导读:本文包含了水平基因转移论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,水平,线粒体,生物,作用,座子,锁阳。
水平基因转移论文文献综述
赵子涵[1]（2018）在《论水平基因转移在生物进化中的作用》一文中研究指出高中生在学习高中生物科目的时候,会感到一定程度上的困难,因为就高中生物科目的难度分析看来,高中阶段的生物科目与初中阶段的生物科目相比,在内容上显得更加复杂了。在高中生物科目的学习过程中,水平基因转移是高中生物科目非常重要的系统内容,它是高中生物科目的基础知识,所以切实地掌握好高中生物水平基因转移知识,对于高中生学好生物科目来讲,将会显得非常重要。因此,本文将会立足于这点,针对水平基因转移在生物进化中的作用进行分析,以希望帮助高中生理解水平基因转移的基本知识。(本文来源于《科技资讯》期刊2018年36期）
陈志文,王玉美,聂虎帅,王梅燕,华金平[2]（2018）在《植物水平基因转移研究进展》一文中研究指出水平基因转移,一般分为细胞内部或者跨越物种边界的遗传物质交流。跨界直接介导方式,包括共生、内共生、寄生、嫁接等。细胞内的基因转移,主要包括细胞核与细胞器基因组间的相互渗透;跨越物种边界的遗传物质交流,主要涉及寄生与寄主植物的基因横向转移,寄主与寄生植物mRNA也会发生大规模的水平转移。基于基因组学研究进展,本研究综述了植物水平基因转移的迁移序列类型、迁移方向及迁移机制:首先,植物细胞的线粒体基因组能够整合细胞核转座元件以及叶绿体起源的tRNA基因,线粒体和叶绿体基因组的功能基因及间区序列能够迁移到核基因组;其次,植物种间,通过寄生、嫁接等方式转移大量的DNA(如线粒体基因、叶绿体基因和转座元件)和RNA(如mRNA)序列;迁移机制涉及到DNA介导和RNA介导方式,迁移方向包括单向和双向转移。迁移序列的基因功能活性研究是重要的后续研究方向。(本文来源于《中国农业大学学报》期刊2018年01期）
王宪宗[3]（2017）在《水平基因转移在水生动物中分布的初步探讨》一文中研究指出具有特定生物学功能的新基因对所有生物都是一种重要的进化优势。新基因除了可以在基因组中已有遗传物质的基础上通过缓慢演化而产生,也可以直接在不同物种之间发生横向流动,即水平基因转移。水平基因转移在原核生物快速进化中发挥的重要作用已经得到广泛认可。但对于多细胞真核生物而言,它们巨大且复杂的基因组使得分析流程变得极为繁琐且低效,导致相关的研究非常滞后。水生动物的生活环境及一些生物学特性可能有利于它们之间发生水平基因转移,因此系统的对水生动物中的水平基因转移情况进行研究有利于阐明真核生物中水平基因转移的具体机制及普遍规律,也会加深人们对遗传资源本质的理解。由于真核生物中普遍存在大量的转座子,而这些转座子具有一定的自主性,它们的水平转移机制可能与单拷贝基因有所不同,所以对这两类遗传物质的水平转移分别进行了研究。一转座子的水平转移以凡纳滨对虾为核心物种,以一个高通量测序的拼接结果为核心数据集,通过基于多重本地/在线blast的相似性搜索、进化分析及表达分析研究了它的转录组中的转座子转录本,这些转录本参与水平转移的情况及它们可能的生物学功能,结果如下:1.从56608条凡纳滨对虾转录本中鉴定出了395条高度可信的转座子转录本,它们中的绝大多数都是逆转录转座子的转录本。157条转座子的转录本表现出与远缘物种更高的相似度,这些远缘物种主要是辐鳍鱼类、贝类和寄生生物;这157条转录本中有83条可以确定来自于已知的凡纳滨对虾转座子家族,对应的转座子家族一共是16个。2.上述的16个对虾转座子家族有10个已经被注释了编码区,因此用它们的蛋白序列与对应的高相似同源序列进行了进化分析。