中国土壤微生物组数据平台的构建与实现

论文摘要

近年来,高通量测序等新技术的快速发展,为大规模、快速、准确、全面认识土壤微生物多样性提供了技术保障。国际上已经建成了一些具有影响力的土壤微生物组数据管理及分析平台,但大多数已有平台聚焦于提供数据存储、管理、访问、注释等基础性服务,难以满足土壤微生物研究需求。借助空间数据库技术、网络地理信息系统(WebGIS)技术,设计并构建了包含土壤及微生物数据集成、数据可视化、知识发现和区域空间制图等功能的中国土壤微生物组数据平台,该平台将进一步推动我国土壤微生物组数据的标准化整合,并为整合数据的充分挖掘利用提供支撑。

论文目录

• 1 平台架构设计
•   1.1 基础设施层
•   1.2 数据资源层
•   1.3 应用支撑层
•   1.4 管理业务层
•   1.5 用户服务层
• 2 数据库建设
•   2.1 数据资源整合
•   2.2 数据库实现
• 3 平台功能建设
•   3.1 数据管理模块
•   3.2 数据可视化模块
•   3.3 数据分析模块
•   3.4 用户管理模块
• 4 平台应用示例
•   4.1 数据集成
•   4.2 土壤微生物与环境相关性
•   4.3 土壤微生物空间分布图
• 5 问题与讨论
• 6 结语

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 潘恺,郭志英,刘杰,王昌昆,宋歌,贾仲君,潘贤章

关键词: 土壤微生物组数据,数据可视化,微生物多样性,空间分布制图

来源: 土壤学报 2019年05期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学,信息科技

专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,计算机软件及计算机应用

单位: 土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所),中国科学院大学

基金: 中国科学院战略性先导科技专项（B类）（XDB15040300）,中国科学院信息化专项（XXH13506-102）资助~~

分类号: S154.3;TP311.13;TP311.52

页码: 1023-1033

总页数: 11

文件大小: 3753K

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