烟台近海周丛类纤毛虫物种多样性及系统发育研究

论文摘要

纤毛虫隶属于原生生物界,纤毛门,是形态最复杂和最高等的单细胞真核生物,在所处微食物网的物质循环和能量传递中起重要的枢纽性作用。作为一种良好的模式生物,纤毛虫被广泛应用于细胞生物学、分子生物学和分子系统学等科学领域当中,且在生物的起源与进化等方向上具有独特的研究地位。本研究以烟台近海周丛类纤毛虫为研究对象,对烟台近海的20种周丛类纤毛虫（涉及3纲8目16属）进行了传统的形态学鉴定,同时也对相关类群进行了分子系统学的研究。主要研究成果如下:1.发现并建立了一个新种—掌状聚缩虫Zoothamnium palmphlatum n.sp.,形态学描述如下:群体交替分支,侧枝发达,高度可达1.3 mm。虫体大小7186×3349μm,双层口围缘。单一伸缩泡位于虫体顶端。大核“C”形,横位。口围缘到反口纤毛环的银线数目为74102,反口纤毛环到帚胚的银线数目为3545;口区小膜3由两条平行的动基列组成。本研究将这一新种与其形态学相似种和序列相似度最高种的二级结构的各区段进行对比研究,发现:（1）序列相似度和二级结构相似度没有必然联系,即序列相似度越高并不意味着二级结构越相似,反之亦然;（2）18S rDNA二级结构可能为分析聚缩虫属系统进化关系提供依据,进一步说,某些呈现种内物种特异性的二级结构区段,在一定程度上有助于物种区分。2.结合系统发生树,分析聚缩虫三大类群、累枝虫两大类群、鞘居虫、盖虫等二级结构在种间和种内的差异关系,得到如下结论:（1）聚缩虫的三大类群（聚缩虫clade I、聚缩虫clade II和聚缩虫clade III）可通过H10区、H25区、H47区加以区分;（2）累枝虫两大类群（累枝虫clade I和累枝虫clade II）可通过E101区、H10区、H12区、H17区、H37区加以区分;（3）聚缩虫clade III和累枝虫clade II可通过E231-2区和H44区加以区分;（4）鞘居虫和聚缩虫三大类群、累枝虫clade II可通过E101区加以区分;（5）累枝虫clade I、盖虫科和上述其它类群可通过H10区加以区分。本研究结合系统发生树上的各物种的系统发生位置,对缘毛类纤毛虫中的重要类群的可区分二级结构区段做了汇总,研究发现二级结构区段也是进行缘毛类纤毛虫类群区分的良好标记;同时,首次用现代分类学方法完整研究并报道了一种聚缩虫属纤毛虫新种,增加了该属的物种多样性及分子数据。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 文献综述
•   1.1 纤毛虫简介及研究意义
•   1.2 纤毛虫系统发育学简史
•     1.2.1 纤毛虫系统发育学的产生
•     1.2.2 纤毛虫分子系统发育学的主要研究方法
•     1.2.3 18SrDNA二级结构在系统发育上的应用
•   1.3 本工作的主要内容及研究意义
• 2 材料与方法
•   2.1 样品采集
•   2.2 活体观察与染色制片
•   2.3 DNA提取及克隆测序
•     2.3.1 DNA提取
•     2.3.2 PCR扩增
•     2.3.3 目的片段纯化
•     2.3.4 目的片段连接、转化和测序
•   2.4 18SrDNA二级结构构建
•     2.4.1 四膜虫SSU r RNA二级结构模式图
•     2.4.2 各区段二级结构保守序列的筛选
•     2.4.3 RNA Folding Form构建二级结构
•     2.4.4 RNA viz二级结构区段调整
• 3 烟台近海半咸水纤毛虫
•   3.1 丁丁目Tintinnida Kofoid& Campbell,1929
•     3.1.1 真丁丁虫属Genus Eutintinnus Kofoid& Campbell,1939
•       3.1.1.1 开孔真丁丁虫Eutintinnus apertus（ Kofoid& Campbell,1929）
•     3.1.2 拟铃虫属Genus Tintinnopsis Stein,1967
•       3.1.2.1 筒状拟铃虫Tintinnopsis tubulosoides（Meunier,1910）
•       3.1.2.2 圆桶拟铃虫Tintinnopsis cylindrica（Daday,1887）
•   3.2 异毛目Heterotrichida Stein,1859
•     3.2.1 环须虫属Genus Peritromus Stein,1863
•       3.2.1.1 加州环须虫Peritromus californicus（Kirby,1934）
•     3.2.2 格鲁博虫属Genus Gruberia Kahl,1932
•       3.2.2.1 Gruberia lanceolata（Gruber,1884）
•     3.2.3 突口虫属Genus Condylostoma Bory,1824
•       3.2.3.1 巨大突口虫Condylostoma magnum（Spiegel,1926）
•     3.2.4 瓶囊虫属Genus Folliculina Lamarck,1816
