抗逆基因论文_解美霞,杨君,王国宁,李志坤,张艳

导读:本文包含了抗逆基因论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:基因,生物,信息学,抗逆性,小麦,陆地棉,差异。

抗逆基因论文文献综述

解美霞,杨君,王国宁,李志坤,张艳[1](2019)在《基于表达谱分析陆地棉DUF642基因家族抗逆功能》一文中研究指出【目的】DUF642(Domain of unknown function 642 genes)是1个未知功能基因家族,在植物逆境胁迫响应中发挥重要作用。本研究旨在分析其在棉花抗逆反应中的功能。【方法】基于陆地棉基因组数据,系统地鉴定DUF642基因家族。利用生物信息学方法分析基因结构、理化性质、亚细胞定位、亲缘关系、启动子顺式作用元件等。应用转录组数据和实时定量聚合酶链式反应技术分析该家族基因在不同组织和多种逆境(冷、热、干旱、盐和黄萎病菌)胁迫下的表达规律。【结果】陆地棉基因组中包含23个DUF642基因,分布于14条染色体和1条Scaffold;编码的蛋白含有1~2个保守的DUF642结构域,多定位在细胞膜。DUF642家族基因可分成4个亚组,在进化上相对保守。DUF642基因具有较为广泛的组织表达类型,其中根和叶中表达较高。通过启动子和胁迫表达分析,推测Gh DUF642-09参与棉花抗盐胁迫;GhDUF642-08和GhDUF642-19参与棉花抗黄萎病;GhDUF642-02、GhDUF642-14和Gh DUF642-17参与棉花生长发育和抗逆胁迫。【结论】本研究结果为进一步研究DUF642基因家族功能和棉花抗逆分子机制提供了重要的理论依据。(本文来源于《棉花学报》期刊2019年06期)

敖竹兰,郭永辉,江琛,李龙盘,刘鹏[2](2019)在《水稻抗逆性基因OsGATA23可变剪切的生物信息学分析》一文中研究指出水稻OsGATA家族第Ⅶ亚家族基因OsGATA23有两个成员,其中一个成员OsGATA23a是多应激反应转录因子,在盐碱度ABA处理和干旱条件下高度表达.利用生物信息学技术,从核酸和蛋白层面分析OsGATA23a亚基在非生物胁迫下显着表达,OsGATA23b亚基在该胁迫下不表达或低表达的影响因素.结果表明,OsGATA23基因的两个亚基蛋白结构的稳定性不同引起表达不同.首先,运用生物信息学技术对GATA23的蛋白性质、功能、结构进行分析;其次,对启动子顺式作用元件进行统计分析.比对水稻OsGATA23基因亚基及亚基差异氨基酸序列的理化性质发现OsGATA23a-1蛋白结构比较稳定.OsGATA23a平均亲水系数为0.327,该段氨基酸序列疏水.OsGATA23a-1氨基酸序列段存在信号肽位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化活性位点,而OsGATA23b-1不存在.在OsGATA23a-1中α螺旋显著减少,延伸链显着增加.OsGATA23b-1中α螺旋减少,无规则卷曲显着增加.对OsGATA23a和OsGATA23b蛋白叁级结构模拟发现其亚基结构组成大致相似,对OsGATA23a-1、OsGATA23b-1蛋白叁级结构模拟时,发现OsGATA23b-1在计算机算法上不存在稳定的叁级结构构象,而无法模拟.OsGATA23基因启动子序列正反链上存在较多与逆境、根等相关的顺式作用元件.在非生物应激状态下,上游相关顺式作用元件选择性识别下游基因OsGATA23成员中具有比较稳定的疏水蛋白结构OsGATA23a亚基,同时在OsGATA23a-1存在信号肽位点,说明OsGATA23a-1不仅有利于OsGATA23a亚基蛋白结构的优化,而且还能被特异性识别.OsGATA23b亚基在逆境状态下不表达或低表达,说明OsGATA23b-1不利于OsGATA23b亚基蛋白结构稳定,且不能被特异性识别.(本文来源于《湖北大学学报(自然科学版)》期刊2019年06期)

