牛粪发酵过程中抗生素耐药基因及相关菌群组成变化规律

论文摘要

随着规模化奶牛养殖迅速发展,牛粪带来的环境污染问题日益严重。实验探究牛粪及其堆肥过程中养分变化、抗生素耐药基因消减情况以及细菌群落演替规律,探讨细菌菌群与养分、抗生素耐药基因之间的相关性。采集牛粪及其堆肥过程样品,测定样品中养分、检测抗生素耐药基因相对丰度,采用16S r RNA高通量测序技术研究牛粪堆肥过程细菌群落变化。结果表明,从新鲜牛粪（组FM）到发酵牛粪（组C）,样品中有机质含量下降,全氮和全磷含量有不同程度增加,全钾（TK）显著升高（P<0.05）。堆肥发酵后,抗生素耐药基因erm B、tet M、bla CTX-M和aac（6’）-Ib-cr的相对丰度呈现不同程度的下降,而基因sul1相对丰度增加。高通量测序结果表明,在门水平,各组均以Firmicutes、Proteobacteria和Bacteroidetes这3个菌门为主,在属水平,各组具有不同的优势物种,其中发现Bacteroides、Paeniclostridium和Pseudomonas等7个潜在病原菌属的相对丰度在堆肥后有效降低。通过相关性分析发现,潜在病原菌属与基因tet M和sul1呈显著正相关（P<0.05）,此外,大部分优势菌属与养分TK有显著相关性（P<0.05）。研究结果表明,牛粪经堆肥发酵后,病原菌相对丰度有效降低,抗生素耐药基因相对丰度的下降与细菌菌群结构变化存在相关关系。

论文目录

• 1 材料与方法 （Materials and methods）
•   1.1 样品采集及前处理
•   1.2 养分测定
•   1.3 样品总DNA的提取
•   1.4 抗生素耐药基因测定
•   1.5 PCR扩增及高通量测序
•   1.6 数据分析
• 2 结果 （Results）
•   2.1 堆肥过程中养分变化情况
•   2.2 堆肥过程中抗生素耐药基因变化情况
•   2.3 堆肥过程中细菌的组成
•     2.3.1 堆肥过程中细菌多样性及群落结构
•     2.3.2 堆肥过程中细菌种类及变化
•     2.3.3 LEf Se分析
•   2.4 细菌菌群与养分、耐药基因相关性分析
• 3 讨论 （Discussion）
•   3.1 堆肥过程中养分、耐药基因的变化情况
•   3.2 堆肥过程中细菌群落演替情况
•   3.3 环境因子与细菌菌群的关系

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 邓雯文,杨盛智,何雪萍,晋蕾,龙梅,陈姝娟,邹立扣

关键词: 抗生素耐药基因,病原菌,牛粪,堆肥

来源: 生态毒理学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑,农业科技

专业: 环境科学与资源利用,农业基础科学,农艺学

单位: 四川农业大学资源学院,四川农业大学食品学院

基金: 国家自然科学基金项目(31400066,31671954),四川省科技厅应用基础研究项目(2017JY0118)

分类号: X713;S141.4

页码: 153-163

总页数: 11

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