肽质量指纹论文-李凤,张艳梅,何金娇,霍燕燕

肽质量指纹论文-李凤,张艳梅,何金娇,霍燕燕

导读:本文包含了肽质量指纹论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:新红细胞生成刺激蛋白,糖基化,质谱,亲水相互作用色谱

肽质量指纹论文文献综述

李凤,张艳梅,何金娇,霍燕燕[1](2018)在《液相色谱-串联质谱法分析新红细胞生成刺激蛋白的肽质量指纹图谱和糖肽结构》一文中研究指出新红细胞生成刺激蛋白(NESP)是一种复杂的糖蛋白类药物,主要用于治疗慢性肾衰引起的贫血,含有5个N-连接和1个O-连接的糖基化位点。本研究建立了液相色谱-串联质谱法分析NESP的肽质量指纹图谱和糖肽结构。采用胰蛋白酶将所有糖基化位点酶解成肽段,分别采用高效液相色谱(HPLC)及两性离子亲水相互作用色谱(ZIC-HILIC)分析。与HPLC相比,ZIC-HILIC对O-糖肽的分离效果较理想,质谱信号响应也更强。在此基础上,尝试采用ZIC-HILIC对非特异性蛋白酶链霉蛋白酶E(Pronase E)酶解肽段进行分析。根据MS/MS碎片信息,一共鉴定了3种类型的O-糖肽,其糖链组成为GalNAcGal(Neu Ac)_2、GalNAcGal(NeuAc)_1和GalNAcGal。(本文来源于《中国医药工业杂志》期刊2018年06期)

张慧芳,陶晓霞,何利华,闫笑梅,王忱诚[2](2016)在《传代培养对基于肽质量指纹谱的细菌识别稳定性的影响分析》一文中研究指出目的应用肽质量指纹谱技术对多次传代细菌进行识别,分析细菌传代对细菌识别能力的影响。方法将幽门螺杆菌、大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌分别连续传57、50、100代,金黄色葡萄球菌留取抗原。每一代新鲜培养菌和冻存抗原通过乙醇/甲酸法提取蛋白,采用肽质量指纹谱技术进行谱图采集和菌株鉴定。进一步采用Nano LC-MS/MS对幽门螺杆菌基于肽质量指纹谱识别的蛋白进行批量鉴定。结果幽门螺杆菌、大肠埃希菌分别连续传57代和50代,采用肽质量指纹谱每代均能正确识别到种水平;金黄色葡萄球菌连续传100代,采用肽质量指纹谱每代新鲜菌株及冻存抗原均能正确识别到种水平,各代冻存抗原和新鲜菌株的肽质量指纹谱具有很好的一致性。幽门螺杆菌蛋白扫描分析,鉴定出206个蛋白,包括各种酶类(29.6%)、核糖体蛋白(15.5%)、外膜蛋白(10.7%)、假想蛋白(19.0%)、转运相关蛋白(2.0%)、其他蛋白(22.0%)。结论细菌连续传代和抗原冻存不影响肽质量指纹谱对菌株的正确识别,细菌的肽质量指纹谱具有传代稳定性。(本文来源于《疾病监测》期刊2016年09期)

