宿主谱论文-陈绵绵,张蕾,虞莉,徐军田,姚火春

宿主谱论文-陈绵绵,张蕾,虞莉,徐军田,姚火春

导读:本文包含了宿主谱论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:噬菌体,T4-like

宿主谱论文文献综述

陈绵绵,张蕾,虞莉,徐军田,姚火春[1](2017)在《T4-like噬菌体gp37的改变可以拓宽宿主谱》一文中研究指出噬菌体作为治疗制剂主要受限于其宿主谱窄及难以快速筛选出针对特定病原菌的噬菌体。本研究的目的首先是:通过将宽谱T4-like噬菌体QL0l的宿主谱决定基因替换给窄谱T4-like噬菌体WG01,使窄谱噬菌体WG01获得宽谱噬菌体QL01的宿主谱范围。实验结果显示,这个过程直接引发了WG01宿主谱的扩宽。WG01的后代不但获得了QL01和WG01的宿主谱,还可以感染另外8株细菌。WG01p1D具有最宽的宿主谱,提示其对应的片段q1D可以用(本文来源于《第五届全国人畜共患病学术研讨会论文摘要集》期刊2017-04-21)

徐军田[2](2016)在《宽宿主谱大肠杆菌T4噬菌体的分离、基因组学分析及临床应用研究》一文中研究指出禽致病性大肠杆菌(APEC)是引起家禽、鸟类等大肠杆菌病的主要的病原体,世界上每年因其导致的经济损失不可估量。近些年来,抗生素的耐药性问题日益严重,其药物残留问题也日益突出,使噬菌体及其制剂作为备选的抗菌方法被人们重新关注。然而,噬菌体相对特异的裂解谱以及有限的基因组信息等大大限制了噬菌体的临床应用。在本次试验中,我们一共分离到了 23株禽源性的大肠杆菌噬菌体,并通过宿主谱测定,筛选出一株较为广谱的噬菌体QL01(41/78),通过对其进行生物学性质试验、基因组测序、比较基因组学分析以及临床上治疗禽大肠杆菌感染的应用研究,为噬菌体广谱机制的探索以及临床应用提供了依据。1禽致病性大肠杆菌噬菌体的分离及生物学性质研究我们通过在南京某些农贸市场采集鸭粪样品,进行噬菌体的分离鉴定。共分离到23株禽致病性大肠杆菌噬菌体,并通过宿主谱测定,筛选出一株较为广谱的噬菌体QL01,可以裂解78株禽致病性大肠杆菌中的41株(52.6%)和1株新生儿脑膜炎大肠杆菌RS218。通过在透射电镜下对其进行形态观察,发现QL01的头部为二十面体结构(大小约为112×78 nm),具有收缩性的尾部(大约为102×20 nm)和6根尾丝。形态显示QL01属于有尾噬菌体目(Caudovirales)的肌尾噬菌体科(Myoviridae family),是一株典型的T4-like噬菌体。用固体培养法进行增殖,得到QL01的最高效价为5.08×108PFU/mL,温度敏感性试验表明QL01对高温较为敏感,其最佳感染复数为1。2噬菌体基因组测序及比较基因组学分析通过Illumina MiSeq对QL01进行全基因组测序,结果显示,噬菌体QL01基因组由一条全长为170,527 bp的双链DNA构成,GC含量为39.6%,有275个可能的ORF,其基因组与噬菌体Bp7,JS98等同源性较高。其中,分别编码IP9和IP8的ORF142和ORF143,在很多T4-like噬菌体中并不常见,仅存在少数噬菌体中。其IP基因数量和种类与低温噬菌体vB_EcoM_VR5相同,表明可能两者间发生了基因水平转移现象。IP基因分布图表明,两株噬菌体IP8和IP9附近基因排布类似,而IP7和IP3附近发生了重排。3 QL01治疗禽大肠杆菌感染的初探为研究噬菌体QL01在临床上对禽大肠杆菌感染的治疗效果,用禽致病性大肠杆菌菌株XM建立感染模型,首先进行半数致死量的测定。通过计算得到其半数致死量为2.12×104CFU。通过反复试验,将感染剂量定为3.6×104CFU左右。人工感染一周龄的雏鸭,并通过不同给药方式进行噬菌体给药,结果表明采用肌肉注射给药组的治疗效果较好。将90只雏鸭随机分组,感染大肠杆菌后进行肌肉注射给药,观察噬菌体的治疗效果。结果显示,噬菌体给药组平均存活率为90%,未给药组平均存活率为63.33%,给药组死亡率明显低于未给药组(P<0.05),而且给药组与阴性对照组之间并无显着差异(P>0.05)。由此可见,噬菌体QL01可以在一定程度上减轻细菌的感染,降低感染雏鸭的死亡率,为临床上应用噬菌体治疗禽致病性大肠杆菌感染提供了依据。(本文来源于《南京农业大学》期刊2016-05-01)

