DGGE法分析酱菜中酵母菌多样性

论文摘要

为了探究酱菜中酵母菌的多样性,以两种市售酱菜为研究对象,从酱菜汁中提取微生物基因组DNA。对26SrDNA基因片段进行扩增。经变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术分离混合酵母菌26SrDNA的基因条带。回收DGGE电泳中荧光度强的电泳带,经克隆后测定碱基序列,与GenBank库序列对比鉴定,并构建系统发育树。使用Quantity One软件分析DGGE凝胶图谱,分析酱菜中酵母菌的多样性。结果表明,袋装酱菜(用JA编号)样品与散装酱菜(用JB编号)样品的均匀度指数无显著差异(P>0.05)。JA样品的多样性指数和丰富度指数显著大于JB样品(P<0.05),表明JA样品的酵母菌种类较丰富。酱菜样品中的3条优势条带分别与Pichia fermentans(乳源酵母)、Candida tropicalis(热带假丝酵母)、Candida tropicalis(热带假丝酵母)的菌株相似,相似度分别为88%、98%、98%。两种酱菜样品的共有菌是Candida tropicalis(热带假丝酵母)。袋装酱菜样品的特有菌是乳源酵母(Pichia fermentans),散装酱菜样品没有特有菌种。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料与试剂
•     1.1.1 材料
•     1.1.2 试剂
•   1.2 仪器与设备
•   1.3 方法
•     1.3.1 酱菜中微生物基因组DNA的提取
•     1.3.2 26SrDNA的PCR扩增
•     1.3.3 PCR产物变性梯度凝胶电泳（DGGE）
•     1.3.4 DGGE图谱分析
•     1.3.5 系统发育分析方法
• 2 结果及分析
•   2.1 提取DNA的电泳分析
•   2.2 变性梯度凝胶电泳结果
•   2.3 酱菜微生物26SrDNA片段的DGGE图谱分析
•     2.3.1 酱菜微生物群落结构特征
•     2.3.2 酱菜不同发酵时间酵母菌类型的聚类分析
•     2.3.3 DGGE回收电泳带的鉴定
•   2.4 系统发育树分析
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 燕平梅,魏爱丽,陈燕飞,赵文婧

关键词: 酱菜,酵母菌,聚合酶链式反应,变性梯度凝胶电泳

来源: 中国调味品 2019年10期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 轻工业手工业

单位: 太原师范学院生物系,太原师范学院土壤消毒活化绿色产业技术创新战略联盟

基金: 国家自然基金项目(31171743),山西省重点研发项目(201603D221008-1)

分类号: TS255.53

页码: 136-139

总页数: 4

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