向明霞[3](2013)在《南方水牛奶酪蛋白分离纯化及与非乳源蛋白肽质量指纹图谱差异性研究》一文中研究指出本研究以南方水牛奶为原料,钙尿素沉淀法和离子交换法对南方水牛奶酪蛋白的主要组分进行分离,聚丙烯酰胺凝胶电泳法(SDS-PAGE),反相高效液相色谱法(RP-HPLC)和LTQ Orbitrap质谱法对其组分进行分析。这些方法为酪蛋白的大批量分离提供了理论依据,为食品领域对南方水牛奶酪蛋白快速质量检测和鉴定方法提供了技术手段,为来自酪蛋白不同组分的生物活性肽的研究及各种功能性食品的研究开发奠定了基础。其研究结果如下:1、化学沉淀法分离酪蛋白(CN)的结果表明,钙沉淀酪蛋白时,当CaCl2浓度为0.09mol/L时分离出来的κ-酪蛋白(κ-CN)纯度较高,可达到95.84%,得率约为384mg/100mL;钙低温体系可获得高纯度的β-酪蛋白(β-CN),其纯度可达到99.00%,得率为113mg/100mL,但是获得的αs-酪蛋白(αs-CN)纯度较低,最高只有63.72%,得率为1696mg/100mL;钙尿素体系可较好的将αs-CN和β-CN组分分离,纯度分别可达到83.43%和69.80%。得率分别为943mg/100mL和468mg/100mL,过高的尿素浓度不适合用于酪蛋白组分的分离。2、离子交换色谱分离酪蛋白组分时,用Z系列φ1.0×40cm色谱柱,DEAE-Sepharose CL-6B为离子交换介质,以含3mol/L尿素,0.1%β-巯基乙醇(β-ME),pH值为8.0的50mmol/L的Tris-HCl缓冲液为平衡液,用含不同浓度NaCl的平衡液进行洗脱,流速为2mL/min,在280nm紫外检测波长下检测,NaCl浓度梯度为0.1mol/L,0.2mol/L,0.3mol/L的梯度洗脱可将αs-CN从其他组分中分离开来,电泳检测其纯度可达99.90%;当NaCl浓度梯度分别为0.16mol/L,0.20mol/L,0.24mol/L条件下,可以分别洗脱得到酪蛋白的κ-CN,β-CN和αs-CN叁种组分,将各组分都分离开来,高效液相色谱检测其纯度分别为92.0%,99.5%,99.8%。3、反相高效液相色谱分析结果表明,在流速1.0mL/min,检测波长214nm、以0.1%叁氟乙酸(TFA)水溶液为流动相A,100%乙腈溶液为流动相B对酪蛋白进行线性梯度洗脱,酪蛋白的4种组分κ-CN,αs2-CN,αs1-CN,β-CN分别先后被洗脱下来。在一定的蛋白浓度范围内,酪蛋白4种组分的含量和峰面积有良好的线性关系,相关系数均大于0.9990,加标回收率在86%~97%范围内,且实验的重复性和重现性良好。经过对比分析酪蛋白,大豆蛋白和加入大豆蛋白的酪蛋白溶液高效液相色谱图差异性发现,添加了大豆蛋白的酪蛋白溶液高效液相色谱图在保留时间约8.5min,14.8min,20~27min时均出现特征峰。此方法为检测牛奶蛋白中是否添加廉价蛋白提供了依据。4、利用LTQ Orbitrap XL组合型傅立叶变换高分辨质谱建立了南方水牛奶酪蛋白和大豆蛋白主要组分肽指纹图谱,并对其氨基酸序列进行比较的结果表明,酪蛋白经胰蛋白酶酶解后得到的肽段没有与大豆蛋白匹配的肽段,酪蛋白的主要组分αs1-CN,β-CN,κ-CN和大豆蛋白的主要组分大豆球蛋白(包括大豆球蛋白G1~G5亚基)和β伴大豆球蛋白(α,α',β链)亚基的氨基酸数量,组成比例和排列方式也明显不同。此种方法为鉴定分析牛奶蛋白中是否添加廉价蛋白提供了高精度和高准确度的检测手段,同时,为复杂混合物中的痕量组分检出提供了可靠的依据。(本文来源于《暨南大学》期刊2013-06-30)

