肠道病毒71型3D蛋白潜在毒力位点的序列分析

论文摘要

目的分析不同临床严重程度感染者肠道病毒71型的3D蛋白氨基酸序列,了解潜在毒力相关变异位点。方法从NCBI数据库下载不同临床严重程度C4亚型EV71感染者3D区核苷酸序列;对推导的氨基酸序列进行比对和分析,查找不同临床严重程度病毒感染者在3D蛋白存在差异有统计学意义的氨基酸位点。结果共下载序列113株,其中来自于重症及死亡患者序列共67株、轻症患者序列46株。分析显示病毒3D区的256位和370位氨基酸残基,在不同临床严重病例中的分布差异有统计学意义,其中部分重症患者在256位为非异亮氨酸,部分轻症患者在370位为非甘氨酸。结论 C4亚型EV71病毒的3D区256位和370位氨基酸的变异,可能与病毒毒力相关。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料来源
•   1.2 序列整理
•   1.3 3D蛋白的潜在毒力位点分析
• 2 结 果
•   2.1 基因相似性及种系进化分析
•   2.2 氨基酸位点分析
• 3 讨 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 朱颖,陈炜,翁育伟

关键词: 肠道病毒型,蛋白,基因突变,病毒毒力,序列分析

来源: 海峡预防医学杂志 2019年02期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学,基础医学

单位: 福建省疾病预防控制中心(福建省人兽共患病重点实验室)

基金: 福建省医学创新课题(No.2016-CX-14),福建省自然科学基金(No.2016J01350)

分类号: R373.2

页码: 4-6

总页数: 3

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