论文摘要
目的该研究旨在分析GEO数据库中GSE22255微阵列数据集,筛选缺血性卒中（IS）发生后的关键差异表达基因,以寻求防治缺血性卒中的药物靶点。方法 GSE2225微阵列数据集来源于GEO数据库,包含来自20名IS患者和20名正常对照者的外周血单核细胞数据,正常对照者的性别和年龄与患者匹配,IS患者在收集血液时只发生过一次卒中。首先,利用R语言的中位值方法对表达数据进行标准化,然后利用Limma算法分析数据集的差异基因。得到差异基因后于GSEA（Gene Set Enrichment Analysis）进行基因富集分析。同时利用DAVIDv6.8（The Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery）进行GO（Gene Ontology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）分析。最后利用注释数据库、cytoscape软件构建可视化调控网络,并利用SH-SY5Y氧糖剥夺复氧（OGD/R）模型测定细胞活力,线粒体膜电位和超氧阴离子含量进行实验验证。结果与对照组相比,IS样本中共识别出183个差异基因,包括52个上调基因和131个下调基因。这些差异基因提示的缺血性卒中发生后主要引起线粒体呼吸功能下调。实验表明,在OGD/R损伤后,SH-SY5Y细胞活力,线粒体膜电位下降,超氧阴离子含量增多。结论改善线粒体可能是防治缺血性卒中的有效治疗手段。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 王蓉蓉,王丹姝,燕柳艳,姜瑜,王守宝,杜冠华
关键词: 缺血性卒中,生物信息学分析,线粒体,靶点
来源: 中国药理学与毒理学杂志 2019年10期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技
专业: 神经病学
单位: 中国医学科学院北京协和医学院药物研究所北京市药物靶点研究与新药筛选重点实验室
基金: 国家自然科学基金(81673422),中国医学科学院医学与健康科技创新工程创新团队(2016-I2M-3-007)
分类号: R743.3
页码: 871
总页数: 1
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