李华玮,何金环,郑鸣[4](2013)在《王浆高产蜜蜂工蜂幼虫发育期肽质量指纹图谱的建立》一文中研究指出【目的】研究王浆高产蜜蜂(Apis mellifera L.)工蜂幼虫发育期蛋白质的组成及功能,以探明其发育机理,为阐明该蜂种王浆高产机理提供理论依据。【方法】采用双向电泳法对王浆高产蜜蜂2,4,6日龄的工蜂幼虫进行蛋白质组分析,获得图谱中蛋白质的种类、表达量、等电点和分子质量等信息,并通过质谱分析、数据库检索,鉴定部分蛋白。【结果】在2,4和6日龄的浆蜂工蜂幼虫中分别检测到262,418,194个蛋白,利用质谱技术鉴定的48个浆蜂工蜂幼虫发育期高丰度蛋白中有22个蛋白被鉴定出来,它们均属于蜜蜂数据库。与营养相关的蛋白有5个MRJP2、3个MRJP3和1个LSP2,与物质能量代谢相关的蛋白包括Arginine kinase、Aldehyde dehydrogenase、Eno-lase、Phosphoglycerate mutase、ATP synthase alpha subunit和ATP synthase,3个热激蛋白分别是HSP 60、HSC 70-3和HSP 8,4个与氨基酸、脂肪酸、幼虫生长和细胞周期相关的蛋白分别是Fatty acid binding protein、imaginal discgrowth factor、lethal Band-7-prohibitin和Ornithine aminotransferase。【结论】王浆高产蜜蜂幼虫的发育过程有大量基因参与表达和调控,是一个复杂而动态有序的过程;在王浆高产蜜蜂幼虫发育期,与物质能量代谢及脂肪酸、氨基酸代谢相关的蛋白表达上调,说明幼虫在整个发育过程中需要大量能量,新陈代谢逐渐旺盛;持续表达的热激蛋白对减轻逆境胁迫引起的伤害起到一定作用,保证了王浆高产蜜蜂幼虫发育的正常进行。(本文来源于《西北农林科技大学学报(自然科学版)》期刊2013年03期)

高静,王涌,温新宇,鲁鸿昊,董振南[5](2011)在《肽质量指纹图谱鉴别诊断IgA肾病和非IgA肾病的可行性分析》一文中研究指出目的探索肽质量指纹图谱(PMF)在IgA肾病和非IgA肾病的分类中是否可行。方法采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)分析IgA肾病和非IgA肾病患者的血清肽质量指纹图谱。结果 IgA肾病和非IgA肾病的血清肽质量指纹图谱具有9个差异多肽;其中,最显着的两个多肽峰是4476.46和1968.10,ROC曲线下面积分别为86.18%和79.77%;主因素分析(PCA)表明前8个因素(差异峰)的累积解释变异量超过95%,说明该模型的鉴别诊断能力较MA好L。DI比-T对OF蛋质白谱质技数术据在库Ig,A多肾肽病53和3非8.0I8gA为肾粘病蛋的白分4类同中工,型具的有片可段行;性而,此多技肽术20在82系.7统7为疾α病1-的Ⅱ亚型类胶分原类同中工具型有的广片阔段的。前景结。论(本文来源于《南方医科大学学报》期刊2011年08期)

项敏泓,张兴儒,李青松,张梦晖,鲁静[6](2010)在《结膜松弛症泪液蛋白质肽质量指纹谱分析》一文中研究指出目的分析结膜松弛症泪液蛋白表达谱的变化。方法收集22例结膜松弛症患者和13例正常对照组的泪液样本,毛细管从每眼收集15μL泪液,采用ZipTip C18柱浓缩和纯化泪液样本,利用基质辅助的激光解吸质谱进行线性模式和肽质量指纹谱(PMF)检测,并对PMF图谱数据进行多变量数据统计分析,比较结膜松弛症组和正常对照组的泪液PMF的差异。结果2组泪液的质谱检测峰在数量上差异无统计学意义(P>0.05),主成分分析结合偏最小二乘法分析显示结膜松弛症组泪液蛋白质表达与正常对照组比较有差异,结膜松弛症组泪液蛋白质表现为"离群"样本,且离群分散度较大的样本为结膜松弛症Ⅳ级的患者。结论应用ZipTipC18柱分离联合基质辅助的激光解吸质谱技术可有效筛查泪液蛋白质。对PMF图谱进行多变量数据统计分析,可以观察到结膜松弛症组与正常对照组泪液蛋白质存在差异,并可为结膜松弛症临床诊断、疾病发生发展的机理及治疗提供参考。(本文来源于《眼科新进展》期刊2010年01期)