刘自广,刘娣,王文涛,郭镇华,汪亮[3](2019)在《低温对大白猪抗逆基因表达的影响》一文中研究指出为探讨大白猪抗逆基因在低温下的表达变化规律,试验选取5月龄大白猪6头,随机分2组,分别饲养于哈尔滨冬季冷舍(-18℃)和暖舍(20℃)中15 d,饲养结束后取试验猪肝脏组织进行转录组测序,对测序结果进行生物信息学分析。结果表明:低温对大白猪的基因表达影响较大,表达差异在2倍以上的基因有564个。这些表达差异基因作为大白猪抗逆基因候补,主要富集在免疫功能、脂质代谢、糖类代谢通路。说明低温可活化大白猪的免疫系统,并调动抗逆基因积极进行脂质代谢和糖类代谢,达到促进热量产生并保持体温恒定的目的。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2019年17期)

陈佳琦,董礼,樊悦,王妮[4](2019)在《基因枪介导抗逆相关基因转化小麦的研究》一文中研究指出目前,植物结构培养技术、DNA体外重组等技术已经被应用于农作物育种。破生殖隔离这项转基因技术可以利用基因库创建新的条件,同时还能提供新的创造变异技术门径。基于此,分析并研究相关技术,以期为广大研究者提供参考借鉴。(本文来源于《种子科技》期刊2019年08期)

韩冉,李玉莲,汪晓璐,宫文萍,李豪圣[5](2019)在《TaAAP3基因对小麦单株产量及抗逆性影响的初步研究》一文中研究指出氨基酸通透酶(Amino acid permease,AAP)家族,由AAP1-AAP8等基因编码,在氨基酸转运、吸收和氮代谢过程中起着关键作用。本研究以近十余年来山东省产量增幅最大的旱地小麦新品种济麦262为材料,克隆了TaAAP3基因。TaAAP3全长1780bp,由4个外显子和3个内含子组成,编码491个氨基酸。转基因试验结果显示,过表达TaAAP3阳性小麦植株与对照相比,分蘖数平均增加3.8个,株高平均增加4.5cm,穗粒数、穗粒重、千粒重、旗叶长、旗叶宽、穗长、小穗数与对照相比差异不显着。产量统计结果显示,转基因阳性植株产量极显着高于对照。另外,NaCl溶液胁迫下,转基因阳性植株的发芽率(35.5%)显着高于对照(24.0%),相对根长(0.41)和相对苗长(0.74)显着高于对照(0.36和0.66)。荧光实时定量PCR对非生物胁迫处理下TaAAP3的表达动态结果显示,TaAAP3受盐、干旱、ABA和低温诱导,不同胁迫下其表达模式不同。目前,我们正在对材料氨基酸含量进行测定,以期获得TaAAP3与小麦单株增产以及与抗逆性的关系。(本文来源于《第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集》期刊2019-08-11)

王景一,毛新国,王瑞同,李昂,赵光耀[6](2019)在《通过酵母文库筛选小麦抗逆相关基因》一文中研究指出非生物胁迫严重影响粮食安全,发现和利用抗逆功能基因是作物改良的当务之急。本研究以抗旱耐热小麦品种旱选10号为材料,构建了酵母cDNA文库,筛选出了对低温、盐和/或渗透胁迫有响应的小麦基因。具体来说,本研究通过对文库进行低温、盐或渗透胁迫处理,筛选出逆境下存活的酵母,测序分离出7249、4313和4469条序列,得到与之对应的4695、2641和2771个基因。维恩图显示有377个基因在叁种处理条件下都能得到。GO分析表明,这些基因主要参与代谢和响应胁迫信号通路。KEGG途径富集分析表明,所分离的基因主要属于能量和代谢途径。本研究选择病程相关蛋白(PR)家族中TaPR-1-1进行进一步的研究。之前的研究表明PR基因在病原体侵袭过程中起作用,我们的结果显示TaPR-1-1的表达也受到冷冻、盐和渗透胁迫的诱导。并且在酵母和拟南芥中过表达表明TaPR-1-1能增强其胁迫耐受性。总之,我们认为,在非生物胁迫条件下,筛选cDNA酵母文库是鉴定抗逆基因的有效途径。(本文来源于《第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集》期刊2019-08-11)

