瑟伯氏棉着丝粒重复序列鉴定

论文摘要

棉花着丝粒染色质主要由重复序列组成,包括高度重复的着丝粒反转录转座子和卫星重复序列等,但其着丝粒重复序列进化机制尚不清楚.为了深入了解着丝粒重复列的演化,利用染色质免疫共沉淀（ChIP）和中期染色体荧光原位杂交（FISH）技术对瑟伯氏棉（Gossypium thurberi,D1）着丝粒序列进行了分析.结果表明,相应的ChIP-DNA序列属于着丝粒功能区域,发现了10个较为富集的着丝粒重复序列.中期染色体FISH定位发现,CL179和CL234在四倍体陆地棉中的A和D染色体组中都有杂交信号,在二倍体A组亚洲棉中没有检测到信号,由此可推断在形成四倍体后一些着丝粒特异的重复序列进行了扩增.重复序列CL95在瑟伯氏棉以及陆地棉部分染色体的着丝粒区域出现杂交信号,而在二倍体D组雷蒙德氏棉和A组亚洲棉的着丝粒区域并没有出现信号,可认为该序列是瑟伯氏棉特异的且在四倍体形成后被保留了下来.通过对瑟伯氏棉着丝粒序列及演化的分析能够为揭示棉属植物着丝粒重复序列及染色体组的演化关系提供重要的理论依据.

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 实验材料
•   1.2 染色质免疫共沉淀
•   1.3 ChIP-DNA文库的构建
•   1.4 ChIP-Seq数据分析
•   1.5 荧光原位杂交
•     1.5.1 中期染色体的制备
•     1.5.2 探针标记
•     1.5.3 FISH检测
• 2 结果和分析
•   2.1 MNase酶切浓度的检测
•   2.2 ChIP-DNA的FISH分析
•   2.3 着丝粒重复序列的分离鉴定与进化分析
• 3 讨 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陈晔,刘玉玲,韦洋洋,杨太有,彭仁海

关键词: 瑟伯氏棉,着丝粒重复序列,染色质免疫沉淀,荧光原位杂交

来源: 河南师范大学学报(自然科学版) 2019年06期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 河南师范大学生命科学学院,安阳工学院生物与食品工程学院

基金: 国家重点研发计划(2018YFD0100300),河南省科技创新杰出人才(184200510009),河南省科技攻关(182102110048)

分类号: Q943

DOI: 10.16366/j.cnki.1000-2367.2019.06.016

页码: 103-109

总页数: 7

文件大小: 2604K

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