虎源副流感病毒5型的分离鉴定及全基因序列分析

论文摘要

本研究旨在了解虎源副流感病毒5型（parainfluenza virus 5,PIV5）的遗传变异情况,阐明其基因组与遗传进化等特征。从广东省某动物园疑似虎PIV5感染的病料处理后接种Vero细胞并通过一系列的鉴定,将分离的毒株命名为HMZ。根据GenBank中PIV5基因序列,设计包含全长的12对特异性引物,并扩增其全基因组。将扩增产物克隆到pMD-18T载体上,对鉴定为阳性的重组质粒送检测序,并对基因全序列进行同源性分析及遗传进化分析。结果显示,HMZ与各病毒株全基因序列同源性为97.2%～99.8%。其中与1168-1 （KC237064.1）、ZJQ-221 （KX100034.1）以及Mammalian rubulavirus 5 （KY685075.1）亲缘性最高,为99.8%;而与D277的亲缘性最低,为97.2%。全基因系统进化树分析结果表明,HMZ与ZJQ-221、Mammalian rubulavirus 5属于同一分支。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 病料
•   1.2 主要试剂
•   1.3 引物设计
•   1.4 病毒的分离培养
•   1.5 病毒鉴定
•     1.5.1 红细胞吸附试验
•     1.5.2 RT-PCR鉴定
•     1.5.3 病毒的电镜观察
•   1.6 病毒全基因的扩增及克隆
•   1.7 DNA序列的测定和分析
• 2 结果与分析
•   2.1 病毒分离
•   2.2 红细胞吸附试验
•   2.3 RT-PCR鉴定
•   2.4 透射电镜观察
•   2.5 全基因序列扩增
•   2.6 PIV5全基因序列分析
•     2.6.1 基因组序列测定情况
•     2.6.2 基因组序列分析
•   2.7 PIV5全基因系统进化树的建立
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陈安妮,李冰,霍礼侠,吴佳骏,邹舒展,陈武,罗满林

关键词: 病毒分离鉴定,基因组测序,序列分析

来源: 中国兽医科学 2019年03期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 华南农业大学兽医学院,广州动物园

基金: 国家自然科学基金项目(31872497),国家重点研发计划项目(2017YFF0210202),广东省农业攻关项目(粤科规财字[2014]116号)

分类号: S852.65

DOI: 10.16656/j.issn.1673-4696.2019.0039

页码: 309-316

总页数: 8

文件大小: 2012K

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