薛巨坤,王博,王莲萍,杨春雨,国会艳[7](2019)在《与植物抗逆相关的miR-398-3p基因家族进化分析及靶基因预测》一文中研究指出通过生物信息学方法对miR-398-3p基因家族进行序列分析和靶基因预测。结果表明,大部分miR-398-3p基因分布在不同的染色体上,miR-398-3p序列在不同物种间具有高度的保守性。进化分析结果表明,miR-398-3p基因家族的成员呈现为7个分支,个别物种miR-398-3p的不同成员具有较远的亲缘关系;miR-398-3p的靶基因具有超氧化物歧化酶[Cu-Zn]、花粉特异性蛋白质SF3、锌指蛋白WIP2、C2H2型锌指家族蛋白等功能,参与植物的生物和非生物胁迫及生长发育调控过程。(本文来源于《湖北农业科学》期刊2019年14期)

张皓,崔杰,李俊良,李昕晏,王琮玉[8](2019)在《甜菜抗逆基因P5CS的克隆及盐胁迫下的表达分析》一文中研究指出脯氨酸在植物适应逆境胁迫中起重要作用,脯氨酸合成酶(Proline synthetase)是脯氨酸合成代谢的关键酶,深入研究编码该酶的基因,对了解逆境下脯氨酸积累的分子机理、提高其抗逆性意义重大。本研究采用RT-PCR技术从甜菜中克隆了△1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(P5CS)基因,利用生物信息学方法对序列进行了比对及其理化特性、结构域分析,该基因ORF为2 151 bp,编码由716个氨基酸组成的蛋白。序列已提交到GENBANK(ID:KY019201)。采用实时荧光定量PCR技术测定不同时间高盐(300 mmol/L NaCl)胁迫下对甜菜幼苗叶片P5CS基因相对表达量的影响,结果表明:随着处理时间的延长,幼苗受胁迫程度加深,P5CS基因的表达上调明显,进一步说明该基因响应逆境胁迫,本研究为今后深入研究提供了依据。(本文来源于《中国糖料》期刊2019年03期)

贾笛迩,朱紫薇,孙功祥,李媛,舒忠泽[9](2019)在《夏玉米对高温胁迫的生理响应及抗逆基因表达研究进展》一文中研究指出高温是玉米种植区域的非生物胁迫之一,高温胁迫对玉米生理变化及基因表达产生不利影响,导致玉米产量和品质降低。该文对高温胁迫下夏玉米生理变化和基因表达进行了综述:高温诱导夏玉米电导率及脂膜过氧化产物丙二醛(MDA)含量增加,超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)、抗坏血酸过氧化酶(APX)、谷胱甘肽还原酶(GR)等抗逆性酶活性提高;高温胁迫还导致穗位叶净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、最大光化学效率、光量子产量、光化学猝灭系数、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)和核酮糖二磷酸羧化酶活性降低,CO2浓度和非光化学猝灭系数提高。同时,高温胁迫诱导了夏玉米耐热基因的表达量增加,提高了其耐热性。夏玉米对高温胁迫无论生理变化还是基因表达量增加,均存在基因型间的显着差异。(本文来源于《农业灾害研究》期刊2019年03期)

