中华绒螯蟹生态育苗池塘细菌群落分析

论文摘要

为探究江苏省射阳地区沿海滩涂中华绒螯蟹（Eriocheir sinensis）生态育苗池塘细菌群落结构,分别对养殖池塘水体（S7,S8,S9）和池塘底泥（N7,N8,N9）细菌群落16SrDNA的V3、V4、V5可变区进行扩增,检测合格的文库进行高通量测序;利用Qiime（v1.7）软件,对序列阈值97%相似性水平进行聚类分析;分别以门、纲、目、科和属的分类水平对样本进行α-多样性指数分析;以Chaol指数和Shannon指数评估菌种丰富度和多样性。结果表明,3个生态育苗池塘得到OTU分别为8 881、7 406、8 566个。S7微生物归属于16门、29纲、58目、97科、191属;S8为9门、18纲、38目、68科、132属;S9为17门、32纲、60目、111科、227属。N7为41门、103纲、198目、325科、572属;N8为42门、103纲、203目、318科、534属;N9为40门、99纲、196目、323科、578属。养殖水体优势菌群以变形菌门（Proteobacteria）为主,其次是拟杆菌门（Bacteroidetes）;池塘底泥优势菌群以变形菌门为主,其次为拟杆菌门、绿弯菌门（Chloroflexi）和浮霉菌门（Planctomycetes）。养殖池塘底泥中细菌群落的丰富度和物种多样性明显高于养殖水体,水体中细菌群落的丰富度S9>S7>S8,物种的多样性S7>S9>S8。池塘底泥中细菌群落的丰富度N7>N9>N8,物种的多样性N7> N9>N8。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 样品采集
•   1.2 DNA的制备、PCR扩增和测序
•   1.3 数据处理分析
• 2 结果
•   2.1 高通量测序质量
•   2.2 OTU聚类分析
•   2.3 菌群结构
•     2.3.1 养殖水体不同池塘水体的微生物分类水平物种种类和数量见表2。
•     2.3.2 池塘底泥不同池塘底泥的分类水平物种种类和数量见表2。
•   2.4 α-多样性指数分析
• 3 讨论
•   3.1 生态育苗池塘的优势菌群组成
•   3.2 优势菌群与育苗水体物质代谢的相互作用

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 徐宇,邓燕飞,杨志强,葛家春,杨鸢劼

关键词: 中华绒螯蟹,生态育苗,养殖水体,底泥

来源: 水生态学杂志 2019年01期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,水产和渔业

单位: 江苏省淡水水产研究所,江苏省淡水水产种质资源保护与利用重点实验室

基金: 江苏省水产三新项目(D2017-4-2),江苏省科技厅现代农业项目(BE2015369)

分类号: S966.16;Q938.8

DOI: 10.15928/j.1674-3075.2019.01.010

页码: 64-70

总页数: 7

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