家族成员的生物学功能提供一定的参考依据,同时为银杏中其他基因家族研究提供指导。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年22期）
刘玥,陈守坤,王成微,李家伟,李海峰[3]（2019）在《水稻MYB-MYC基因家族的全基因组鉴定、系统进化和表达模式分析》一文中研究指出为了挖掘水稻MYB-MYC基因的功能,通过生物信息学手段对水稻MYB-MYC基因家族进行基因组水平的鉴定,并对其系统进化及表达模式进行分析。本研究在水稻中鉴定到17个MYB-MYC基因,根据系统进化树将它们划分为2个亚家族,不同亚组具有特异的保守基序和基因结构。通过对水稻MYB-MYC基因复制事件的分析发现水稻MYB-MYC基因共产生6个基因复制。此外,转录组数据分析发现水稻MYB-MYC基因在不同组织都存在表达且响应不同非生物胁迫。本试验为水稻MYB-MYC基因功能的研究提供了初步的理论基础。(本文来源于《西北农业学报》期刊2019年11期）
季文博,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟[4]（2019）在《西藏牦牛mtDNA-Cytb及ZFY基因遗传多样性与系统进化分析》一文中研究指出为进一步了解西藏牦牛的遗传多样性及系统进化关系,通过对申扎、斯布、类乌齐和帕里4个西藏牦牛类群的mtDNA-Cytb基因及ZFY基因部分序列进行克隆及序列分析。结果表明:(1)西藏牦牛Cytb基因全长1 140 bp,共发现SNP位点13个,核苷酸多样性(Pi)为0.00315, Tajima's D值为0.41410(P>0.10),共检出7种单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.709;(2)ZFY基因第11外显子长596 bp,筛查出SNP位点22个,Tajima's D值为0.78287(P>0.10),发现3种单倍型,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0.001066和0.2976;(3)聚类分析及核苷酸同源性分析显示,西藏牦牛与家牦牛的核苷酸同源性最高,与美洲野牛及欧洲野牛的核苷酸同源性次之,与水牛及非洲水牛的核苷酸同源性最低。研究结果表明,西藏牦牛遗传多样性较丰富,进一步支持将西藏牦牛及家牦牛划为牛亚科中独立牦牛属的观点,及牦牛的原始祖先来自于亚欧大陆东北部的观点。(本文来源于《家畜生态学报》期刊2019年11期）
杨瑞生,顾羽健,陈玉波,刘彦群,石生林[5]（2019）在《柞蚕饰腹寄蝇基于线粒体Cytb基因的种群变异及系统进化分析》一文中研究指出柞蚕饰腹寄蝇Blepharipa tibialis是柞蚕主要寄生性害虫。扩增得到柞蚕饰腹寄蝇18个种群、长度为554 bp的线粒体Cytb基因片段,生物信息学分析显示其碱基A、T、C和G的平均含量分别为36.10%、42.60%、12.82%和8.48%,AT含量达78.7%,存在明显的AT使用偏向性。样本两两间遗传距离为0～0.000 30,平均遗传距离为0.000 25。柞蚕饰腹寄蝇98个个体中存在6个单倍型,单倍型多样度(H_d)为0.160,平均核苷酸差异数(K)为0.165,个体之间差异性较小。基于Cytb序列片段构建的NJ进化树显示,柞蚕饰腹寄蝇等32种双翅目昆虫从科的水平上与传统分类系统一致,按与柞蚕饰腹寄蝇的亲缘关系由近及远依次将其归类到寄蝇科、蝇科、花蝇科、麻蝇科和丽蝇科。结果表明,柞蚕饰腹寄蝇种群进化时间较短,但线粒体Cytb基因仍能用于双翅目昆虫科级进化的辅助分析。(本文来源于《蚕业科学》期刊2019年04期）