胡家,李燕英,孙丽翠,殷爱红,武文琦[7](2009)在《Hela细胞蛋白质分离和肽质量指纹谱鉴定方法的建立》一文中研究指出目的研究Hela细胞总蛋白质的分离及利用肽质量指纹谱对蛋白质进行鉴定的方法。方法提取了Hela细胞的总蛋白质,通过双向电泳技术对蛋白质进行了分离,并应用图像扫描仪及图像分析软件获取蛋白质点的数字化信息。对其中不同丰度的蛋白质点,进行胶内酶切后,通过基质辅助激光解吸/电离直角型飞行时间质谱(MALDIO-TOF-MS)分析,再将检测出的多肽质量数通过Mascot搜索引擎检索NCBInr数据库。结果获得了Hela细胞总蛋白质双向电泳图谱及蛋白质点的数字化信息,通过MALDIO-TOF-MS检测得到的肽质量指纹谱再经过网上公共数据的检索从而获得3个蛋白质点分别是α-葡萄糖苷酶(α-glucosidase)、γ-肌动蛋白(γ-actin)和过氧化物酶2(peroxiredoxin 2)。结论Hela细胞总蛋白质双向电泳的分离效果较好,肽质量指纹谱法能有效地对Hela细胞的蛋白质斑点进行鉴定。(本文来源于《首都医科大学学报》期刊2009年03期)

彭咏波,母昭德,马永平,夏永鹏,邱宗荫[8](2008)在《采用MS-Fit进行肽质量指纹谱鉴定蛋白质时主要参数的优化》一文中研究指出目的:为了优化肽质量指纹谱(Peptide mass fingerprinting,PMF)鉴定蛋白质时采用MS-Fit引擎搜索的分析参数。方法:将2-DE分离后的Carbonic anhydrase-2和BSA进行胶内充分酶解,肽段经过MALDI-TOF-MS分析得到PMF数据。选择Swissprot数据库,以Carbonic anhydrase2为模型优化搜索参数。结果:主要搜索参数的最佳设置为:半胱氨酸修饰为Carbamidomethylation,肽质量容错模型为百分数,在研究中0.1%容错数为最好。结论:本文通过标准蛋白对搜索主要参数的优化,建立了方便、可靠的MS-Fit搜索参数模式。(本文来源于《重庆医科大学学报》期刊2008年07期)

彭咏波,马永平,夏永鹏,邱宗荫[9](2008)在《肽质量指纹谱鉴定蛋白质时生物信息学分析条件的优化》一文中研究指出为了优化肽质量指纹谱(peptide mass fingerprint,PMF)鉴定蛋白质的生物信息学分析条件。将牛碳酸酐酶2(carbonic anhydrase-2,CAH2)和人热休克蛋白70s(Hsp70s)进行2-DE分离、酶解,肽段经过MALDI-TOFMS分析得到PMF数据。选择Swissprot、MSDB、NCBInr、Random等数据库和MASCOT与MS-Fit搜索引擎,以牛CAH2为模型优化搜索参数,结果表明:Swissprot是适合做蛋白PMF分析的数据库;主要参数最佳设置为:漏切位点数为1个,肽质量容错数为±1Da,同时肽质量类型选择平均分子质量比单同位素质量更便于候选蛋白的筛选。最后用人Hsp70s蛋白的PMF数据检验优化条件,结果表明,所选择的数据库及参数是可靠的。(本文来源于《分析化学》期刊2008年04期)