结果表明它们在进化树上的近邻多数情况下都是水生动物序列,而且其他水生动物的序列之间也容易聚在一起,尽管它们之间的亲缘关系非常远。3.通过与凡纳滨对虾早期发育阶段和WSSV病毒重组VP28蛋白刺激下的转录组测序原始数据进行短片断比对,发现涉及水平转移的转录本有可能在抗病毒免疫中发挥了重要作用,确切的说,它们可能是抗病毒免疫的抑制因子。二单拷贝基因的水平转移为了处理更大规模的数据,首先开发了一种基于TF-IDF(词频-逆文本频率指数)的水平转移基因判断方法。以27个分类跨度很大的物种的Uni Gene序列为核心数据集,用新开发的方法对这些物种中的水平转移序列进行了初步筛选,并对这些候选序列用传统的基于相似性搜索及进化分析的方法进行了严格验证,结果如下:1.首先从21个物种的4048个同源基因group中,使用合适的阈值,得到了20257个高度保守的基因片断,长度范围是3-40 nt,其中数量最多的8 nt和11 nt的片断,这些保守片断被类比为文本中的“词”。这些词的分布曲线部分符合齐夫定律,而那些不符合的部分,由于TF或IDF过低,其综合权重都很低。为了查找这些长度不同的词在序列中的出现次数,开发了一种动态规划查找算法,并用Python及C语言加以实现。2.构造了一个基于TF-IDF的度量Dis,用来表征一条序列的特征值与该物种中所有序列平均特征值的距离。通过对序列参考不同物种得出的Dis进行比较,可以直接判断出哪些序列与自身物种的序列平均特征值差距大,而与其他物种的序列平均特征值差距小。采用这种方法,从13个物种判断出了585条潜在的水平转移序列,这些序列集中出现在淡水涡虫、日本血吸虫、猫头鹰帽贝和肩突硬蜱中。潜在的基因供体物种也比较集中,主要是大西洋鲑、斑马鱼和安乐蜥。3.通过相似性搜索等进一步的严格验证,从上述的585条序列中得到了63条更加可信的水平转移序列,其中39条来自淡水涡虫。这63条序列在众多物种中存在高度相似的同源序列,尤其是后口动物,但进化分析却表明,它们的近邻通常都是远缘的水生动物,与用Dis预测的结果高度一致。这63条序列代表了一系列的基因,包括编码核糖体蛋白,细胞骨架蛋白及能量代谢相关蛋白的众多基因,它们多数都是组成性表达的管家基因。本研究的结果表明:无论是转座子还是单拷贝基因,在水生动物之间,特别是生态位相近的水生动物之间都易于发生水平转移。由于水生动物普遍通过体外受精繁育后代,这可能就使得环境中的DNA容易在生殖细胞或胚胎阶段进入它们的细胞并整合进基因组,进而造成相比陆生生物更高的水平基因转移频率。检测出的水平转移单拷贝基因多数都在真核生物中普遍存在,这些基因的转移只是对已有基因进行了替换,却不会引入新功能;而转座子除非进化成为新基因,否则它们的功能通常都是只利己的。因此总体而言,真核生物之间的水平转移在功能上可能是以中性为主。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2017-05-01）
郭予欣[4]（2017）在《生物进化论中水平基因转移作用浅析》一文中研究指出水平基因转移现象的发现使生物进化的途径有了多方面的变化,从目前的研究结果来看,水平基因转移主要发生在原核生物和单细胞真核生物中。本文对原核生物和单细胞真核生物的水平基因转移情况进行分析研究。(本文来源于《新校园(阅读)》期刊2017年03期）
石磊,张明慧,陈虞超,巩檑,甘晓燕[5]（2016）在《植物中的水平基因转移》一文中研究指出水平基因转移是不通过生殖而进行的遗传物质交流,在原核生物和单细胞真核生物的进化中起着重要作用。然而,水平基因转移在多细胞真核生物之间的发生频率以及对多细胞真核生物进化的影响尚不明确。近期的一些研究显示,水平基因转移在高等植物之间以及高等植物和其它生物之间普遍存在。该文将对高等植物中已发现的一些水平基因转移现象进行综述,并尝试解析植物之间水平基因转移可能的机制及其重要意义。(本文来源于《植物学报》期刊2016年04期）
