导读:本文包含了结构域划分论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:结构,矩阵,自由,孔隙,作用,毛细管,蛋白质。
结构域划分论文文献综述
王燕,石强,薛志东[1]（2019）在《蛋白质结构域划分方法及在线服务综述》一文中研究指出蛋白质结构域是研究蛋白质结构、功能与进化的基本单位,不同的结构域可组合出更为复杂的蛋白质分子.划分蛋白质结构域后,可以从结构域的角度研究蛋白质的结构、功能与进化,降低了研究复杂度.根据已知结构的蛋白质统计,有约40%的为多结构域蛋白质,其中还存在一级结构上不临近的氨基酸序列出现在同一个结构域的情况,即不连续结构域.文章给出了当前国内外有关蛋白质结构域边界预测、不连续结构域检测及结构域数据库与在线服务的研究进展,供相关研究者参考.(本文来源于《广州大学学报(自然科学版)》期刊2019年01期）
谢志群,许根俊[2]（2004）在《基于去折迭自由能的蛋白质结构域划分系统》一文中研究指出结构域是蛋白质的一个结构层次,可以看作蛋白质结构,折迭,功能,进化和设计的基本单位。大多数的蛋白质都可分为若干个结构域,结构域的不同组合使蛋白质具有不同的叁级结构并具有不同的功能。蛋白质结构域的划分在理论与应用上都具有重要意义,但目前对结构域的划分还没有一个十分理想的方法。划(本文来源于《第七届全国酶学学术讨论会论文摘要集》期刊2004-05-01）
谢志群,许根俊[3]（2003）在《基于去折迭自由能的蛋白质结构域划分方法——适用于连续与不连续结构域》一文中研究指出结构域是蛋白质的一个结构层次 ,可以看作是蛋白质结构、折迭、功能、进化和设计的基本单位。大多数的蛋白质都可分为若干个结构域 ,结构域的不同组合使蛋白质具有不同的叁级结构并具有不同的功能。蛋白质结构域的划分在理论与应用上都具有重要意义 ,但目前对结构域的划分还没有一个十分理想的方法。作者曾经发展了一种通过计算去折迭自由能划分蛋白质结构域的方法 ,但该方法只适用于连续双结构域的划分。现在 ,作者通过构造氨基酸残基相互作用矩阵 ,并进行对应分析 (correspondenceanalysis) ,然后根据去折迭自由能和一些经验打分函数对蛋白质进行切割和优选 ,发展了可以同时处理连续和不连续结构域的划分方法。该方法与晶体结构作者手工分析相比较 ,二者的结果有 76 %的相似。(本文来源于《生物化学与生物物理学报》期刊2003年12期）
谢志群[4]（2003）在《基于去折迭自由能的蛋白质结构域划分系统》一文中研究指出结构域是蛋白质的一个结构层次,可以看作蛋白质结构,折迭,功能,进化和设计的基本单位。大多数的蛋白质都可分为若干个结构域,结构域的不同组合使蛋白质具有不同的叁级结构并具有不同的功能。蛋白质结构域的划分在理论与应用上都具有重要意义,但目前对结构域的划分还没有一个十分理想的方法。划分结构域的核心问题是用什么标准去划定结构域的界限,而这些标准是否具备足够的合理性。基于蛋白质结构域是折迭单位的设想,蛋白质结构域的折迭与去折迭形式具有不同热力学能量状态,蛋白质结构域的折迭是由自由能变化驱动的。一般认为,天然蛋白质构象处于热力学上一个低能量态。如果认为结构域作为一种独立折迭单位,则应该不但结构上相对紧密,而且热力学能量上也必然是处于较低能量状态。折迭的单位要求伸展的蛋白质折迭成一个能量较低状态,这一点是没有问题的。而自由能和结构域作为结构、功能、进化和设计的基本单位的关系也可以在结构域具有相对稳定性和能够独立存在这一方面的要求统一起来;至于作为一个设计的基本单位,初看起来它并不是结构域本身的特性,而是一个实际应用的问题,但是,从结构域能够独立存在这一点来看,它也必然与结构域本身的特性有密切的关系。为此,我们提出了一个采用折迭自由能划分蛋白质结构域的方法,概括了结构域定义的最基本的特点。