人呼吸道合胞病毒兰州株全基因组序列测定及分析

论文摘要

目的为了解人呼吸道合胞病毒（human respiratory syncytium virus,HRSV）兰州株（HRSV LZ01/09）的遗传特征及分子进化规律,进一步丰富RSV基因组数据库,对HRSV LZ01/09的全基因组序列进行测定及分析。方法通过RT-PCR法对HRSV LZ01/09全基因组片段进行扩增及序列测定,利用分子生物学软件对测序结果进行拼接,并与GenBank登录的RSV实验参比株和各基因型代表株进行分子进化分析。结果 HRSV LZ01/09全基因组全长为15 204 bp,基因组的结构为NS1-NS2-N-P-M-SH-G-F-M2-1-M2-2-L,与报道的RSV实验参比株相同;全基因组序列比对分析表明,HRSV LZ01/09兰州株基因组序列与RSV RSS2株的同源性最高,为96. 7%,与其他RSV-A亚型毒株同源性次之,为94. 9%～95. 2%,与RSV-B亚型9320株同源性最低,为80. 9%;依据RSV-G基因的第2个可变区进行系统进化树分析,HRSV LZ01/09兰州株基因组与NA1病毒分离株属于同一个分支。结论 HRSV LZ01/09兰州株病毒基因组具有RSV的遗传特征,属于RSV-A亚型,基因型属于NA1型。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 毒株、载体及细胞
•   1.2 主要试剂及仪器
•   1.3 引物设计及合成
•   1.4 目的基因的扩增
•   1.5 克隆质粒的构建
•   1.6 序列分析及病毒全基因组和G基因的高变区系统进化树分析
•   1.7 核苷酸和氨基酸变异位点的分布
• 2 结果
•   2.1 HRSV LZ01/09株基因组的分段扩增、测序及拼接
•   2.2 HRSV LZ01/09株基因组的结构特征
•   2.3 HRSV LZ01/09株基因组全序列系统进化树分析
•   2.4 HRSV LZ01/09株基因组全序列同源性分析
•   2.5 核苷酸和氨基酸变异位点的分布
•   2.6 HRSV LZ01/09株基因型分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 朱传凤,瓦晓霞,傅生芳,马超

关键词: 呼吸道合胞病毒,全基因组序列测定,同源性,系统进化树分析

来源: 中国生物制品学杂志 2019年07期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学,基础医学

单位: 兰州生物制品研究所有限责任公司

分类号: R373.14;R346

DOI: 10.13200/j.cnki.cjb.002672

页码: 735-741

总页数: 7

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