付强[6]（2016）在《水平基因转移在生物进化中的作用》一文中研究指出水平基因转移理论的产生为生物进化研究开辟了另一条全新的路径,为研究人员从更多新角度、新思维去探讨生物进化的方式提供了重要的理论依据。在现有研究成果当中,普遍认为水平基因转移多发生于原核生物与单细胞真核生物当中,而且是两种生物进化的主要源动力。本文从单细胞真核生物、多细胞真核生物中的植物、真菌与动物叁种类群几方面,对水平基因转移在其进化过程中所产生的作用与影响进行深入的探究与分析。(本文来源于《中华少年》期刊2016年18期）
[7]（2016）在《韩国创建“水平基因转移数据库”奠定迅速分析食物致病菌基因移动信息基础》一文中研究指出2016年1月20日,韩国KFDA与食品药品安全评价院共同创建了"水平基因转移数据库",可迅速地分析食物中致病菌的相关基因移动信息。该数据库通过对2472个微生物遗传因子进行分析,可分析出新、变异致病菌及超级细菌出现的原因,制定相应的应对方案。并且,该库将有助于进行微生物分类、进化等多种领域的研究。水平基因移动作为遗传学的概念,是指从个体到个体基因信息移动的现象,可超越种间差异移动,互不相同的(本文来源于《饮料工业》期刊2016年01期）
石磊,陈虞超,李苗,宋玉霞[8]（2015）在《用AFLP-PCR方法分析肉苁蓉与梭梭间水平基因转移》一文中研究指出寄生植物和寄主是研究水平基因转移的理想体系。研究以肉苁蓉及其寄主梭梭为材料,探究了应用AFLP-PCR方法检测植物间水平基因转移现象的可行性,最终筛选获得100余条大小相似的序列片段。从理论和技术层面确定了AFLP-PCR方法可用于植物间水平基因转移现象的检测,为开展相关研究奠定了基础。(本文来源于《宁夏农林科技》期刊2015年12期）
刘英,刘广达,苏小娟,陈贵林[9]（2015）在《高等植物水平基因转移研究进展》一文中研究指出水平基因转移(horizontal gene transfer,HGT)是一种跨越物种界限的遗传物质传递方式,在细菌、真菌、病毒、原生生物和真核生物基因组中都有发生,被认为是生物进化的主要动力之一。新一代测序技术的发展使我们可以获得足够多的植物基因组信息进行高等植物HGT的研究。然而,多细胞真核生物(特别是植物)中HGT的发生范围、发生途径和进化意义尚存争议。本文综述了高等植物基因组中的HGT现象,介绍了叁类HGT转移机制:一是错位授粉导致的HGT;二是以载体为媒介进行交换的HGT,其中可能的载体包括真菌、细菌、病毒、转座子以及昆虫;叁是具有亲密接触的植物间频繁发生的HGT,如寄生、共生、嫁接等。也简要介绍了目前常用的一些HGT评判方法。最后阐述了HGT在植物寄生、登陆和光合作用等进化方面的作用,并展望了高等植物中HGT的倾向性,这为搜寻这一现象提供了方向。(本文来源于《植物生理学报》期刊2015年07期）
苏小娟[10]（2015）在《寄生植物锁阳线粒体基因序列分析及水平基因转移的研究》一文中研究指出高等植物水平基因转移(horizontal gene transfer, HGT)现象,是近年来才被发现并引起关注的,现认为它是真核生物基因组进化中的一个重要的力量。一般认为高等植物之间的寄生关系是植物发生HGT的重要途径,而线粒体基因由于其结构特异性较核基因和叶绿体基因更易发生HGT。高等植物之间HGT的例证相对较少,不同植物间HGT所呈现出的差异性较大。本研究选用药用寄生植物锁阳(Cynomorium songaricum Pupr.)为研究对象,对线粒体coxl、cox2、naad1、cob、nad5、nad7、rps3、nad6、nad9、rpl5、 ccmC和cox3基因序列进行克隆分析,揭示水平基因转移的方式。