三岔湖沉积物中葡萄糖脱氢酶gcd基因的多样性及其与环境因子的关系

论文摘要

为了研究沉积物中葡萄糖脱氢酶gcd基因多样性及其与环境因子的关系,揭示对水体富营养化有重要影响的微生物类群,分别于2017年的春季和秋季对三岔湖沉积物及其表层上覆水采样,对沉积物基因组DNA的gcd基因进行高通量测序,分析gcd基因多样性和群落结构特征,探讨其与环境因子之间的关系.结果表明:①12个样品共得到219 778条有效序列,分属于6门、9纲、15目、29科、46属、610个OTUs,主要来源于变形菌门（25.10%～98.85%）、酸杆菌门（0～3.99%）.②gcd基因序列系统发育树分为两支,四亚支,基因序列主要归属于根瘤菌目、伯克氏菌目、海洋螺菌目、假单胞菌目、酸杆菌目.③gcd基因的生物多样性大小为春季>秋季,湖中心>湖坝>湖尾;在gcd基因细菌群落组成上,季节性变化对L1、L2、L3、L5采样点影响较小,而对L4和L6采样点影响较大.④gcd基因的生物多样性与ρ（DO）、w（TP）、w（HCl-P）、ρ（DTP）显著相关,gcd基因的OTU组成和分布与ρ（DO）、ρ（DTP）显著相关.研究显示,三岔湖水体沉积物中的gcd基因具有较高的生物多样性,组成和分布呈现异质性,对ρ（DTP）具有重要影响作用.

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 采样点的描述与沉积物的采集
•   1.2 沉积物和上覆水理化因子的测定
•   1.3 DNA提取和PCR扩增
•   1.4 高通量测序及数据处理分析
•   1.5 统计分析
• 2 结果和讨论
•   2.1 沉积物和上覆水理化性质
•   2.2 OTU分类鉴定和基因的系统发育分析
•   2.3 Alpha和Beta多样性分析
•   2.4 gcd基因细菌群落组成变化分析
•   2.5 三岔湖沉积物gcd基因细菌群落与环境因子的相关性
•     2.5.1 gcd基因细菌群落生物多样性与环境理化因子的相关性
•     2.5.2 gcd基因细菌群落空间分布特征与环境因子的相关性
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李勇,张建强,付文丽,吴东明

关键词: 三岔湖,富营养化水体,沉积物,高通量测序,基因,多样性

来源: 环境科学研究 2019年12期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 环境科学与资源利用

单位: 西南交通大学地球科学与环境工程学院

基金: 四川省科技计划资助(No.2018GZ0416)~~

分类号: X524

DOI: 10.13198/j.issn.1001-6929.2019.03.06

页码: 2040-2047

总页数: 8

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