对于双结构域蛋白质,首先把一个蛋白质在序列上不同的切点划分成连续的两部分,然后用结构参数化方法分别计算蛋白质两部分的自由能,综合比较不同划分情况下蛋白质两部分的自由能, 确定该蛋白质的最佳结构域划分位点。我们一共选取 50 个不同种蛋白质的结构域划分结果作为计算的对照集,其中 49 个来自于其他结构域划分程序的结果,1 个来自于实验报道。大多数蛋白质的结构域划分结果与文献报道一致,另外一些虽然与文献报道结果不一<WP=3>ii 中文摘要致,但比文献报道结果可能更合理。说明以折迭自由能为基础划分蛋白质结构域的想法是合理和可行的。 将折迭自由能应用于连续结构域的划分得到了比较满意的结果,为了使这一方法能够应用于任意数目的、连续或不连续结构域的蛋白质系统,我们对该方法进行了全面改进,使之成为一个称之为 PDOM 的完整的结构域划分系统。基本思想是:首先构建一个氨基酸残基相互作用矩阵,然后根据残基相互作用的大小对残基重新排序,并得到一个经过重新排序,反映残基相互作用关系的残基序列;然后用以前报道的方法沿着重排序列在不同切点将蛋白质结构划分为两部分结构,比较不同切点的去折迭自由能并考虑其他影响因素确定一个最佳切点,得到两部分结构,用相同的标准,对每一部分结构,尝试进一步的划分,直到无法继续切分为止。用由 55 个蛋白质结构组成的测试数据集评估 PDOM,如果以晶体结构作者确定的结构域划分作为标准,PDOM 的划分准确率为 76%。(本文来源于《中国科学院研究生院（上海生命科学研究院）》期刊2003-11-01）
谢志群,丁达夫,许根俊[5]（2001）在《通过自由能的差别划分蛋白质连续结构域》一文中研究指出结构域是蛋白质叁级结构下面的结构层次 ,大多数的蛋白质都可分为若干个结构域 ,结构域的不同组合使蛋白质具有不同的叁级结构并具有不同的功能。蛋白质结构域的划分在理论与应用上都具有重要意义。但目前对结构域的划分还没有一个十分理想的方法。本文通过计算去折迭自由能来实现对蛋白质结构域的划分。用此方法对 5 0种不同蛋白质序列连续的双结构域进行了分析 ,大多数蛋白质的结构域划分结果与文献报道一致 ,另外一些虽然与文献报道结果不一致 ,但比文献报道的结果更合理(本文来源于《生物化学与生物物理学报》期刊2001年04期）
李瑜[6]（1998）在《孔隙结构域的划分》一文中研究指出对孔隙结构的要素进行了讨论，在此基础上对孔隙结构域进行了划分。其目的是为了能定量地解释孔隙结构的各种性质。(本文来源于《成都理工学院学报》期刊1998年02期）
结构域划分论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
结构域是蛋白质的一个结构层次,可以看作蛋白质结构,折迭,功能,进化和设计的基本单位。大多数的蛋白质都可分为若干个结构域,结构域的不同组合使蛋白质具有不同的叁级结构并具有不同的功能。蛋白质结构域的划分在理论与应用上都具有重要意义,但目前对结构域的划分还没有一个十分理想的方法。划
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
结构域划分论文参考文献
[1].王燕,石强,薛志东.蛋白质结构域划分方法及在线服务综述[J].广州大学学报(自然科学版).2019
[2].谢志群,许根俊.基于去折迭自由能的蛋白质结构域划分系统[C].第七届全国酶学学术讨论会论文摘要集.2004
[3].谢志群,许根俊.基于去折迭自由能的蛋白质结构域划分方法——适用于连续与不连续结构域[J].生物化学与生物物理学报.2003
[4].谢志群.基于去折迭自由能的蛋白质结构域划分系统[D].中国科学院研究生院（上海生命科学研究院）.2003
[5].谢志群,丁达夫,许根俊.通过自由能的差别划分蛋白质连续结构域[J].生物化学与生物物理学报.2001
[6].李瑜.孔隙结构域的划分[J].成都理工学院学报.1998
论文知识图