刘杰,张浪,季益文,张青萍[6]（2019）在《基于分形模型的城市绿地系统时空进化分析——以上海市中心城区为例》一文中研究指出城市绿地是城市生态空间的重要组成部分,其形态特征及布局结构遵循规律性机制进行演替。基于上海市1983年、1994年和2002年城市绿地系统的规划背景、政策推进及建设成效等,结合形态维模型和聚集维模型,对中心城区绿地进化的多维特征进行定性和定量分析。结果表明:(1)规划引导是影响城市绿地时空进化的关键因素,且具有系统性、阶段性及动态性特征;(2)在发展阶段上,上海市的绿地建设经历了快速发展阶段和质量跃升阶段,趋于"量"到"质"的优化;(3)在绿地空间形态结构上,自组织及演化未达到最优化状态,但形态维数随时间的变化而逐渐降低,绿地空间形态整体趋于整合,系统性增强;(4)在绿地分布格局上,聚集维数先增强后减弱,绿地斑块由分散、割裂状态趋向环廊结合、通达性较好的网络系统结构。(本文来源于《现代城市研究》期刊2019年10期）
田建华,马珍元,张新枝,王雪刚,黄呈辉[7]（2019）在《深圳市登革1型病毒株全基因组特征及系统进化分析》一文中研究指出目的对深圳市2014年登革病毒1型(DENV-1)流行株进行全基因序列测定,分析其分子病毒学特征,探讨其可能来源。方法采集2例登革热患者急性期血清标本,用BHK-21细胞培养分离病毒,RT-PCR进行病毒血清型别鉴定,并用RT-PCR进一步扩增全基因组序列,测序后进行同源性比较、系统进化树分析和遗传变异分析。结果 2例深圳DENV-1分离株进行全基因组测序结果显示同源性为100.0%,其基因组全长均为10 735 bp,编码3 329个氨基酸,与新加坡DENV-1流行株核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为99.3%和99.7%。全基因组序列系统进化分析显示,深圳DENV-1株为基因Ⅰ型,与Fujian2004、Zhuhai2007和Singpore2008的亲缘关系较近,均在同一进化分支上。与广州DENV-1株GZ/80相比,深圳2014年DENV-1分离株发生了碱基变异430个,氨基酸变异42个,5’UTR存在1处点突变,3’UTR序列共有8处位点发生变异。结论 2014年深圳市DENV-1株可能来源于东南亚一带。病毒在进化过程中出现一些位点变异,这些变异的生物学意义有待进一步研究。(本文来源于《热带医学杂志》期刊2019年09期）
尚翠玲,林静,金慧琴,孟佳丽,李昕[8]（2019）在《猪源γ-溶血葡萄球菌的分离鉴定与系统进化分析》一文中研究指出为了找到引起养猪场送检猪发病的原因,试验采用分离培养、革兰氏染色镜检观察、生化试验、16S rRNA基因序列测定及同源性分析、致病性试验和药敏试验等对分离菌株进行了研究。结果表明:分离菌株为革兰氏阳性球菌,其生长特性、菌落特征、生化试验结果与葡萄球菌属中的溶血葡萄球菌基本一致,但在血琼脂培养基上并未出现溶血现象;分离菌株与溶血葡萄球菌L50菌株(KU179371. 1)同源性为99. 9%,且进化程度最相近;分离菌株导致小鼠出现运动迟缓、群聚扎堆等临床症状,并从小鼠体内分离出相同形态特征和菌体特征的菌株;分离菌株对氧氟沙星、米诺环素敏感,对头孢哌酮、多西环素、环丙沙星中度敏感;对青霉素、氨苄西林、头孢唑林等14种药物耐药。说明从病猪体内分离的菌株是存在多重耐药的γ-溶血葡萄球菌。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2019年17期）
付亚娟,吴智艳,乔洁,侯晓强,马立芝[9]（2019）在《香菇亲和素基因Leav1的克隆及系统进化分析》一文中研究指出采用RT-PCR技术克隆香菇(Lentinus edodes)亲和素基因(Leav1),并对不同来源的亲和素蛋白的分子特征及系统进化进行比较分析。结果表明:L.edodes亲和素Leav1大小为459 bp,编码152个氨基酸。来自细菌、真菌和脊椎动物的亲和素由126～183个氨基酸组成,相对分子质量为13.24～18.84 kDa,理论等电点为3.90～9.69,其中香菇Lentiavidin 1等电点最低,为3.9。对比不同来源亲和素的多序列,发现Avidin结构域长度为107～120个氨基酸,序列之间的相似度为26%～54%,但与生物素结合位点非常保守。系统进化分析发现,香菇Lentiavidin 1和白黄侧耳(Pleurotus cornucopiae)Tamavidin的亲缘关系较近。探明不同来源亲和素的分子特征及系统进化关系,对将来深入研究亲和素基因的生物学功能具有重要意义。(本文来源于《北方园艺》期刊2019年15期）