任美艳[10](2019)在《沙冬青叁个抗逆相关NAC转录因子基因的克隆与功能研究》一文中研究指出NAC(NAM、ATAF和CUC)蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育和抵御逆境胁迫中起重要作用。沙冬青是我国西北荒漠地区唯一的常绿阔叶植物,在研究植物抗逆机理和挖掘抗逆基因中具有独特用途。实验室在前期研究中从沙冬青转录组中筛选到8个受干旱和低温诱导的NAC转录因子基因。本研究对其中3个基因,即AmNAC3、AmNAC4和AmNAC5进行了克隆,并对其编码蛋白的结构特征、亚细胞定位和转录激活活性等进行了分析,同时对其在响应和抵抗多种非生物胁迫中的作用进行了研究。主要结果如下:(1)利用PCR方法扩增到AmN4C3、AmNAC3、和AmN4C5的编码区cDNA和gDNA片段。其编码区cDNA长度分别为846、879和891bp,推测蛋白产物分别由281、292和296个氨基酸残基组成;对应的编码区gDNA长度分别为1213、1231和1729 bp,其中均含有3个外显子和2个内含子。(2)经过多序列比对和保守域分析,发现在AmNAC3、AmNAC4和AmNAC5蛋白序列的N端均含有一个典型的NAC结构域,其中又包含A~E 5个亚结构域,且在C、D亚结构域中均含有一个核定位信号。利用GFP融合蛋白和酵母自激活体系,检测到3种AmNAC蛋白均定位于细胞核内、均具有转录激活活性,并且其转录激活区域均位于蛋白的C端。(3)利用RT-qPCR技术分析了 3个基因的表达模式。在室内人工培养的沙冬青幼苗地上部和/或根中,3个基因的转录水平均受干旱、盐、低温和高温胁迫及外源ABA的诱导而上调,但总体上AmN C3受干旱.和盐胁迫及ABA诱导较为迅速而且明显,AmNAC4受四种胁迫诱导较快或幅度较大,而AmNAC5主要受干旱、盐和高温胁迫及ABA诱导。在野外自然生长植株的嫩叶中,AmNAC3和AmNAC5在11和12月份表达量为全年最高,而在其他月份表达量较低;AmNAC4在1、11和12月表达量远高于其他月份。在春季野外生长植株中,AmNAC3在侧根和嫩枝中高表达,在嫩叶、花蕾和未成熟果荚中低表达;AmNAC4在嫩叶中表达量明显高于其他器官;AmN4C5主要在侧根和嫩叶中表达。(4)将3个基因分别在拟南芥中进行组成型表达,根据转基因株系在不同非生物胁迫和外源ABA处理下的表型和生理指标变化,对其抗逆功能进行评价。AmNAC3可提高耐盐性,降低耐热性和叶片保水性;AmNAC4可提高抗旱性、耐盐性和抗冻性;AmNAC5可以提高抗旱性和耐盐性,降低对外源ABA的敏感性。叁个基因还可以提高转基因株系在胁迫处理下对氧化胁迫的抗性和细胞膜及叶绿素的稳定性。(5)3个基因可以诱导其转基因株系中多个胁迫相关基因的转录水平上调。AmNAC3可诱导RD29A、RD29B、POD和NHX1表达量上调;AmNAC4可诱导RD29A、RD29B、POD、ALDH7B4、P5CS1 COR15a表达量上调,而 AmNAC5的上调基因包括 RD29B、POD、CAT、ALDH7B4 和 RD29A。(6)在AmNAC4的启动子中含有响应低温、干旱、光和ABA等因素的顺式作用元件,此外还有MYB转录因子的结合位点。在转基因拟南芥中,该启动子主要在幼苗的地上部分和成株的花中起作用,此外其在幼苗中的启动活性主要受低温、高盐和热胁迫所诱导。上述研究结果为进一步研究和利用3个AmNA基因的抗逆功能和解析沙冬青的抗逆机理提供了重要依据。(本文来源于《内蒙古农业大学》期刊2019-06-01)

