两株鸡源H9N2亚型禽流感病毒的分离鉴定和遗传进化分析

论文摘要

为了解湖北鸡源禽流感病毒的遗传进化和氨基酸变异情况,将分离到的2株禽流感病毒进行全基因组测序及遗传进化分析。利用RT-PCR扩增流感病毒基因组片段,PCR扩增流感病毒片段、克隆至pMD18-T载体,并对序列特征进行生物信息学分析。结果表明:分离到的2株病毒高度同源,其HA和NA基因属于Y280谱系,PB1、PA、NP和NS基因属于SHF98-like谱系,PB2和M基因属于G1-like谱系;HA裂解位点均为-RSSR↓GLF-,具有低致病性流感病毒的分子特征;在HA蛋白上比当前流行株Y280多了一个潜在糖基化位点313（NCS）;在234位点（对应H3编号中的226）产生了从Q到L的突变;在M2蛋白的31位点均产生了从S到N的突变。该2株H9N2亚型流感病毒为Y280谱系的病毒,这提示湖北地区可能也流行Y280-like分支禽流感病毒,虽然属于低致病性禽流感病毒（Low pathogenic AIV,LPAIV）,但具有感染哺乳动物的潜在风险。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 病料及SPF鸡胚
•   1.2 主要工具酶及试剂
•   1.3 病毒增殖、RNA提取及病毒基因的克隆和测序
•   1.4 序列分析
• 2 结果与分析
•   2.1 病毒分离鉴定
•   2.2 HA基因测序结果及进化分析
•   2.3 NA基因测序结果及进化分析
•   2.4 PB2、PB1、PA、NP、M和NS基因测序结果及进化分析
• 3 讨论与结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王彪雄,苏惠娟,石丽娟,肖榕,周红波,索朗斯珠

关键词: 禽流感,遗传进化,氨基酸位点

来源: 中国农业大学学报 2019年06期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 西藏农牧学院动物科学学院,华中农业大学动物医学院

基金: 国家自然科学基金项目(31560698),西藏农牧学院学科建设经费

分类号: S852.65

页码: 81-91

总页数: 11

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