吴松锋,薛晓芳,张纪阳,应万涛,马洁[10](2008)在《一种可用于评估肽质量指纹谱数据的方法——反转错位数据库》一文中研究指出反转数据库常被用于估算大规模蛋白质组研究中串联质谱搜索数据库结果的可靠性。然而,对于经典的且现在依然在产出的肽质量指纹谱的数据,这种方法并不适用。为解决该问题,构建了另外一种随机数据库,称为反转错位数据库。这种数据库是在反转数据库的基础上,将序列中的K和R及其后的氨基酸交换位置(对于胰蛋白酶切割的结果)获得。这种处理避免了某些肽段因前后胰蛋白酶酶切位点氨基酸相同而在序列反转后质量依然不变,导致肽质量指纹谱法无法区分的问题。通过串联质谱和肽质量指纹谱测试数据的搜索结果,证明了这种方法同时适用于串联质谱和肽质量指纹谱的数据。这种方法扩大了经典反转数据库的适用范围,将对评估和整合串联质谱和肽质量指纹谱的数据具有重要意义。(本文来源于《分析化学》期刊2008年04期)

肽质量指纹论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的应用肽质量指纹谱技术对多次传代细菌进行识别,分析细菌传代对细菌识别能力的影响。方法将幽门螺杆菌、大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌分别连续传57、50、100代,金黄色葡萄球菌留取抗原。每一代新鲜培养菌和冻存抗原通过乙醇/甲酸法提取蛋白,采用肽质量指纹谱技术进行谱图采集和菌株鉴定。进一步采用Nano LC-MS/MS对幽门螺杆菌基于肽质量指纹谱识别的蛋白进行批量鉴定。结果幽门螺杆菌、大肠埃希菌分别连续传57代和50代,采用肽质量指纹谱每代均能正确识别到种水平;金黄色葡萄球菌连续传100代,采用肽质量指纹谱每代新鲜菌株及冻存抗原均能正确识别到种水平,各代冻存抗原和新鲜菌株的肽质量指纹谱具有很好的一致性。幽门螺杆菌蛋白扫描分析,鉴定出206个蛋白,包括各种酶类(29.6%)、核糖体蛋白(15.5%)、外膜蛋白(10.7%)、假想蛋白(19.0%)、转运相关蛋白(2.0%)、其他蛋白(22.0%)。结论细菌连续传代和抗原冻存不影响肽质量指纹谱对菌株的正确识别,细菌的肽质量指纹谱具有传代稳定性。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

肽质量指纹论文参考文献

[1].李凤,张艳梅,何金娇,霍燕燕.液相色谱-串联质谱法分析新红细胞生成刺激蛋白的肽质量指纹图谱和糖肽结构[J].中国医药工业杂志.2018

[2].张慧芳,陶晓霞,何利华,闫笑梅,王忱诚.传代培养对基于肽质量指纹谱的细菌识别稳定性的影响分析[J].疾病监测.2016

[3].向明霞.南方水牛奶酪蛋白分离纯化及与非乳源蛋白肽质量指纹图谱差异性研究[D].暨南大学.2013

[4].李华玮,何金环,郑鸣.王浆高产蜜蜂工蜂幼虫发育期肽质量指纹图谱的建立[J].西北农林科技大学学报(自然科学版).2013

[5].高静,王涌,温新宇,鲁鸿昊,董振南.肽质量指纹图谱鉴别诊断IgA肾病和非IgA肾病的可行性分析[J].南方医科大学学报.2011

[6].项敏泓,张兴儒,李青松,张梦晖,鲁静.结膜松弛症泪液蛋白质肽质量指纹谱分析[J].眼科新进展.2010

[7].胡家,李燕英,孙丽翠,殷爱红,武文琦.Hela细胞蛋白质分离和肽质量指纹谱鉴定方法的建立[J].首都医科大学学报.2009

[8].彭咏波,母昭德,马永平,夏永鹏,邱宗荫.采用MS-Fit进行肽质量指纹谱鉴定蛋白质时主要参数的优化[J].重庆医科大学学报.2008

[9].彭咏波,马永平,夏永鹏,邱宗荫.肽质量指纹谱鉴定蛋白质时生物信息学分析条件的优化[J].分析化学.2008

[10].吴松锋,薛晓芳,张纪阳,应万涛,马洁.一种可用于评估肽质量指纹谱数据的方法——反转错位数据库[J].分析化学.2008

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