大豆与蒺藜苜蓿Kunitz蛋白酶抑制剂的全基因组分析

论文摘要

Kunitz蛋白酶抑制剂(Kunitz protease inhibitor,KPI)基因是植物中具有抗逆功能的基因家族之一。为研究KPI基因家族的进化与功能,对大豆和蒺藜苜蓿的KPI基因家族成员进行比较基因组学分析。利用生物信息学方法鉴定大豆与蒺藜苜蓿的KPI基因家族成员,并对其染色体定位进行分析,确定了大豆与蒺藜苜蓿KPI基因成员的直系同源与旁系同源基因及保守基序,并对大豆与蒺藜苜蓿不同组织及不同胁迫条件下KPI基因家族成员的表达情况进行了分析。结果显示,大豆、蒺藜苜蓿各含有48、46个KPI基因成员,它们在染色体上分布不均匀,并存在串联重复而形成的基因簇;大豆与蒺藜苜蓿有11对直系同源基因,二者各有14对旁系同源基因;大豆和蒺藜苜蓿均含有3个结构基序,靠近N末端的2个结构基序为大豆与蒺藜苜蓿共有,而靠近C末端的第3个结构基序位置有较大差异,可以作为区分大豆与蒺藜苜蓿KPI成员的一段特征性标记;EST(Express sequence tags,表达序列标签)分析结果表明,KPI基因家族成员主要在根、种子中表达;干旱与盐胁迫条件下,KPI成员的数量增加,推测KPI参与了大豆与蒺藜苜蓿对干旱与盐胁迫的逆境响应过程。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
•     1.2.1 序列分析
•     1.2.2 KPI基因在染色体上的定位分析
•     1.2.3 直系同源与旁系同源基因筛选
•     1.2.4 KPI基因编码蛋白质的基序预测分析
•     1.2.5 KPI基因表达信息分析
• 2 结果与分析
•   2.1 大豆与蒺藜苜蓿KPI基因的鉴定结果
•   2.2 大豆与蒺藜苜蓿KPI基因的染色体定位
•   2.3 大豆与蒺藜苜蓿KPI基因的同源分析
•   2.4 大豆与蒺藜苜蓿KPI结构基序分析
•   2.5 大豆与蒺藜苜蓿KPI基因的EST表达信息
• 3 结论与讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 缑绪卓,严子成,况玉,曹锐,陈巧灵,杨雅丽,周嘉裕,廖海

关键词: 蛋白酶抑制剂,大豆,蒺藜苜蓿,基因组,生物信息学

来源: 河南农业科学 2019年07期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 西南交通大学生命科学与工程学院

基金: 国家自然科学基金项目(31500276),四川省应用基础研究项目(2017JY0222),成都市科技技术研发项目(2016-HM01-00260-SF),四川省重点研发项目(2018SZ0061),国家级大学生创新创业训练计划资助项目(201810613080),西南交通大学个性化实验项目(GX201812088)

分类号: S565.1;Q943.2

DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.07.006

页码: 38-47

总页数: 10

文件大小: 3253K

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