•       3.2.4.1 简单瓶囊虫Folliculina simplex（Dons,1917）
•     3.2.5 类瓶囊虫属Genus Folliculinopsis Fauré-Fremiet,1935
•       3.2.5.1 延长类瓶囊虫Folliculinopsis producta（Wright,1859）
•       3.2.5.2 Folliculinopsis ampulla（Müller1854）
•   3.3 游仆目Euplotida Small& Lynn,1985
•     3.3.1 游仆虫属Genus Euplotes Müller,1786
•       3.3.1.1 扇形游仆虫Euplotes vannus（Müller,1786）
•   3.4 固着目Sessilida Kahl,1933
•     3.4.1 聚缩虫属Genus Zoothamnium Bory,1824
•       3.4.1.1 掌状聚缩虫Zoothamnium palmphlatum n.sp.（新种）
•       3.4.1.2 双缘聚缩虫Zoothamnium duplicatum（Kahl,1933）
•       3.4.1.3 羽状聚缩虫Zoothamnium plumula（Kahl,1933）
•   3.5 腹毛目Hypotrichida Stein,1859
•     3.5.1 额斜虫属Genus Epiclintes Stein,1863
•       3.5.1.1 Epiclintes auricularis rarisetus（Hu et al.2009）
•   3.6 膜口目Hymenostomatida Delage& Herouard,1896
•     3.6.1 草履虫属Genus Paramecium Müller,1773
•       3.6.1.1 双小核草履虫Paramecium aurelia（Ehrenberg,1838）
•     3.6.2 前口虫属Genus Frontonia Ehrenberg,1838
•       3.6.2.1 迪狄前口虫Frontonia didieri（Longetal.,2008）
•   3.7 吸管目Suctorida Claparède& Lachmann,1858
•     3.7.1 壳吸管虫属Genus Acineta Ehrenberg,1834
•       3.7.1.1 结节壳吸管虫Acineta tuberose（Ehrenberg,1833）
•   3.8 侧口目Pleurostomatida Schewiakoff,1896
•     3.8.1 亚册虫属Genus Acineria Dujardin,1841
•       3.8.1.1 内弯亚册虫（疑似种）Acineria cf.incurvata（Dujardin,1841）
•     3.8.2 漫游虫属Genus Litonotus Wresniowski,1870
•       3.8.2.1 沈氏漫游虫Litonotus shenae（Linetal.,2005）
•     3.8.3 斜叶虫属Genus Loxophyllum Dujardin,1841
•       3.8.3.1 宋氏斜叶虫Loxophyllum songi（Linetal,2005）
•   3.9 结论
• 4 缘毛类聚缩虫属、累枝虫属及鞘居虫、盖虫二级结构区段分析
•   4.1 引言
•   4.2 结果
•     4.2.1 H10 区各类群二级结构分析
• 1 区各类群二级结构分析'>    4.2.2 E10₁区各类群二级结构分析
•     4.2.3 H12 区各类群二级结构分析
•     4.2.4 H17 区各类群二级结构分析
• 1-2 区各类群二级结构分析'>    4.2.5 E23₁-2 区各类群二级结构分析
•     4.2.6 H25 区各类群二级结构分析
•     4.2.7 H37 区各类群二级结构分析
•     4.2.8 H44 区各类群二级结构分析
•     4.2.9 H47 区各类群二级结构分析
•   4.3 讨论
•     4.3.1 聚缩虫三大类群可区分段落汇总
•     4.3.2 累枝虫两大类群可区分段落汇总
•     4.3.3 聚缩虫clade III累枝虫clade II可区分段落汇总
•     4.3.4 鞘居虫与聚缩虫三大类群、累枝虫clade II可区分段落汇总
•     4.3.5 累枝虫clade I和盖虫科与上述其它种类可区分段落汇总
•   4.4 结论
• 5 结论与展望
• 参考文献
• 致谢
• 附录一
• 附录二
• 附录三

文章来源

类型: 硕士论文

作者: 王雪艳

导师: 季道德

关键词: 纤毛虫,周丛类,二级结构,系统发育

来源: 烟台大学

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 烟台大学

分类号: Q958.8

总页数: 97

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