罗伊氏乳杆菌肠道分离株的遗传多样性研究

论文摘要

动物体内定殖着丰富且多样的细菌,其对宿主的健康发挥着举足轻重的作用。罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)是存在于动物肠道中的益生菌,是研究肠道菌群与宿主进化关系的模式菌种。【目的】以下载自NCBI的分离自猪、家禽类、人类、啮齿类动物的116株L.reuteri和分离自内蒙古锡林郭勒牛、羊和马肠道中的16株L. reuteri为研究对象,解析L. reuteri不同分离株的遗传多样性和宿主特异性,为L. reuteri的开发利用提供理论依据。【方法】利用MLST技术,以ddl、pkt、leu S、gyr B、dlt A、rpo A、rec A共7个看家基因为研究靶点,对L.reuteri分离株遗传多样性进行研究,推演分离株与宿主生境的进化关系。【结果】132株L. reuteri共划分为63个序列型,6个克隆复合体。等位基因序列重组分析发现,在L.reuteri的进化中发生了个别的重组事件,eBURST、MSTree分析表明不同分离源的L. reuteri分离株经历了不同的进化过程,系统发育分析表明132株L. reuteri来自5个Clusters且与分离源表现出较强的相关性。【结论】本研究利用MLST技术完成了132株L. reuteri肠道分离株的遗传多样性分析,利用MSTree、系统发育等群体结构分析,发现不同分离源菌株有着高度的宿主特异性,表明L. reuteri为适应不同生存环境经历了不同的进化过程。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 菌株选取
•   1.2 试验菌株所用材料和方法
•     1.2.1 菌株的活化与培养：
•     1.2.2 菌株DNA提取：
•     1.2.3 看家基因引物设计：
•     1.2.4 看家基因PCR扩增和测序：
•   1.3 数据分析
• 2 结果和讨论
•   2.1 MLST分型研究
•   2.2 等位基因序列重组分析
•   2.3 eBURST结果分析
•   2.4 不同序列最小生成树分析
•   2.5 L.reuteri种群结构分析
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 余中节,赵洁,宋宇琴,孙志宏

关键词: 罗伊氏乳杆菌,多位点序列分型技术,肠道,宿主特异性

来源: 微生物学报 2019年09期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业农村部奶制品加工重点实验室内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室

基金: 国家自然科学基金(31622043),内蒙古自然科学基金(2016JQ04),内蒙古农业大学杰出青年科学基金(2017XJQ-2)~~

分类号: S852.6

DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20180376

页码: 1786-1797

总页数: 12

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