虾源副溶血弧菌致病基因检测与ERIC-PCR分型

论文摘要

为了监测上海市养殖对虾中副溶血弧菌致病基因的携带情况及潜在致病株流行情况,采用PCR方法对上海地区不同对虾养殖单位中分离获得的19株副溶血弧菌分离株及1株标准菌株进行6种致病基因的检测筛查,并采用ERIC-PCR方法进行基因分型分析。结果发现:19株副溶血弧菌中未检测出携带tdh、ORF8基因,只有1株携带trh基因,而tox RS/new基因携带率较高,19株中有14株检出阳性,基因携带率为73.7%。对能够引起对虾急性肝胰腺坏死病（AHPND）的副溶血弧菌特异性质粒基因的检测中发现,AP1和AP2基因均有3株检测出阳性,基因携带率均为15.8%。通过ERIC-PCR分型技术将20株副溶血弧菌分成7个不同的类群,其分辨力指数DI值为0.811,表明ERIC-PCR具有较好的基因分型能力,分型结果发现该方法能够有效区分不同时间段获得的菌株,而对不同地理位置获得的菌株区分并不明显。以上结果表明从养殖对虾中分离得到的副溶血弧菌致病基因携带率总体偏低,但存在一定的流行风险,需要防范一些新的致病株的流行,这些可以为对虾养殖单位中副溶血弧菌致病流行株的预防控制提供相关参考。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 菌株来源及编号
•   1.2 主要试剂
•   1.3 菌株活化
•   1.4 致病基因检测方法
•     1.4.1 基因组和质粒DNA的提取
•     1.4.2 引物设计与合成
•     1.4.3 致病基因的PCR扩增
•     1.4.4 PCR产物检测
•   1.5 分离株的ERIC-PCR分型
•     1.5.1 引物设计与合成
•     1.5.2 ERIC-PCR扩增
•     1.5.3 ERIC-PCR产物的电泳检测
•     1.5.4 ERIC-PCR图谱分析
• 2 结果与分析
•   2.1 分离株致病基因检测结果
•   2.2 分离株ERIC-PCR扩增结果
•   2.3 分离株ERIC-PCR图谱分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张海强,安伟,肖雨

关键词: 副溶血弧菌,致病基因,基因分型

来源: 上海海洋大学学报 2019年06期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 水产和渔业

单位: 上海市水产研究所上海市水产技术推广站

基金: 上海市农委青年人才项目(SYXF011719),上海市虾类产业技术体系(沪农科产字[2014]第5号),上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科政字[2014]第7-3-5号)

分类号: S945.4

页码: 848-856

总页数: 9

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