姜珊,袁婷,李德志,王依帆,陆承平[3](2015)在《1株可裂解肠道内和肠道外大肠杆菌的宽宿主谱噬菌体的分离与特性分析》一文中研究指出本试验从猪粪中分离得1株大肠杆菌的烈性噬菌体ФNJ14。用实验室保存的大肠杆菌对其裂解谱进行检测,发现ФNJ14能裂解27株大肠杆菌,是一株对肠道内和肠道外大肠杆菌均有效的宽宿主谱的噬菌体。电镜观察结果表明,ФNJ14头部呈狭长的六面体,有一个可伸缩的尾部,属于肌尾噬菌体科成员。ФNJ14的生物学特性鉴定结果显示,其效价为1.28×1010PFU/m L,最佳感染复数(MOI)为100;对60℃以下的温度具有较好的耐受力,在70℃培养20min后活力显着下降;ФNJ14对碱的耐受力较强,在p H4~11之间都能保持较高的活力;一步生长曲线检测结果显示,ФNJ14潜伏期为20 min,复制周期为140 min。提示噬菌体ФNJ14对致病性大肠杆菌具有一定的防控潜力。(本文来源于《畜牧与兽医》期刊2015年06期)

周艳,包红朵,张辉,张莉莉,王冉[4](2014)在《一株宽宿主谱裂解性大肠杆菌噬菌体的进化分析》一文中研究指出裂解性噬菌体能够特异性裂解细菌,本研究分析了一株从自然界中分离的宽宿主谱裂解性大肠杆菌噬菌体的种属和进化关系。前期用Adams双层平板琼脂法从猪场污水中分离纯化出一株裂解性噬菌体v B_Eco M_JS09,裂解谱分析能够裂解禽致病性大肠杆菌和产肠毒素大肠杆菌。扩增分析gene18、gene 23序列,并根据gp18和gp23氨基酸序列构建系统进化树,分析JS09的遗传进化关系。结果表明噬菌体v B_Eco M_JS09基因组为ds DNA,属于有尾噬菌体目、肌尾噬菌体科、T4-like噬菌体、T-evens亚群。其gp18氨基酸序列与大肠杆菌噬菌体RB69同源性最高,为100%;gp23氨基酸序列与大肠杆菌T4噬菌体同源性最高为96%。该结果为禽致病性大肠杆菌和产肠毒素大肠杆菌的防控提供了生物学基础。(本文来源于《中国动物传染病学报》期刊2014年06期)

周涛,贾怀杰,何小兵,房永祥,景志忠[5](2012)在《人兽共患痘病毒病流行现状及其宿主谱研究进展》一文中研究指出以天花病毒(Variola virus,VARV)为代表的痘病毒(Poxvirus)是人类最早认识并深受其害的病毒家族,同时也是严重影响公共卫生安全的重要病原。根据痘病毒的自然宿主、病毒特征以及特异性抗原的差异,可将痘病毒科(Poxviridae)分为两个亚(本文来源于《中国人兽共患病学报》期刊2012年02期)