抗逆基因论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

水稻OsGATA家族第Ⅶ亚家族基因OsGATA23有两个成员,其中一个成员OsGATA23a是多应激反应转录因子,在盐碱度ABA处理和干旱条件下高度表达.利用生物信息学技术,从核酸和蛋白层面分析OsGATA23a亚基在非生物胁迫下显着表达,OsGATA23b亚基在该胁迫下不表达或低表达的影响因素.结果表明,OsGATA23基因的两个亚基蛋白结构的稳定性不同引起表达不同.首先,运用生物信息学技术对GATA23的蛋白性质、功能、结构进行分析;其次,对启动子顺式作用元件进行统计分析.比对水稻OsGATA23基因亚基及亚基差异氨基酸序列的理化性质发现OsGATA23a-1蛋白结构比较稳定.OsGATA23a平均亲水系数为0.327,该段氨基酸序列疏水.OsGATA23a-1氨基酸序列段存在信号肽位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化活性位点,而OsGATA23b-1不存在.在OsGATA23a-1中α螺旋显著减少,延伸链显着增加.OsGATA23b-1中α螺旋减少,无规则卷曲显着增加.对OsGATA23a和OsGATA23b蛋白叁级结构模拟发现其亚基结构组成大致相似,对OsGATA23a-1、OsGATA23b-1蛋白叁级结构模拟时,发现OsGATA23b-1在计算机算法上不存在稳定的叁级结构构象,而无法模拟.OsGATA23基因启动子序列正反链上存在较多与逆境、根等相关的顺式作用元件.在非生物应激状态下,上游相关顺式作用元件选择性识别下游基因OsGATA23成员中具有比较稳定的疏水蛋白结构OsGATA23a亚基,同时在OsGATA23a-1存在信号肽位点,说明OsGATA23a-1不仅有利于OsGATA23a亚基蛋白结构的优化,而且还能被特异性识别.OsGATA23b亚基在逆境状态下不表达或低表达,说明OsGATA23b-1不利于OsGATA23b亚基蛋白结构稳定,且不能被特异性识别.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

抗逆基因论文参考文献

[1].解美霞,杨君,王国宁,李志坤,张艳.基于表达谱分析陆地棉DUF642基因家族抗逆功能[J].棉花学报.2019

[2].敖竹兰,郭永辉,江琛,李龙盘,刘鹏.水稻抗逆性基因OsGATA23可变剪切的生物信息学分析[J].湖北大学学报(自然科学版).2019

[3].刘自广,刘娣,王文涛,郭镇华,汪亮.低温对大白猪抗逆基因表达的影响[J].黑龙江畜牧兽医.2019

[4].陈佳琦,董礼,樊悦,王妮.基因枪介导抗逆相关基因转化小麦的研究[J].种子科技.2019

[5].韩冉,李玉莲,汪晓璐,宫文萍,李豪圣.TaAAP3基因对小麦单株产量及抗逆性影响的初步研究[C].第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集.2019

[6].王景一,毛新国,王瑞同,李昂,赵光耀.通过酵母文库筛选小麦抗逆相关基因[C].第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集.2019

[7].薛巨坤,王博,王莲萍,杨春雨,国会艳.与植物抗逆相关的miR-398-3p基因家族进化分析及靶基因预测[J].湖北农业科学.2019

[8].张皓,崔杰,李俊良,李昕晏,王琮玉.甜菜抗逆基因P5CS的克隆及盐胁迫下的表达分析[J].中国糖料.2019

[9].贾笛迩,朱紫薇,孙功祥,李媛,舒忠泽.夏玉米对高温胁迫的生理响应及抗逆基因表达研究进展[J].农业灾害研究.2019

[10].任美艳.沙冬青叁个抗逆相关NAC转录因子基因的克隆与功能研究[D].内蒙古农业大学.2019

论文知识图

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