研究结果如下：1.利用最大似然法对cox1、cox2基因内含子和外显子进行聚类分析,结果显示cox1基因内含子的聚类结果与系统发育不相符,说明该内含子可能存在水平基因转移的现象。2.对比了锁阳6个不同居群间线粒体基因coxl、cox2、nad1外显子与内含子序列平均距离,发现cox2、nad1基因外显子与内含子遗传距离较大,而coxl基因内含子与外显子遗传距离小,6个不同居群间coxl基因内含子同源性高达100%,说明该基因内含子可能具有功能,生物信息学分析结果表明该内含子很有可能编码核酸内切酶,并促进其内含子的转移。3. RT-PCR实验验证得出coxl基因内含子可以独立转录mRNA。4.将锁阳及其寄主白刺9对线粒体基因cob、nad5、nad7、rps3、nad6、 nad9、rpl5、ccmC和cox3进行克隆测序,nad6和nad9基因聚类结果表明锁阳与白刺处于同一分支,说明锁阳与白刺nad6基因和nad9基因可能都存在转移现象；且锁阳与白刺的nad6和nad9基因序列和氨基酸序列相似性非常高,说明锁阳与白刺(Nitraria tangutorum Bobr.)的nad6和nad9基因可能编码的功能相似。(本文来源于《内蒙古大学》期刊2015-05-20）
水平基因转移论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
水平基因转移,一般分为细胞内部或者跨越物种边界的遗传物质交流。跨界直接介导方式,包括共生、内共生、寄生、嫁接等。细胞内的基因转移,主要包括细胞核与细胞器基因组间的相互渗透;跨越物种边界的遗传物质交流,主要涉及寄生与寄主植物的基因横向转移,寄主与寄生植物mRNA也会发生大规模的水平转移。基于基因组学研究进展,本研究综述了植物水平基因转移的迁移序列类型、迁移方向及迁移机制:首先,植物细胞的线粒体基因组能够整合细胞核转座元件以及叶绿体起源的tRNA基因,线粒体和叶绿体基因组的功能基因及间区序列能够迁移到核基因组;其次,植物种间,通过寄生、嫁接等方式转移大量的DNA(如线粒体基因、叶绿体基因和转座元件)和RNA(如mRNA)序列;迁移机制涉及到DNA介导和RNA介导方式,迁移方向包括单向和双向转移。迁移序列的基因功能活性研究是重要的后续研究方向。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
水平基因转移论文参考文献
[1].赵子涵.论水平基因转移在生物进化中的作用[J].科技资讯.2018
[2].陈志文,王玉美,聂虎帅,王梅燕,华金平.植物水平基因转移研究进展[J].中国农业大学学报.2018
[3].王宪宗.水平基因转移在水生动物中分布的初步探讨[D].西北农林科技大学.2017
[4].郭予欣.生物进化论中水平基因转移作用浅析[J].新校园(阅读).2017
[5].石磊,张明慧,陈虞超,巩檑,甘晓燕.植物中的水平基因转移[J].植物学报.2016
[6].付强.水平基因转移在生物进化中的作用[J].中华少年.2016
[7]..韩国创建“水平基因转移数据库”奠定迅速分析食物致病菌基因移动信息基础[J].饮料工业.2016
[8].石磊,陈虞超,李苗,宋玉霞.用AFLP-PCR方法分析肉苁蓉与梭梭间水平基因转移[J].宁夏农林科技.2015
[9].刘英,刘广达,苏小娟,陈贵林.高等植物水平基因转移研究进展[J].植物生理学报.2015
[10].苏小娟.寄生植物锁阳线粒体基因序列分析及水平基因转移的研究[D].内蒙古大学.2015
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