徐焰,熊鸿燕,郝晓柯,周铁成,徐修礼[6](2007)在《大肠埃希菌宽宿主谱噬菌体生物学特性的比较研究》一文中研究指出目的比较研究1株宿主谱发生突变的宽宿主范围噬菌体与其原始野生型单一宿主谱噬菌体株的生物学特性改变,探讨噬菌体识别特异性机制和将噬菌体作为生物消毒剂,应用于环境污水净化的可行性。方法利用大肠埃希菌285菌株自环境污水中筛选到1株具有宽宿主范围的噬菌体,与野生型噬菌体f2比较观察,分析宿主谱改变对噬菌体的生物学特性的影响。结果两噬菌体电镜下形态均为微球形且棱角不明显,但(噬菌体XY)颗粒偶见短尾,大小形态不均一;噬菌体f2和噬菌体XY的抗血清K值分别为30.1和41.5;噬菌体XY与噬菌体f2的相关度较低(K值比<0.45);结果显示,噬菌体XY较噬菌体f2具有吸附速率高、潜伏期短、裂解量大的特点;两噬菌体均为约6 000 bp的单链RNA噬菌体,但宿主谱改变前后它们的RAPD-PCR及RT-PCR差异有统计学意义;噬菌体XY对环境水样本中的大肠埃希菌杀灭率可达到36.75%~56.28%,而噬菌体f2则为19.19%~35.06%(P<0.01)。结论宽宿主谱噬菌体较噬菌体f2在超微形态、一步生长曲线、抗原性等方面差异均有统计学意义;微生物杀灭效果也明显高于噬菌体f2(P<0.01);核酸分析证实其宿主特异性裂解效应已从基因水平发生了变化。(本文来源于《中华医院感染学杂志》期刊2007年11期)

徐焰[7](2006)在《一株大肠杆菌宽宿主谱噬菌体生物学特性的比较研究》一文中研究指出目的通过比较研究一株宿主谱发生突变的宽宿主范围噬菌体与其原始野生型单一宿主谱噬菌体株的生物学特性改变,探讨噬菌体识别特异性机制和将噬菌体作为生物消毒剂应用于环境污水净化的可行性。方法利用大肠杆菌285菌株自环境污水中筛选到一株具有宽宿主范围的噬菌体;通过对这一宽宿主范围噬菌体与野生型噬菌体f2(噬菌体f2以大肠杆菌285株为专一宿主菌)在电镜超微形态、生长曲线、抗原特性、基因组成、环境样本中微生物的杀灭效应等方面的比较观察,分析宿主谱改变对噬菌体的生物学特性的影响。结果通过对噬菌体f2及宽宿主范围噬菌体株(暂将其命名为噬菌体XY)的生物学特性观察发现,两噬菌体电镜下形态均为微球形且棱角不明显,但噬菌体XY颗粒偶见短尾,大小形态不均一,直径在20-90mm之间;噬菌体f2和噬菌体XY的抗血清K值分别为30.1和41.5;血清中和试验结果显示: 噬菌体XY与噬菌体f2的相关度较低(K值比<0.45);一步生长实验结果显示:噬菌体XY较噬菌体12具有吸附速率高、潜伏期短、裂解量大的特点;核酸分析试验显示:两噬菌体均为约6000 bp的单链RNA噬菌体,但宿主谱改变前后它们的RAPD-PCR及RT- PCR存在明显的差异;环境水样本微生物杀灭试验结果显示:噬菌体XY对环境水样本中的大肠杆菌杀灭率可达到36.75%-56.28%, 而噬菌体f2则为19.19%-35.06%(P=0.000)。结论宽宿主谱噬菌体较大肠杆菌噬菌体f2在超微形态、一步生长曲线、抗原性等方面均存在差异;微生物杀灭效果也明显高于噬菌体f2(P=0.000);核酸分析证实其宿主特异性裂解效应已从基因水平发生了变化。(本文来源于《第五次全国中青年检验医学学术会议论文汇编》期刊2006-06-01)

彭道荣,徐焰,熊鸿燕,张小宁,苏明权[8](2005)在《噬菌体宿主谱改变核酸分析研究》一文中研究指出目的探讨一种高效提取RNA噬菌体核酸的新方法,并通过核酸分析从基因水平了解宿主谱改变对噬菌体核酸的影响。方法采用传统的聚乙二醇(PEG)沉淀蛋白酶消化酸性酚提取法、Tripure提取法以及抗体沉淀盐酸胍一步法3种方法分别提取大肠埃希菌f2噬菌体及其宽宿主谱株的RNA,通过琼脂糖凝胶电泳鉴定其纯度。采用兼并引物逆转录聚合酶链反应(RTPCR)及随机引物随机扩增多态性DNA聚合酶链反应(RAPDPCR)比较分析噬菌体宿主谱改变前后其核酸序列组成的变化。结果抗体沉淀盐酸胍一步法提取的噬菌体核酸具纯度高、条带完整等优点;f2噬菌体及其宽噬株均为6000bp左右的单链RNA噬菌体;两噬菌体基因cDNA扩增出的RAPDDNA片段差异明显,其中26条为可区分的DNA带型;噬菌体f2cDNA在450bp附近出现重复性较好的扩增片段,而其宽噬株cDNA在相同条件下未出现扩增产物。结论抗体沉淀盐酸胍一步法较其他两种RNA病毒核酸提取法具有明显的优势,具有应用价值的新的RNA噬菌体核酸的提取方法;宽宿主谱噬菌体的宿主特异性裂解效应已从基因水平发生了变化。(本文来源于《中华检验医学杂志》期刊2005年08期)