陈颖彬,常丽云,李林,王紫燕,赵越[10]（2019）在《河北省奶牛传染性鼻气管炎病毒的分离鉴定与系统进化分析》一文中研究指出为了分离与鉴定河北省牛传染性鼻气管炎病毒(Infectious bovine rhinotracheitis virus, IBRV),试验对河北省某规模化奶牛场IBRV初检阳性病料进行处理,采用病毒分离培养、分离毒毒价测定、中和试验、PCR扩增、目的基因片段测序、同源性分析及系统进化树构建的方法对病毒进行鉴定和分析。结果表明:筛选出一株病变毒株,其TCID_(50)为1×10~(-4.7)/0.1 mL,分离株抗原能够被IBRV阳性血清中和,PCR扩增出大小为314 bp的特异性片段,扩增的gB基因片段共编码316个核苷酸,与GenBank中部分IBRV毒株的同源性为99.3%～100%,该毒株与BH81株(DQ006854)亲源关系较近,将其命名为HBXT-IBRV。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2019年13期）
系统进化分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
Hsp20 (heat shock protein 20, Hsp20)是一个多样、古老和重要的基因家族,存在于所有植物中。Hsp-20有助于蛋白质折迭和防止不可逆的蛋白质聚集,从而赋予生物对高温的耐受性。银杏树是一种活化石,有自己独特的应激防御系统。但是,银杏中GbHsp20基因家族的研究目前还是一片空白。本研究借助银杏基因组数据库,以ACD结构域和分子量为基础,共鉴定了39个GbHsp20基因家族成员,并对其基因结构、基因组定位、系统发育关系和保守基序等特征进行了分析。本研究揭示了银杏和拟南芥Hsp20基因家族成员具有高度的同源性;虽然39个GbHsp20的基因结构存在差异,但蛋白序列高度保守,所有的GbHsp20中都含有基序1或2;将39个Gb Hsp20分为10亚族,每个亚族内的成员具有相似的基序分布特征。这为进一步研究GbHsp20基因家族成员的生物学功能提供一定的参考依据,同时为银杏中其他基因家族研究提供指导。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
系统进化分析论文参考文献
[1].冯震,杨燕,张宁,蒋波,李芳.基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定与系统进化分析[J].药物分析杂志.2019
[2].何福林,张斌.银杏(Ginkgobiloba)GbHsp20基因家族的鉴定及系统进化分析[J].分子植物育种.2019
[3].刘玥,陈守坤,王成微,李家伟,李海峰.水稻MYB-MYC基因家族的全基因组鉴定、系统进化和表达模式分析[J].西北农业学报.2019
[4].季文博,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟.西藏牦牛mtDNA-Cytb及ZFY基因遗传多样性与系统进化分析[J].家畜生态学报.2019
[5].杨瑞生,顾羽健,陈玉波,刘彦群,石生林.柞蚕饰腹寄蝇基于线粒体Cytb基因的种群变异及系统进化分析[J].蚕业科学.2019
[6].刘杰,张浪,季益文,张青萍.基于分形模型的城市绿地系统时空进化分析——以上海市中心城区为例[J].现代城市研究.2019
[7].田建华,马珍元,张新枝,王雪刚,黄呈辉.深圳市登革1型病毒株全基因组特征及系统进化分析[J].热带医学杂志.2019
[8].尚翠玲,林静,金慧琴,孟佳丽,李昕.猪源γ-溶血葡萄球菌的分离鉴定与系统进化分析[J].黑龙江畜牧兽医.2019
[9].付亚娟,吴智艳,乔洁,侯晓强,马立芝.香菇亲和素基因Leav1的克隆及系统进化分析[J].北方园艺.2019
[10].陈颖彬,常丽云,李林,王紫燕,赵越.河北省奶牛传染性鼻气管炎病毒的分离鉴定与系统进化分析[J].黑龙江畜牧兽医.2019
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