2013—2017年我国小反刍兽疫病毒H基因分子演化特征

论文摘要

为研究我国小反刍兽疫病毒(PPRV)的分子流行特点,对2013—2017年我国37株PPRV流行毒株进行血凝蛋白(H)基因序列测定和生物信息学分析。结果显示:37个毒株H基因核苷酸序列之间的遗传距离为0～0.007 7,变异分布在41个位点,H蛋白氨基酸序列之间的遗传距离为0～0.013 2,变异分布在24个位点。与15株代表毒株进行序列比对发现,2013—2017年我国37株PPRV流行毒株H基因的13个位点发生了核苷酸序列突变,其中9个导致了氨基酸序列的改变。以最大似然法构建分子进化树,发现2013—2017年我国流行的37个毒株构成基因4系中一个独立的进化小分支。本研究阐明了2013—2017年我国PPRV H基因的分子演化特征,从而为该病控制和消灭策略的制定提供了数据支持。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 病毒来源
•   1.2 病毒RNA提取
•   1.3 RT-PCR
•   1.4 序列测定和进化树绘制
• 2 结果
•   2.1 H基因核苷酸序列比较
•   2.2 H基因编码氨基酸序列比较
•   2.3 H基因序列差异分析
•   2.4系统发育树构建
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 刘春菊,盛琰翔,王清华,迟田英,朱琳,王英丽,马洪超,王志亮,包静月

关键词: 小反刍兽疫病毒,血凝蛋白基因,序列变异,分子演化

来源: 中国动物检疫 2019年09期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 中国动物卫生与流行病学中心,浙江农林大学

基金: 农业农村部疫情监测与防治经费项目

分类号: S852.65

页码: 19-24

总页数: 6

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