徐焰,熊鸿燕,苏明权,彭道荣,徐修礼[9](2005)在《一株大肠杆菌宽宿主谱噬菌体生物学特性的比较研究》一文中研究指出近年来,噬菌体的抗菌作用受到密切关注。但试图将噬菌体引入实际应用的研究者都明确认识到,噬菌体宿主谱狭窄的特点会影响其应用效果,限制其应用范围。噬菌体作为抗菌制剂的应用前景还有赖于突破其对宿主菌识别和裂解的特异性限制。如果能人工扩展噬菌体的“宿主谱”, 使之成为一种“广谱”裂菌性噬菌体,那么,这种新(本文来源于《第九届西北五省(区)检验医学学术会议论文汇编》期刊2005-08-01)

徐焰,彭道荣,熊鸿燕,张小宁,苏明权[10](2005)在《一株宽宿主谱大肠埃希菌噬菌体的RNA比较分析及其环境微生物杀灭效应观察》一文中研究指出目的通过比较研究一株分离自医院污水的宽宿主范围大肠埃希菌(E.coli)噬菌体与野生型单一宿主谱E.coli噬菌体的核酸序列和微生物杀灭效应等生物学特性的改变探讨噬菌体识别特异性机制和将噬菌体作为生物消毒剂应用于环境污水净化的可行性。方法采用抗体沉淀盐酸胍一步法分别提取单一宿主谱E.coli噬菌体f2株及宽宿主谱E.coli噬菌体株的RNA,通过琼脂糖凝胶电泳鉴定其纯度;采用简并引物逆转录聚合酶链反应(RTPCR)及随机引物随机扩增多态性DNA(RAPD)PCR比较分析噬菌体宿主谱改变时核酸序列组成的变化;通过以上两噬菌体对环境样本中活菌和E.coli的杀灭效果的观察,比较分析宿主谱改变对噬菌体的微生物杀灭效应这一生物学特性的影响。结果噬菌体核酸分析试验证实,f2噬菌体及宽噬噬菌体均为6000bp左右的单链RNA噬菌体。RAPDPCR结果显示,两噬菌体基因cDNA扩增出的RAPDDNA片段有明显的差异,其中26条为可区分的DNA带型。利用简并引物进行的RTPCR反应显示,噬菌体f2cDNA在450bp附近出现重复性较好的扩增片段,而宽噬噬菌体cDNA在相同条件下未出现扩增产物。环境水样本微生物杀灭试验结果显示,宽宿主谱株噬菌体对环境水样本中的E.coli杀灭率为36.75%~56.28%,对水样本中活菌杀灭率为30.84%~47.96%;而噬菌体f2对环境水?(本文来源于《中华流行病学杂志》期刊2005年05期)

