SSR标记在毛木耳种质资源遗传多样性研究中的应用

论文摘要

本研究利用基于毛木耳全基因组开发的SSR标记对27份毛木耳菌株（野生14株、栽培13株）的遗传多样性进行分析。首先随机选取3个菌株（2个野生菌株、1个栽培菌株）的DNA为模板,从144对SSR引物中筛选出扩增条带清晰、稳定性强、多态性丰富的引物24对。24对SSR引物共检测到116个多态性SSR片段,每对引物的多态性片段有3–7个,引物平均检测效率为4.83个,Shannon’s遗传多样性指数范围是0.866–1.885,多态性位点比率100%。供试菌株遗传相似系数范围是0.618–0.971,说明毛木耳种质资源具有丰富的遗传多样性。野生菌株与栽培菌株间平均遗传相似系数分别为0.746、0.779,说明毛木耳野生菌株遗传多样性更为丰富。经聚类分析,在遗传相似系数为0.680时,可将供试菌株分为无色（白色）类群Ⅰ和有色（浅黄色到红褐色）类群Ⅱ。遗传相似系数为0.704时,可将供试菌株中栽培菌株和野生菌株明显区分（14株野生菌株均在类群Ⅱ-2中,13株栽培菌株分别在类群Ⅰ和Ⅱ-1中）。本研究表明基于全基因组的SSR标记能从分子水平上揭示各菌株间的遗传差异,丰富毛木耳遗传多样性的研究手段,并为进一步进行毛木耳的品种选育、遗传学研究等提供有力手段。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 供试菌株
•   1.2 方法
•     1.2.1 菌丝体制备：
•     1.2.2 DNA提取：
•     1.2.3 SSR引物开发与合成：
•     1.2.4 SSR引物筛选及SSR-PCR反应：
•     1.2.5 数据处理与分析：
• 2 结果与分析
•   2.1 DNA提取
•   2.2 SSR-PCR引物筛选
•   2.3 SSR-PCR多态性分析
•   2.4 聚类分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 姚方杰,黄程远,孔祥会,王鹏,鲁丽鑫,方明,张友民

关键词: 聚类分析,遗传差异,子实体颜色,野生菌株,栽培菌株

来源: 菌物学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 园艺

单位: 吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心,吉林农业大学园艺学院

基金: 现代农业产业技术体系专项资金(CARS20)~~

分类号: S646.6

DOI: 10.13346/j.mycosystema.190139

页码: 2122-2132

总页数: 11

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