论文摘要
本文采用高通量Illumina Hiseq测序平台对紫花苜蓿(Medicago sativa)的铅胁迫处理组(Pb96)和对照组(CK)进行转录组测序,并对测序数据进行分析,探究紫花苜蓿抗铅应答的分子机制。结果表明,在铅胁迫处理下共检测到2 242个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。其中,1 321个DEGs上调表达,921个DEGs下调表达。GO (Gene ontology,http://www.geneontology.org/)富集分析,差异表达基因主要涉及物质代谢、蛋白结合、催化活性等。KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes,http://www.genome.jp/kegg/)分析,差异基因主要涉及代谢途径、光合作用、淀粉和蔗糖代谢等。COG (Clusters of orthologous groups of proteins/orthologous groups of genes)分析,差异基因主要涉及"碳水化合物的运输和新陈代谢"、"翻译、核糖体结构和生物发生"、"次生代谢产物的生物合成、转运和分解代谢"等。本研究通过对紫花苜蓿根系转录组分析,为研究紫花苜蓿耐铅分子机制提供参考。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 郭强,王英哲,王昆,徐博
关键词: 紫花苜蓿,转录组,铅胁迫,耐铅基因
来源: 草业科学 2019年10期
年度: 2019
分类: 农业科技,工程科技Ⅰ辑
专业: 环境科学与资源利用,植物保护,农作物
单位: 吉林农业大学动物科学技术学院,吉林省农业科学院,黑龙江省二九一农场畜牧兽医科
基金: 吉林省科技厅科技支撑计划“优质饲草品种选育及其配套种植技术研究与示范”(20180201072ny),吉林省教育厅科学技术研究项目“紫花苜蓿细胞质雄性不育系的细胞学和生理生化特性的研究”(JJKH20180666KJ)
分类号: S541.9;X503.231
页码: 2525-2534
总页数: 10
文件大小: 1363K
下载量: 143
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