宿主谱论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

禽致病性大肠杆菌(APEC)是引起家禽、鸟类等大肠杆菌病的主要的病原体,世界上每年因其导致的经济损失不可估量。近些年来,抗生素的耐药性问题日益严重,其药物残留问题也日益突出,使噬菌体及其制剂作为备选的抗菌方法被人们重新关注。然而,噬菌体相对特异的裂解谱以及有限的基因组信息等大大限制了噬菌体的临床应用。在本次试验中,我们一共分离到了 23株禽源性的大肠杆菌噬菌体,并通过宿主谱测定,筛选出一株较为广谱的噬菌体QL01(41/78),通过对其进行生物学性质试验、基因组测序、比较基因组学分析以及临床上治疗禽大肠杆菌感染的应用研究,为噬菌体广谱机制的探索以及临床应用提供了依据。1禽致病性大肠杆菌噬菌体的分离及生物学性质研究我们通过在南京某些农贸市场采集鸭粪样品,进行噬菌体的分离鉴定。共分离到23株禽致病性大肠杆菌噬菌体,并通过宿主谱测定,筛选出一株较为广谱的噬菌体QL01,可以裂解78株禽致病性大肠杆菌中的41株(52.6%)和1株新生儿脑膜炎大肠杆菌RS218。通过在透射电镜下对其进行形态观察,发现QL01的头部为二十面体结构(大小约为112×78 nm),具有收缩性的尾部(大约为102×20 nm)和6根尾丝。形态显示QL01属于有尾噬菌体目(Caudovirales)的肌尾噬菌体科(Myoviridae family),是一株典型的T4-like噬菌体。用固体培养法进行增殖,得到QL01的最高效价为5.08×108PFU/mL,温度敏感性试验表明QL01对高温较为敏感,其最佳感染复数为1。2噬菌体基因组测序及比较基因组学分析通过Illumina MiSeq对QL01进行全基因组测序,结果显示,噬菌体QL01基因组由一条全长为170,527 bp的双链DNA构成,GC含量为39.6%,有275个可能的ORF,其基因组与噬菌体Bp7,JS98等同源性较高。其中,分别编码IP9和IP8的ORF142和ORF143,在很多T4-like噬菌体中并不常见,仅存在少数噬菌体中。其IP基因数量和种类与低温噬菌体vB_EcoM_VR5相同,表明可能两者间发生了基因水平转移现象。IP基因分布图表明,两株噬菌体IP8和IP9附近基因排布类似,而IP7和IP3附近发生了重排。3 QL01治疗禽大肠杆菌感染的初探为研究噬菌体QL01在临床上对禽大肠杆菌感染的治疗效果,用禽致病性大肠杆菌菌株XM建立感染模型,首先进行半数致死量的测定。通过计算得到其半数致死量为2.12×104CFU。通过反复试验,将感染剂量定为3.6×104CFU左右。人工感染一周龄的雏鸭,并通过不同给药方式进行噬菌体给药,结果表明采用肌肉注射给药组的治疗效果较好。将90只雏鸭随机分组,感染大肠杆菌后进行肌肉注射给药,观察噬菌体的治疗效果。结果显示,噬菌体给药组平均存活率为90%,未给药组平均存活率为63.33%,给药组死亡率明显低于未给药组(P<0.05),而且给药组与阴性对照组之间并无显着差异(P>0.05)。由此可见,噬菌体QL01可以在一定程度上减轻细菌的感染,降低感染雏鸭的死亡率,为临床上应用噬菌体治疗禽致病性大肠杆菌感染提供了依据。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

宿主谱论文参考文献

[1].陈绵绵,张蕾,虞莉,徐军田,姚火春.T4-like噬菌体gp37的改变可以拓宽宿主谱[C].第五届全国人畜共患病学术研讨会论文摘要集.2017

[2].徐军田.宽宿主谱大肠杆菌T4噬菌体的分离、基因组学分析及临床应用研究[D].南京农业大学.2016

[3].姜珊,袁婷,李德志,王依帆,陆承平.1株可裂解肠道内和肠道外大肠杆菌的宽宿主谱噬菌体的分离与特性分析[J].畜牧与兽医.2015

[4].周艳,包红朵,张辉,张莉莉,王冉.一株宽宿主谱裂解性大肠杆菌噬菌体的进化分析[J].中国动物传染病学报.2014

[5].周涛,贾怀杰,何小兵,房永祥,景志忠.人兽共患痘病毒病流行现状及其宿主谱研究进展[J].中国人兽共患病学报.2012

[6].徐焰,熊鸿燕,郝晓柯,周铁成,徐修礼.大肠埃希菌宽宿主谱噬菌体生物学特性的比较研究[J].中华医院感染学杂志.2007

[7].徐焰.一株大肠杆菌宽宿主谱噬菌体生物学特性的比较研究[C].第五次全国中青年检验医学学术会议论文汇编.2006

[8].彭道荣,徐焰,熊鸿燕,张小宁,苏明权.噬菌体宿主谱改变核酸分析研究[J].中华检验医学杂志.2005

[9].徐焰,熊鸿燕,苏明权,彭道荣,徐修礼.一株大肠杆菌宽宿主谱噬菌体生物学特性的比较研究[C].第九届西北五省(区)检验医学学术会议论文汇编.2005

[10].徐焰,彭道荣,熊鸿燕,张小宁,苏明权.一株宽宿主谱大肠埃希菌噬菌体的RNA比较分析及其环境微生物杀灭效应观察[J].中华流行病学杂志.2005

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