华北地区中华蒙潮虫(甲壳动物亚门:等足目)种群遗传多样性研究

论文摘要

中华蒙潮虫Mongoloniscus sinensis（Dollfus,1901）隶属于甲壳动物亚门Crustacea等足目Isopoda潮虫亚目Oniscidea,中国特有种。为了探究中华蒙潮虫的种群遗传分化和系统进化关系,采用PCR对采自华北地区10个地理种群89只个体线粒体2个基因COⅠ和ND5进行联合分析。结果表明:1)中华蒙潮虫COⅠ部分基因长604 bp,ND5部分基因长615 bp,拼接序列长1 219 bp,T、C、A和G含量分别为41.0%、11.2%、30.8%和17.0%,具有显著的A+T偏倚;变异位点503个（占总核苷酸序列的41.3%）,序列间的转换/颠换比值为2.8。2)89只个体共45种单倍型,单倍型多样性0.964,核苷酸多样性0.005 6,整体遗传多样性水平中等;单倍型H1、H15、H16、H21、H41为2～3个种群共享单倍型。3)联合基因（COⅠ+ND5）系统发育树表明,最早出现的是华北以北地区（山西大同、河北石家庄）,最晚分化出的是华北以南地区（山西临汾、陕西西安未央区、河南新乡）,演化路线为从北向南,个别种群单倍型未按地理来源形成明显的簇群。4)平均遗传分化指数为0.513,基因流为0.24;分子变异分析结果表明,种群的变异与分化主要来自种群内部,错配分布呈多峰,结合中性检验（Tajima’s D=-1.429;Fu’s Fs=6.499）,发现中华蒙潮虫近期未经历扩张,但种群内部分化显著,增长平稳。本研究首次基于线粒体多基因联合分析了中华蒙潮虫种群遗传多样性。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 样品采集
•   1.2 DNA的提取及测序
•   1.3 数据分析
• 2 结果与分析
•   2.1 序列特征
•   2.2 单倍型多样性和遗传多样性
•   2.3 种群间的遗传距离和遗传分化
•   2.4 种群动态分析
•   2.5 分子系统发育分析
•   2.6 分子变异分析
•   2.7 单倍型网络图分析
• 3 讨论
•   3.1 种群遗传多样性
•   3.2 种群遗传结构
•   3.3 系统发育分析
• 4 结语

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张瑞,王明晓,安建梅

关键词: 中华蒙潮虫,遗传多样性,基因,华北地区

来源: 四川动物 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 山西师范大学生命科学学院

基金: 国家自然科学基金项目(31471970)

分类号: Q953

页码: 139-148

总页数: 10

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