茅苍术两个DXR基因(AlDXR)的克隆与分析

茅苍术两个DXR基因(AlDXR)的克隆与分析

论文摘要

茅苍术萜类化合物生物合成关键酶1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原酶异构化酶基因序列(AlDXR)尚未阐明,本研究克隆其基因序列并分析其序列特征,以期为阐明茅苍术萜类化合物生物合成分子机制提供帮助。从已获得的茅苍术转录组序列中筛选出DXR基因,克隆其全长cDNA序列,然后分析基因编码氨基酸序列特征、蛋白亚细胞定位、蛋白结构预测、系统发育等。成功筛选并克隆出两条全长cDNA序列分别为1 431 bp和1 422 bp的DXR基因(GenBank登录号分别为MG859908和MG859909),分别编码476个和473个氨基酸,系统发育分析表明二者分别与橡胶草和野菊花具有较高的同源性。本研究获得两个茅苍术DXR基因的全长cDNA序列,并对其进行初步生物信息学分析,为进一步阐明该基因在茅苍术萜类化合物生物合成中的功能提供指导。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 总RNA的提取及检测
  •   1.2 DXR基因全长的扩增
  •   1.3 阳性克隆的筛选及测序
  •   1.4 序列分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 植物材料
  •   3.2 总RNA提取及检测
  •   3.3 DXR全长cDNA的获得
  •   3.4 生物信息学分析
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 陈丽娜,万倩芸,邓娟,明淑芳,龚玲,余坤

    关键词: 茅苍术,基因,序列分析,萜类化合物

    来源: 分子植物育种 2019年13期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 湖北中医药大学药学院

    基金: 国家自然科学基金(31670341,31300277),湖北省技术创新专项(2018ACA124)共同资助

    分类号: S567.239;Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.004249

    页码: 4249-4256

    总页数: 8

    文件大小: 2696K

    下载量: 196

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